ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Sasakia funebris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022134	TTTAT	3	128	142	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_022134	AT	19	223	259	37	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022134	ATTT	4	269	284	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_022134	AATT	3	824	834	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320625
5	NC_022134	TTTTA	4	916	934	19	20 %	80 %	0 %	0 %	10 %	53320625
6	NC_022134	TTTAAT	3	966	983	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	53320625
7	NC_022134	ATTA	4	1064	1078	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320625
8	NC_022134	TAT	4	1232	1243	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320625
9	NC_022134	T	14	1286	1299	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320625
10	NC_022134	ATT	4	1478	1488	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022134	AATT	3	1998	2008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320625
12	NC_022134	TAT	4	2063	2074	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320625
13	NC_022134	AGG	4	2151	2162	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	53320625
14	NC_022134	GAAA	3	2271	2281	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53320625
15	NC_022134	TTTA	4	2512	2527	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	53320625
16	NC_022134	AAT	4	2877	2888	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320625
17	NC_022134	TAT	5	2886	2899	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320625
18	NC_022134	AATT	3	3299	3311	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320625
19	NC_022134	AAT	4	3471	3482	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320625
20	NC_022134	AATT	3	3752	3762	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320625
21	NC_022134	ATT	4	3981	3991	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320625
22	NC_022134	AAAAAT	3	4004	4022	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	53320625
23	NC_022134	TAATT	3	4092	4105	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	53320625
24	NC_022134	ATCATT	4	4359	4382	24	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	8 %	53320625
25	NC_022134	AATT	3	4855	4866	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320625
26	NC_022134	ATT	4	5227	5238	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320625
27	NC_022134	T	13	5866	5878	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320626
28	NC_022134	TAAA	3	6382	6393	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320626
29	NC_022134	AATT	3	6400	6411	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320626
30	NC_022134	TAT	4	6689	6700	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320626
31	NC_022134	AAAT	3	6928	6939	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320626
32	NC_022134	ATT	4	7094	7106	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320626
33	NC_022134	TTA	4	7207	7218	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320626
34	NC_022134	ATA	5	7312	7326	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	53320626
35	NC_022134	AAATAT	3	7545	7563	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	53320626
36	NC_022134	ATTC	3	7580	7590	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	53320626
37	NC_022134	ATAA	3	7676	7686	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53320626
38	NC_022134	TAA	4	7750	7762	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320626
39	NC_022134	TAT	4	7967	7977	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320626
40	NC_022134	TAA	4	8009	8019	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320626
41	NC_022134	AAAAAT	3	8022	8039	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	53320626
42	NC_022134	ATT	5	8313	8327	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53320626
43	NC_022134	AT	6	8507	8517	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53320626
44	NC_022134	TAAATA	3	8918	8934	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	53320626
45	NC_022134	TAAA	3	8953	8964	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53320626
46	NC_022134	TAT	4	9446	9457	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53320626
47	NC_022134	AT	7	9587	9601	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320626
48	NC_022134	ATT	4	9620	9630	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320626
49	NC_022134	TA	13	9760	9787	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53320626
50	NC_022134	ATT	4	9889	9900	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_022134	TAT	4	10019	10029	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320626
52	NC_022134	TTCTTA	3	10067	10085	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	53320626
53	NC_022134	TTTA	3	10109	10120	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53320626
54	NC_022134	ATTT	4	10368	10383	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	53320626
55	NC_022134	T	14	10727	10740	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53320626
56	NC_022134	TAT	5	10811	10824	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53320626
57	NC_022134	ATTT	3	11008	11018	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320626
58	NC_022134	ATTT	3	11050	11060	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53320626
59	NC_022134	TAT	4	11456	11466	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53320626
60	NC_022134	TAA	4	11680	11690	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53320626
61	NC_022134	A	12	11811	11822	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	53320626
62	NC_022134	TTAA	3	12110	12121	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53320626
63	NC_022134	TAA	4	12210	12222	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53320626
64	NC_022134	ATA	4	12310	12321	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53320626
65	NC_022134	TA	8	12609	12623	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53320626
66	NC_022134	TA	6	12625	12636	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_022134	AT	8	12640	12657	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_022134	ATA	6	12696	12713	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
69	NC_022134	AAATT	3	12717	12731	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_022134	T	14	12906	12919	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_022134	ATTTT	3	13057	13071	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_022134	ATTA	3	13072	13083	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_022134	TTTTA	3	13136	13151	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_022134	TTTAAT	3	13379	13395	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
75	NC_022134	TTTA	3	13449	13460	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_022134	TAAT	6	13637	13660	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_022134	AAATT	3	14030	14043	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_022134	ATTT	3	14321	14331	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_022134	TAATT	3	14657	14671	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_022134	CTTA	3	14729	14740	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
81	NC_022134	ATT	4	14770	14782	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
82	NC_022134	TAAA	3	14783	14794	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_022134	T	24	14886	14909	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_022134	ATA	4	15002	15012	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_022134	ATT	4	15037	15048	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_022134	ATTA	3	15060	15071	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_022134	AT	13	15135	15159	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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