ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Borung plastid

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022100	ATT	4	919	930	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53330999
2	NC_022100	T	14	967	980	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53330999
3	NC_022100	AAG	4	1576	1587	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53330999
4	NC_022100	TTA	4	2651	2661	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_022100	ATTA	4	2668	2683	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022100	TA	8	2714	2728	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
7	NC_022100	TAA	4	2743	2755	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_022100	ATA	4	2765	2777	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_022100	ATTT	3	2846	2857	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_022100	CTAT	3	2950	2960	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
11	NC_022100	GAAA	3	3009	3020	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_022100	TAAGA	3	3029	3042	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_022100	TA	6	3394	3405	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_022100	TA	7	3415	3427	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_022100	GAA	4	3730	3740	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_022100	TTTA	3	5012	5023	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_022100	AATA	5	5227	5245	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	53330999
18	NC_022100	ATGA	3	6987	6998	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_022100	A	16	7654	7669	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_022100	A	12	8242	8253	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_022100	T	13	8318	8330	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_022100	AT	6	8394	8407	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_022100	TATT	3	8474	8485	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_022100	AAT	4	8500	8511	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_022100	TTC	5	9478	9492	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	53330999
26	NC_022100	AAAT	3	9851	9862	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53330999
27	NC_022100	ATGAAT	3	10076	10093	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	53330999
28	NC_022100	TCT	4	10141	10152	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53330999
29	NC_022100	TATT	3	10774	10786	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53330999
30	NC_022100	ATTT	3	12741	12752	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53331000
31	NC_022100	TCT	4	12931	12942	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331000
32	NC_022100	T	13	12939	12951	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53331000
33	NC_022100	ATTT	4	13086	13101	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_022100	T	13	13095	13107	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_022100	TAT	5	13119	13132	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
36	NC_022100	A	13	13233	13245	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
37	NC_022100	AT	8	13299	13314	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_022100	TTATAT	3	13315	13332	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_022100	GTTT	3	13548	13559	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	53331000
40	NC_022100	ATTT	3	13600	13610	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53331000
41	NC_022100	CTTT	3	13781	13792	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	53331000
42	NC_022100	CTT	4	14670	14681	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331000
43	NC_022100	AAGA	3	14962	14973	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331000
44	NC_022100	T	15	15195	15209	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	53331000
45	NC_022100	T	18	15996	16013	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
46	NC_022100	T	23	16939	16961	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	53331000
47	NC_022100	CTT	4	17817	17828	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331000
48	NC_022100	AT	6	18768	18778	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_022100	TATT	4	18828	18842	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_022100	TATT	4	19115	19129	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_022100	TGATA	4	19178	19197	20	40 %	40 %	20 %	0 %	10 %	Non-Coding
52	NC_022100	TTTA	3	19252	19262	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_022100	CT	6	20209	20220	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
54	NC_022100	CTTA	3	20928	20938	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
55	NC_022100	TCTA	3	23848	23858	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
56	NC_022100	CCTT	3	24994	25004	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
57	NC_022100	TC	6	25637	25648	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
58	NC_022100	AACC	3	25857	25868	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
59	NC_022100	TAT	4	28553	28566	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_022100	AGA	4	28918	28929	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_022100	AAT	5	28949	28963	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_022100	TCT	4	31548	31560	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	53331000
63	NC_022100	TATT	3	34671	34683	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	53331000
64	NC_022100	ATC	8	35080	35103	24	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	4 %	53331000
65	NC_022100	ATCA	3	35638	35650	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	53331000
66	NC_022100	ACC	4	35827	35837	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	53331000
67	NC_022100	AAG	4	36088	36099	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331000
68	NC_022100	CTT	8	36985	37007	23	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	53331000
69	NC_022100	TTTC	3	37009	37019	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	53331000
70	NC_022100	AAAG	3	37267	37277	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	53331000
71	NC_022100	AAAG	3	37315	37326	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331000
72	NC_022100	AAAG	3	37360	37371	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331000
73	NC_022100	ATTG	3	37970	37981	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	53331000
74	NC_022100	CTT	4	38262	38274	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	53331000
75	NC_022100	TA	6	38884	38894	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
76	NC_022100	TA	6	38920	38930	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
77	NC_022100	ATTG	3	38946	38956	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53331000
78	NC_022100	ATTT	3	39376	39387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	53331000
79	NC_022100	ATC	4	39561	39571	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53331000
80	NC_022100	ATCA	3	40394	40405	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	53331000
81	NC_022100	TGG	4	41328	41339	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	53331000
82	NC_022100	GAA	5	41399	41413	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	53331000
83	NC_022100	TTTA	3	41570	41580	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	53331000
84	NC_022100	T	12	42169	42180	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
85	NC_022100	AT	6	42256	42266	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
86	NC_022100	ATTG	3	42918	42928	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	53331000
87	NC_022100	GAAA	4	43380	43395	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	53331000
88	NC_022100	TTA	4	43612	43623	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331000
89	NC_022100	A	15	43890	43904	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	53331000
90	NC_022100	ATAACC	3	44188	44206	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	10 %	53331000
91	NC_022100	T	15	44658	44672	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
92	NC_022100	GAAA	3	44710	44721	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331000
93	NC_022100	TTG	4	44842	44853	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	53331000
94	NC_022100	ATA	4	44952	44962	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	53331000
95	NC_022100	ATG	4	44965	44976	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53331000
96	NC_022100	ATTA	3	45329	45341	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53331000
97	NC_022100	ATA	4	45360	45373	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	53331000
98	NC_022100	A	18	45378	45395	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	53331000
99	NC_022100	TA	6	45407	45418	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331000
100	NC_022100	AT	7	45421	45434	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53331000
101	NC_022100	A	12	45490	45501	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	53331000
102	NC_022100	TCAT	3	45560	45571	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	53331000
103	NC_022100	TAT	4	45665	45675	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331000
104	NC_022100	AT	6	45687	45697	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331000
105	NC_022100	A	24	45709	45732	24	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	53331000
106	NC_022100	A	13	46771	46783	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	53331000
107	NC_022100	AGA	4	48243	48254	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	53331000
108	NC_022100	T	13	50141	50153	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53331000
109	NC_022100	T	13	51110	51122	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	53331000
110	NC_022100	T	12	51272	51283	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
111	NC_022100	AAGAT	3	51450	51463	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	53331000
112	NC_022100	T	14	51898	51911	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
113	NC_022100	CAA	4	53207	53217	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	53331000
114	NC_022100	TTTA	3	54273	54284	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53331000
115	NC_022100	TATT	3	54289	54300	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	53331000
116	NC_022100	AGAT	3	54382	54394	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	53331000
117	NC_022100	ATT	4	54880	54891	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331000
118	NC_022100	ATT	4	55176	55186	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331000
119	NC_022100	A	12	55968	55979	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	53331000
120	NC_022100	TGA	4	56310	56321	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	53331000
121	NC_022100	AAAT	3	56482	56493	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	53331000
122	NC_022100	ACT	4	56561	56571	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	53331000
123	NC_022100	TA	6	56869	56880	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331000
124	NC_022100	GAAA	4	57672	57687	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
125	NC_022100	TTC	4	58196	58207	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
126	NC_022100	A	18	58265	58282	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_022100	TATT	4	58343	58358	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	53331002
128	NC_022100	GTT	4	58539	58549	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	53331002
129	NC_022100	TA	6	58855	58865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_022100	GAA	4	59185	59196	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_022100	T	12	59525	59536	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_022100	A	14	59560	59573	14	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
133	NC_022100	ATA	4	59820	59832	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_022100	TA	6	59952	59964	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_022100	TTA	5	59980	59993	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_022100	TA	8	60096	60110	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
137	NC_022100	ATTT	3	61304	61315	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_022100	TAA	4	61316	61328	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
139	NC_022100	AT	6	62144	62154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_022100	T	15	62604	62618	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
141	NC_022100	ATT	4	62871	62882	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
142	NC_022100	TTAAG	3	62886	62899	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
143	NC_022100	ATT	4	63756	63767	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	53331003
144	NC_022100	TA	6	64287	64297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331003
145	NC_022100	CAAA	3	64530	64541	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
146	NC_022100	TTCA	3	64570	64581	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53331003
147	NC_022100	T	17	66280	66296	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
148	NC_022100	AT	6	66547	66557	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
149	NC_022100	ATA	4	66920	66931	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
150	NC_022100	TTTGA	3	67255	67268	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	53331003
151	NC_022100	ATC	4	68021	68032	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	0 %	53331003
152	NC_022100	ATC	5	68261	68275	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	53331003
153	NC_022100	ATC	4	68369	68380	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	53331003
154	NC_022100	TCC	4	68499	68510	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	53331003
155	NC_022100	TA	6	69706	69717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
156	NC_022100	ATA	4	69792	69802	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
157	NC_022100	TA	7	69819	69831	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
158	NC_022100	ATA	4	69843	69855	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
159	NC_022100	CAT	4	70272	70282	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
160	NC_022100	T	13	70514	70526	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
161	NC_022100	A	14	70762	70775	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
162	NC_022100	T	12	71033	71044	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
163	NC_022100	ATTC	3	72089	72099	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
164	NC_022100	GAAAAG	4	72274	72297	24	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
165	NC_022100	AATT	4	72556	72570	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53331004
166	NC_022100	CTGT	3	73574	73585	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	53331004
167	NC_022100	AATTTG	3	74108	74125	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
168	NC_022100	A	14	74141	74154	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
169	NC_022100	T	15	74837	74851	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	53331004
170	NC_022100	TTTAG	3	75166	75179	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	53331004
171	NC_022100	TAA	5	75545	75560	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
172	NC_022100	AT	8	75883	75898	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
173	NC_022100	CAG	4	76186	76197	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331004
174	NC_022100	TAA	4	76258	76268	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
175	NC_022100	TTCA	3	76296	76306	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
176	NC_022100	TAG	4	76513	76523	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
177	NC_022100	TGAA	3	76879	76890	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
178	NC_022100	TAAT	5	77086	77106	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
179	NC_022100	CAAAAT	3	77149	77167	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
180	NC_022100	AT	7	77984	77997	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
181	NC_022100	T	12	78659	78670	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	53331004
182	NC_022100	T	12	79221	79232	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	53331004
183	NC_022100	TCAA	3	79340	79351	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	53331004
184	NC_022100	AAT	4	80102	80113	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331004
185	NC_022100	ATT	5	80343	80358	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	53331004
186	NC_022100	AATT	3	80990	81000	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331004
187	NC_022100	T	18	81122	81139	18	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	53331004
188	NC_022100	GTTC	4	81497	81512	16	0 %	50 %	25 %	25 %	6 %	53331004
189	NC_022100	TTCATT	3	84805	84822	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	0 %	53331004
190	NC_022100	A	12	85589	85600	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	53331004
191	NC_022100	TACC	3	85990	86001	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	53331004
192	NC_022100	CCTA	3	87188	87198	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	53331004
193	NC_022100	T	12	88888	88899	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	53331004
194	NC_022100	GATA	3	89131	89141	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53331004
195	NC_022100	AAT	4	89231	89242	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331004
196	NC_022100	AT	6	89287	89297	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331004
197	NC_022100	CATT	3	89507	89518	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	53331004
198	NC_022100	TCAT	3	89581	89591	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
199	NC_022100	CAA	4	89729	89739	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
200	NC_022100	TAG	5	89811	89824	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
201	NC_022100	ATTT	4	89936	89951	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
202	NC_022100	ATA	5	90277	90291	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
203	NC_022100	TTTG	3	90551	90562	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
204	NC_022100	GAG	4	90564	90575	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
205	NC_022100	TAT	4	91114	91125	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
206	NC_022100	TAT	5	91145	91160	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
207	NC_022100	TAT	4	91166	91178	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
208	NC_022100	TAT	4	91182	91192	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
209	NC_022100	TAA	4	91193	91203	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
210	NC_022100	T	13	91224	91236	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
211	NC_022100	AAT	4	91552	91563	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
212	NC_022100	A	13	91862	91874	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
213	NC_022100	T	13	92115	92127	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
214	NC_022100	CTTT	3	92519	92529	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
215	NC_022100	A	15	92905	92919	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_022100	AAAG	3	92985	92995	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
217	NC_022100	AAAGA	3	93962	93976	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
218	NC_022100	A	12	94254	94265	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
219	NC_022100	TA	6	94273	94283	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
220	NC_022100	TA	6	94668	94678	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
221	NC_022100	GATA	3	95235	95246	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
222	NC_022100	AAAATA	3	95372	95390	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
223	NC_022100	GAAA	3	97337	97348	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331005
224	NC_022100	TA	6	97436	97446	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53331005
225	NC_022100	GCTT	3	97740	97750	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	53331005
226	NC_022100	TAAA	3	98489	98500	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
227	NC_022100	TA	6	98733	98744	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
228	NC_022100	ATT	4	99248	99259	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
229	NC_022100	TTTAA	3	99364	99377	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
230	NC_022100	ATACA	4	99402	99421	20	60 %	20 %	0 %	20 %	5 %	Non-Coding
231	NC_022100	A	12	99424	99435	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
232	NC_022100	AT	8	99450	99465	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
233	NC_022100	TA	8	99495	99509	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
234	NC_022100	T	12	99853	99864	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
235	NC_022100	AAG	4	99949	99960	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
236	NC_022100	T	14	100100	100113	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
237	NC_022100	AATA	3	101564	101574	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	53331005
238	NC_022100	ATG	4	101918	101928	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53331005
239	NC_022100	AAGA	3	103012	103023	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	53331005
240	NC_022100	GCA	4	103816	103827	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	53331005
241	NC_022100	TG	6	103853	103863	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	53331005
242	NC_022100	CATA	3	103914	103926	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	53331005
243	NC_022100	ATG	4	104142	104152	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	53331005
244	NC_022100	TTTG	3	105540	105551	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
245	NC_022100	TTCC	3	106042	106053	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	53331005
246	NC_022100	AT	7	106146	106158	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53331005
247	NC_022100	AT	6	106486	106497	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331005
248	NC_022100	TATT	4	106522	106537	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	53331005
249	NC_022100	A	16	107504	107519	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	53331005
250	NC_022100	ATT	4	108185	108196	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
251	NC_022100	AATT	3	108241	108252	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53331005
252	NC_022100	CTAAA	4	108853	108873	21	60 %	20 %	0 %	20 %	9 %	Non-Coding
253	NC_022100	AAAATA	3	109070	109087	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
254	NC_022100	ATA	4	109396	109407	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
255	NC_022100	TTAA	3	109433	109444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_022100	AATA	4	109590	109604	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
257	NC_022100	TA	8	109774	109789	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
258	NC_022100	TAAA	3	110047	110058	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
259	NC_022100	T	14	110916	110929	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
260	NC_022100	CATAAA	3	113280	113298	19	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	10 %	53331006
261	NC_022100	TAA	4	113534	113545	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
262	NC_022100	AT	6	113556	113566	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
263	NC_022100	TATC	3	113700	113710	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
264	NC_022100	TCTT	3	113894	113904	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
265	NC_022100	GTT	4	114999	115010	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	53331006
266	NC_022100	A	15	116689	116703	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
267	NC_022100	ATTT	3	117008	117018	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
268	NC_022100	TGCA	3	118306	118318	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	53331006
269	NC_022100	TTTCTA	3	118995	119011	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
270	NC_022100	ATA	4	119071	119081	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
271	NC_022100	GAAT	3	119082	119093	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
272	NC_022100	A	12	119115	119126	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
273	NC_022100	T	14	119167	119180	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
274	NC_022100	TGTAA	3	119330	119344	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
275	NC_022100	T	12	119416	119427	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
276	NC_022100	CATC	3	119508	119520	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
277	NC_022100	ATTT	3	119736	119746	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
278	NC_022100	AT	6	120062	120073	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
279	NC_022100	TA	7	120088	120100	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
280	NC_022100	ATA	4	120440	120451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	53331006
281	NC_022100	ATT	4	121082	121092	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	53331006
282	NC_022100	AATG	3	121696	121706	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	53331006
283	NC_022100	TA	6	121756	121767	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
284	NC_022100	TATACA	3	123465	123481	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
285	NC_022100	AATT	3	123484	123495	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
286	NC_022100	TTTC	3	123519	123530	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
287	NC_022100	A	12	123531	123542	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
288	NC_022100	A	14	123627	123640	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Borung plastid