ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Borung plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_022100	ATTA	4	2668	2683	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_022100	TA	6	2714	2725	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_022100	TATT	3	8474	8485	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_022100	ATTT	3	13086	13097	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_022100	T	13	13095	13107	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_022100	AT	6	13299	13310	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_022100	TA	6	13322	13333	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_022100	T	13	15195	15207	13	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
9	NC_022100	T	18	15996	16013	18	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
10	NC_022100	AAT	4	28949	28960	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_022100	ATC	6	35080	35097	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53331000
12	NC_022100	ATTT	3	39376	39387	12	25 %	75 %	0 %	0 %	53331000
13	NC_022100	T	12	42169	42180	12	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
14	NC_022100	A	13	43890	43902	13	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
15	NC_022100	T	15	44658	44672	15	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
16	NC_022100	ATA	4	45362	45373	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	53331000
17	NC_022100	A	12	45378	45389	12	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
18	NC_022100	TCAT	3	45560	45571	12	25 %	50 %	0 %	25 %	53331000
19	NC_022100	A	15	45709	45723	15	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
20	NC_022100	A	13	46771	46783	13	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
21	NC_022100	T	12	51272	51283	12	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
22	NC_022100	T	14	51898	51911	14	0 %	100 %	0 %	0 %	53331000
23	NC_022100	A	12	55968	55979	12	100 %	0 %	0 %	0 %	53331000
24	NC_022100	A	14	58265	58278	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_022100	TATT	3	58343	58354	12	25 %	75 %	0 %	0 %	53331002
26	NC_022100	T	12	59525	59536	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_022100	A	14	59560	59573	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_022100	TTA	4	59980	59991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_022100	TA	7	60096	60109	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_022100	T	15	62604	62618	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_022100	T	14	66280	66293	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_022100	ATC	4	68021	68032	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	53331003
33	NC_022100	AATTTG	3	74108	74125	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	Non-Coding
34	NC_022100	T	12	74837	74848	12	0 %	100 %	0 %	0 %	53331004
35	NC_022100	TAA	4	75545	75556	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_022100	AT	7	75883	75896	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_022100	TGAA	3	76879	76890	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
38	NC_022100	TAAT	4	77086	77101	16	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_022100	AT	6	77984	77995	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_022100	T	12	79221	79232	12	0 %	100 %	0 %	0 %	53331004
41	NC_022100	ATT	4	80343	80354	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	53331004
42	NC_022100	T	13	81122	81134	13	0 %	100 %	0 %	0 %	53331004
43	NC_022100	TTCATT	3	84805	84822	18	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	53331004
44	NC_022100	ATTT	3	89936	89947	12	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_022100	ATA	4	90280	90291	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_022100	TAT	4	91145	91156	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_022100	A	15	92905	92919	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_022100	GATA	3	95235	95246	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
49	NC_022100	ATACA	3	99402	99416	15	60 %	20 %	0 %	20 %	Non-Coding
50	NC_022100	A	12	99424	99435	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_022100	T	12	99853	99864	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_022100	A	13	107504	107516	13	100 %	0 %	0 %	0 %	53331005
53	NC_022100	AAT	4	109395	109406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
54	NC_022100	TTAA	3	109433	109444	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_022100	TA	6	109774	109785	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_022100	A	15	116689	116703	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_022100	GAAT	3	119082	119093	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
58	NC_022100	A	12	119115	119126	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_022100	T	14	119167	119180	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_022100	T	12	119416	119427	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_022100	A	12	123531	123542	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding

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