ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Borung plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022100	TA	8	2714	2728	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_022100	TA	6	3394	3405	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022100	TA	7	3415	3427	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_022100	AT	6	8394	8407	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_022100	AT	8	13299	13314	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_022100	AT	6	18768	18778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022100	CT	6	20209	20220	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
8	NC_022100	TC	6	25637	25648	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_022100	TA	6	38884	38894	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
10	NC_022100	TA	6	38920	38930	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
11	NC_022100	AT	6	42256	42266	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
12	NC_022100	TA	6	45407	45418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331000
13	NC_022100	AT	7	45421	45434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53331000
14	NC_022100	AT	6	45687	45697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
15	NC_022100	TA	6	56869	56880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331000
16	NC_022100	TA	6	58855	58865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_022100	TA	6	59952	59964	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
18	NC_022100	TA	8	60096	60110	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_022100	AT	6	62144	62154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_022100	TA	6	64287	64297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331003
21	NC_022100	AT	6	66547	66557	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_022100	TA	6	69706	69717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_022100	TA	7	69819	69831	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_022100	AT	8	75883	75898	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_022100	AT	7	77984	77997	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_022100	AT	6	89287	89297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331004
27	NC_022100	TA	6	94273	94283	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_022100	TA	6	94668	94678	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_022100	TA	6	97436	97446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331005
30	NC_022100	TA	6	98733	98744	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_022100	AT	8	99450	99465	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
32	NC_022100	TA	8	99495	99509	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_022100	TG	6	103853	103863	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	53331005
34	NC_022100	AT	7	106146	106158	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53331005
35	NC_022100	AT	6	106486	106497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331005
36	NC_022100	TA	8	109774	109789	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
37	NC_022100	AT	6	113556	113566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_022100	AT	6	120062	120073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_022100	TA	7	120088	120100	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_022100	TA	6	121756	121767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Borung plastid