ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Attacus atlas isolate SYAU01 mitochondrion

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021770	TAAA	3	65	75	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
2	NC_021770	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
3	NC_021770	TTAA	3	228	239	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021770	AACT	3	401	412	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	52534117
5	NC_021770	ATT	4	704	714	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534117
6	NC_021770	TAA	4	1041	1053	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534117
7	NC_021770	ATT	4	1094	1105	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534117
8	NC_021770	TAT	4	2036	2047	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534117
9	NC_021770	GAAA	3	2240	2251	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52534117
10	NC_021770	ATT	4	2856	2868	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52534117
11	NC_021770	ATTT	3	2893	2904	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52534117
12	NC_021770	TTAA	3	3180	3190	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52534118
13	NC_021770	TTTA	3	3191	3201	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52534118
14	NC_021770	ATTT	3	3934	3945	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52534117
15	NC_021770	ATTTT	3	3953	3966	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	52534117
16	NC_021770	AATT	3	4410	4420	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52534117
17	NC_021770	T	15	5005	5019	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	52534117
18	NC_021770	TAAT	5	5513	5533	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52534117
19	NC_021770	TTTAA	3	5566	5580	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_021770	TAT	4	5636	5646	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534117
21	NC_021770	ATTT	3	5842	5853	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52534117
22	NC_021770	TAT	4	5876	5887	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534117
23	NC_021770	AATTT	3	5989	6003	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021770	TAAAAA	3	6243	6259	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_021770	TAAA	3	6388	6399	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	52534118
26	NC_021770	A	12	6925	6936	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52534118
27	NC_021770	ATA	5	7318	7332	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52534118
28	NC_021770	TAA	4	7756	7768	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534118
29	NC_021770	AAAT	3	7968	7980	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52534118
30	NC_021770	TA	6	8023	8034	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52534118
31	NC_021770	TAA	4	8330	8341	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534117
32	NC_021770	ATA	4	8434	8445	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534117
33	NC_021770	TAAA	3	8933	8945	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52534117
34	NC_021770	TAAA	3	8969	8979	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52534117
35	NC_021770	TATT	3	8989	9001	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	52534117
36	NC_021770	AAAAT	3	9003	9016	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	52534117
37	NC_021770	TAA	4	9106	9118	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534117
38	NC_021770	AAAAT	3	9142	9155	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	52534117
39	NC_021770	AAT	4	9331	9341	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52534117
40	NC_021770	TAT	4	9464	9475	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534117
41	NC_021770	AT	9	9600	9616	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	52534118
42	NC_021770	TAA	7	9628	9647	20	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	52534118
43	NC_021770	ATT	5	9887	9901	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_021770	TTTA	3	10108	10119	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52534118
45	NC_021770	T	14	10729	10742	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	52534117
46	NC_021770	ATTT	3	11023	11033	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52534117
47	NC_021770	TAT	4	11161	11172	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534117
48	NC_021770	AAT	4	11167	11178	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534117
49	NC_021770	ATA	4	11735	11746	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534117
50	NC_021770	TAA	4	12234	12246	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534117
51	NC_021770	A	15	12305	12319	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	52534117
52	NC_021770	TA	10	12729	12749	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_021770	T	13	12959	12971	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
54	NC_021770	AATTTT	3	13450	13468	19	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
55	NC_021770	AAATT	4	13533	13552	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
56	NC_021770	TTTA	3	13553	13564	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
57	NC_021770	ATTA	3	13824	13835	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_021770	TAT	4	14047	14058	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
59	NC_021770	ATT	4	14683	14694	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_021770	ATTA	3	14701	14712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_021770	ATT	4	14834	14845	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021770	TAAA	3	14846	14857	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021770	T	24	14949	14972	24	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021770	ATTA	3	15117	15129	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
65	NC_021770	TA	13	15151	15174	24	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021770	TATAAA	3	15177	15195	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Attacus atlas isolate SYAU01 mitochondrion