ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Anomodon attenuatus mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021931	AT	6	369	380	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021931	ATTT	3	5210	5220	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52924967
3	NC_021931	CTTT	3	6892	6903	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52924967
4	NC_021931	CTC	4	7117	7128	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	52924967
5	NC_021931	TTTC	3	10384	10394	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52924968
6	NC_021931	TTTC	3	11554	11565	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52924968
7	NC_021931	CTTT	3	12200	12210	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021931	CTTT	3	12565	12577	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021931	ATCTAT	3	12880	12897	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
10	NC_021931	A	13	13852	13864	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021931	TTTA	3	14481	14492	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52924968
12	NC_021931	AT	7	14605	14617	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_021931	TTTA	3	15426	15437	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52924968
14	NC_021931	ATTTT	3	15648	15661	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	52924968
15	NC_021931	CAA	4	15723	15733	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	52924968
16	NC_021931	TTTC	3	16022	16032	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52924968
17	NC_021931	A	12	16498	16509	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	52924968
18	NC_021931	CTTT	3	16628	16638	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52924968
19	NC_021931	GGGT	3	17269	17280	12	0 %	25 %	75 %	0 %	8 %	52924968
20	NC_021931	TTTCTT	3	18361	18379	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	52924968
21	NC_021931	AGAA	3	18603	18614	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52924968
22	NC_021931	ATT	4	19571	19583	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52924968
23	NC_021931	TGA	4	19854	19865	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52924968
24	NC_021931	A	13	20268	20280	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52924968
25	NC_021931	TA	6	20279	20290	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_021931	TAA	4	21251	21262	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021931	ATTC	3	21446	21456	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021931	ATTTT	3	21771	21785	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_021931	AGA	4	24178	24188	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021931	TTTG	3	24282	24292	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021931	A	12	24829	24840	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52924968
32	NC_021931	CTTT	3	25444	25454	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021931	TACA	6	25646	25669	24	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021931	ATAA	3	25689	25700	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_021931	TGAA	3	26181	26193	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	52924969
36	NC_021931	TA	7	26478	26491	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52924969
37	NC_021931	CTTTT	3	26839	26854	16	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52924969
38	NC_021931	CAT	4	27951	27961	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52924969
39	NC_021931	AT	7	28336	28349	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_021931	AAAC	5	28430	28448	19	75 %	0 %	0 %	25 %	10 %	52924969
41	NC_021931	TCT	4	29786	29798	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52924969
42	NC_021931	TGACTC	3	30277	30294	18	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
43	NC_021931	ATG	4	31126	31137	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
44	NC_021931	AT	6	33553	33564	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021931	AATC	4	33663	33677	15	50 %	25 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
46	NC_021931	TAA	4	34778	34789	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
47	NC_021931	ATA	4	34862	34873	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021931	GCG	4	35681	35691	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
49	NC_021931	ATATT	3	39989	40002	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_021931	GAA	7	41051	41070	20	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	5 %	Non-Coding
51	NC_021931	A	13	41074	41086	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
52	NC_021931	TAA	4	41084	41095	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_021931	TTTA	3	42185	42196	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021931	AT	13	42461	42486	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
55	NC_021931	T	14	42490	42503	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021931	TAAA	3	42640	42651	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021931	AT	6	45163	45173	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52924969
58	NC_021931	GC	6	45249	45259	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	52924969
59	NC_021931	TTAG	3	45391	45401	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52924969
60	NC_021931	AGA	4	47233	47244	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52924969
61	NC_021931	TCGA	3	47616	47628	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	52924969
62	NC_021931	ACT	4	48588	48600	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	52924969
63	NC_021931	GAT	4	48871	48881	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52924969
64	NC_021931	GAA	6	49687	49704	18	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_021931	GAAA	3	49736	49747	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021931	TCT	4	52009	52020	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52924969
67	NC_021931	GC	6	53107	53117	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	52924969
68	NC_021931	AATG	3	53320	53331	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52924969
69	NC_021931	ATAA	3	54836	54847	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021931	AT	6	55597	55610	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021931	CTTTT	3	56111	56125	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
72	NC_021931	AATA	3	56513	56523	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_021931	CAAT	3	56574	56585	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	52924969
74	NC_021931	AT	7	58075	58090	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_021931	AGAA	3	58217	58229	13	75 %	0 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_021931	CATAG	3	58417	58430	14	40 %	20 %	20 %	20 %	7 %	52924969
77	NC_021931	CTC	4	59064	59076	13	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	7 %	52924969
78	NC_021931	GAAA	3	59568	59579	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52924969
79	NC_021931	AAAT	3	59731	59742	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021931	AT	8	59769	59785	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
81	NC_021931	TGAA	3	59879	59889	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
82	NC_021931	TGC	4	61823	61835	13	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
83	NC_021931	ATGC	3	62668	62678	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
84	NC_021931	ATGT	3	62716	62727	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_021931	GAAA	3	63294	63304	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_021931	ATTT	3	64109	64120	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_021931	A	12	64936	64947	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52924970
88	NC_021931	GAA	4	66105	66116	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	0 %	52924970
89	NC_021931	TCT	4	66137	66147	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52924970
90	NC_021931	AGCG	3	67634	67644	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	52924970
91	NC_021931	ACAT	3	69099	69109	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	52924970
92	NC_021931	AGG	4	69708	69719	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	52924970
93	NC_021931	GGAC	3	69872	69882	11	25 %	0 %	50 %	25 %	9 %	52924970
94	NC_021931	TTTC	3	71394	71405	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
95	NC_021931	ATTT	3	71971	71982	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52924970
96	NC_021931	TTGG	3	72018	72029	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	52924970
97	NC_021931	TTG	4	72733	72744	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52924970
98	NC_021931	TTA	4	73009	73020	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52924970
99	NC_021931	GTTTT	3	73222	73236	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	52924970
100	NC_021931	AG	6	74546	74556	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
101	NC_021931	CT	7	74564	74577	14	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
102	NC_021931	AT	14	74599	74626	28	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_021931	GCT	4	76266	76277	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52924970
104	NC_021931	TTTA	3	76422	76432	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52924970
105	NC_021931	CGTA	3	76627	76638	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	52924970
106	NC_021931	TTATGA	3	77675	77691	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
107	NC_021931	ATCT	3	81166	81176	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
108	NC_021931	AATT	3	81218	81229	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
109	NC_021931	TTTA	3	81244	81255	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52924970
110	NC_021931	CTT	4	84177	84188	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
111	NC_021931	CTT	4	84629	84640	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52924970
112	NC_021931	A	12	85491	85502	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_021931	AAGA	3	85813	85823	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_021931	AT	6	86152	86162	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_021931	TTAG	3	86586	86597	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_021931	T	13	86744	86756	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_021931	ACTTTG	3	87375	87391	17	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
118	NC_021931	AT	6	88825	88836	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52924970
119	NC_021931	CGA	4	89137	89147	11	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	9 %	52924970
120	NC_021931	TAGA	3	91001	91012	12	50 %	25 %	25 %	0 %	0 %	52924970
121	NC_021931	TCTG	3	91340	91350	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
122	NC_021931	ATT	4	93512	93523	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52924971
123	NC_021931	AGA	4	94131	94142	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52924971
124	NC_021931	TTA	4	94674	94685	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52924971
125	NC_021931	TTAA	3	95480	95491	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52924971
126	NC_021931	TAT	4	95642	95652	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_021931	ATA	4	96091	96102	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52924971
128	NC_021931	TTTG	3	98438	98448	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	52924971
129	NC_021931	A	14	98715	98728	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52924971
130	NC_021931	TA	8	99293	99308	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
131	NC_021931	TTA	4	99834	99845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52924971
132	NC_021931	A	12	103274	103285	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52924971
133	NC_021931	G	13	103593	103605	13	0 %	0 %	100 %	0 %	7 %	52924971
134	NC_021931	TTCG	3	103918	103929	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	Non-Coding
135	NC_021931	AT	8	104060	104075	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_021931	T	17	104075	104091	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Anomodon attenuatus mitochondrion