ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Lygus lineolaris mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021975	CTT	4	186	197	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021975	ATT	4	253	264	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52921764
3	NC_021975	TAT	5	408	422	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52921764
4	NC_021975	AT	6	435	446	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52921764
5	NC_021975	TAATA	3	447	460	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	52921764
6	NC_021975	ATT	5	475	489	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52921764
7	NC_021975	TAA	5	641	655	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52921764
8	NC_021975	AT	6	790	802	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52921764
9	NC_021975	TA	6	855	865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52921764
10	NC_021975	ATA	5	919	933	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52921764
11	NC_021975	ATA	4	1006	1017	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921764
12	NC_021975	ATA	4	1084	1095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921764
13	NC_021975	TA	6	1242	1253	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021975	ATGA	3	1391	1402	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52921764
15	NC_021975	TCAA	3	3633	3644	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	52921764
16	NC_021975	ATTAA	3	3656	3671	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	52921764
17	NC_021975	ATTA	3	4044	4054	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52921764
18	NC_021975	ATTTAT	3	4188	4204	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	52921764
19	NC_021975	ATA	5	4205	4218	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52921764
20	NC_021975	ATA	4	4740	4751	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921764
21	NC_021975	ATT	4	4778	4788	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52921764
22	NC_021975	AT	7	6317	6330	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52921765
23	NC_021975	TAAA	3	6507	6517	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921765
24	NC_021975	AAAT	3	6582	6592	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921765
25	NC_021975	AAAT	3	6788	6798	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921765
26	NC_021975	ATT	4	7070	7081	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52921765
27	NC_021975	AAG	4	7317	7328	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52921765
28	NC_021975	ATA	4	7370	7381	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921765
29	NC_021975	AAAT	3	7406	7416	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921765
30	NC_021975	TAAA	3	7535	7546	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52921765
31	NC_021975	TAA	4	7605	7616	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921765
32	NC_021975	AT	6	7675	7685	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52921765
33	NC_021975	TA	6	8147	8157	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52921764
34	NC_021975	AGAA	3	8186	8196	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52921764
35	NC_021975	AATAAA	3	8284	8301	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	52921764
36	NC_021975	TAAA	3	8613	8623	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921764
37	NC_021975	TAA	4	9021	9032	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921764
38	NC_021975	AAC	4	9031	9041	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	52921764
39	NC_021975	AAAC	3	9216	9227	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52921764
40	NC_021975	AT	6	9891	9901	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52921765
41	NC_021975	AAAT	3	10087	10097	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52921765
42	NC_021975	TTTA	3	10622	10633	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52921765
43	NC_021975	CCAT	3	11006	11018	13	25 %	25 %	0 %	50 %	7 %	52921765
44	NC_021975	ATT	5	11243	11257	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52921765
45	NC_021975	TTA	4	11342	11353	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52921765
46	NC_021975	AAATT	3	11550	11564	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	52921765
47	NC_021975	ATAA	3	11804	11815	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52921765
48	NC_021975	ATA	4	12236	12247	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52921765
49	NC_021975	AAATCA	3	12434	12451	18	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	52921765
50	NC_021975	TAATA	3	12551	12566	16	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
51	NC_021975	ATAA	3	12901	12912	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021975	TAAAA	4	13295	13314	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_021975	ATA	4	14035	14046	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021975	TTA	4	14063	14073	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_021975	ATAA	3	14484	14495	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021975	TAA	4	14585	14595	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
57	NC_021975	TAT	4	14995	15005	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_021975	TTA	4	15119	15130	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_021975	CATT	3	15296	15306	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021975	TGGA	5	15531	15550	20	25 %	25 %	50 %	0 %	5 %	Non-Coding
61	NC_021975	T	12	15611	15622	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021975	ATT	5	15625	15638	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021975	TATTTT	3	15905	15923	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_021975	TTAA	3	16056	16067	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021975	ATTA	3	16154	16165	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021975	TTAA	3	16217	16228	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021975	ATTA	3	16315	16326	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021975	ATTA	3	16476	16487	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021975	TTAA	3	16539	16550	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021975	ATTA	3	16637	16648	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_021975	TTAA	3	16700	16711	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021975	ATTA	3	16798	16809	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021975	TTAA	3	16861	16872	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021975	ATTA	3	16959	16970	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Lygus lineolaris mitochondrion