ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aegilops tauschii chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022133	CAG	4	684	695	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331008
2	NC_022133	AAT	4	4462	4473	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022133	GAA	4	8199	8210	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_022133	TTG	4	10576	10586	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	53331009
5	NC_022133	TTA	5	13587	13600	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
6	NC_022133	AAT	4	13897	13908	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_022133	ATA	4	18896	18906	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022133	AGA	4	20318	20329	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331009
9	NC_022133	AAC	4	22974	22985	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	53331009
10	NC_022133	AAT	5	24662	24676	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	53331009
11	NC_022133	GTT	5	31384	31398	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	53331009
12	NC_022133	TGC	4	32111	32122	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331010
13	NC_022133	CTA	4	39767	39778	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53331010
14	NC_022133	AGT	4	42692	42702	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53331010
15	NC_022133	ATA	4	46955	46966	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_022133	TAT	5	47290	47305	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_022133	TAA	6	50271	50287	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_022133	GAA	4	57704	57714	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_022133	TTC	4	59926	59937	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331011
20	NC_022133	TTA	4	62529	62540	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022133	TCT	4	63630	63642	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
22	NC_022133	TCT	4	63647	63659	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_022133	TTC	5	64410	64424	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_022133	TAA	4	66159	66170	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_022133	AGA	4	73481	73492	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331012
26	NC_022133	TAT	5	74538	74551	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	53331012
27	NC_022133	CTT	5	79680	79693	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	53331012
28	NC_022133	TTC	4	80795	80805	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	53331012
29	NC_022133	TAC	4	89159	89170	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53331012
30	NC_022133	TAA	4	103782	103792	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331015
31	NC_022133	CAA	4	108186	108196	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	53331015

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Aegilops tauschii chloroplast