ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Jemalong 2HA plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_022099	TA	9	2714	2730	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
2	NC_022099	TA	6	3390	3401	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_022099	TA	7	3411	3423	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_022099	AT	6	8390	8403	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
5	NC_022099	AT	8	13281	13296	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_022099	AT	6	18738	18748	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_022099	AT	6	18771	18781	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_022099	CT	6	20204	20215	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
9	NC_022099	TC	6	25632	25643	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
10	NC_022099	TA	6	38872	38882	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330991
11	NC_022099	TA	6	38908	38918	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330991
12	NC_022099	AT	6	42200	42210	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330991
13	NC_022099	TA	6	45351	45362	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53330991
14	NC_022099	AT	8	45365	45380	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	53330991
15	NC_022099	AT	6	45637	45647	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330991
16	NC_022099	TA	6	56850	56861	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53330991
17	NC_022099	TA	6	58833	58843	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_022099	TA	6	59933	59945	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_022099	TA	8	60077	60091	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_022099	AT	6	62118	62128	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_022099	TA	6	64261	64271	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330994
22	NC_022099	AT	6	66521	66531	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_022099	TA	6	69873	69884	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_022099	TA	7	69986	69998	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
25	NC_022099	AT	8	76077	76092	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_022099	AT	7	78183	78196	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_022099	AT	6	89488	89498	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330995
28	NC_022099	TA	6	94472	94482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_022099	TA	6	94867	94877	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_022099	TA	6	97635	97645	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	53330996
31	NC_022099	TA	6	98932	98943	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_022099	AT	8	99644	99659	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_022099	TA	8	99689	99703	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
34	NC_022099	TG	6	104046	104056	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	53330996
35	NC_022099	AT	7	106346	106358	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	53330996
36	NC_022099	AT	6	106686	106697	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	53330996
37	NC_022099	TA	8	109975	109990	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_022099	AT	6	113758	113768	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_022099	AT	6	120263	120274	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_022099	TA	7	120288	120300	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_022099	TA	6	121956	121967	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Di-nucleotide Imperfect Repeats of Medicago truncatula cultivar Jemalong 2HA plastid