ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aegilops speltoides isolate SPE0661 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022135	CAG	4	684	695	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331018
2	NC_022135	AAT	4	4465	4476	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022135	GAA	4	8170	8181	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_022135	TTG	4	10523	10533	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	53331018
5	NC_022135	AAT	4	13837	13848	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_022135	ATA	4	18861	18871	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022135	AGA	4	20283	20294	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331019
8	NC_022135	AAC	4	22939	22950	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53331019
9	NC_022135	AAT	5	24627	24641	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53331019
10	NC_022135	ATT	4	29841	29853	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_022135	GTT	5	31527	31541	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	53331019
12	NC_022135	TGC	4	32250	32261	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331019
13	NC_022135	CTA	4	39916	39927	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53331020
14	NC_022135	AGT	4	42865	42875	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53331020
15	NC_022135	AAT	4	44939	44949	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022135	ATA	4	47133	47144	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022135	TAT	5	47476	47491	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_022135	CTT	4	48006	48017	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
19	NC_022135	TAA	6	50459	50475	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_022135	GAA	4	57844	57854	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022135	TTC	4	60066	60077	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331021
22	NC_022135	TTA	4	62218	62229	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_022135	TCT	4	63336	63348	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022135	TTC	5	64099	64113	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
25	NC_022135	TAA	4	65886	65897	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_022135	AGA	4	73208	73219	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_022135	TAT	5	74265	74278	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_022135	CTT	5	79403	79416	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	53331024
29	NC_022135	TTC	4	80486	80496	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331024
30	NC_022135	TAC	4	88565	88576	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
31	NC_022135	TAA	4	103355	103365	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331024
32	NC_022135	CAA	4	107717	107727	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	53331024

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aegilops speltoides isolate SPE0661 chloroplast