ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum urartu chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021762	CAG	4	675	686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52578227
2	NC_021762	AAT	4	4469	4480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021762	GAA	4	8173	8184	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021762	TTG	4	10533	10543	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52578228
5	NC_021762	AAT	4	13859	13870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021762	ATA	4	18839	18849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021762	AGA	4	20261	20272	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52578228
8	NC_021762	AAC	4	22917	22928	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52578228
9	NC_021762	AAT	5	24605	24619	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	52578228
10	NC_021762	ATT	4	29784	29796	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021762	GTT	5	31467	31481	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52578228
12	NC_021762	TGC	4	32197	32208	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52578229
13	NC_021762	CTA	4	39851	39862	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52578229
14	NC_021762	AGT	4	42772	42782	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52578229
15	NC_021762	AAT	4	44839	44849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021762	TAT	5	47372	47387	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_021762	CTT	4	47928	47939	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021762	TAA	6	50387	50403	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
19	NC_021762	GAA	4	58571	58581	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021762	TTC	4	60791	60802	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52578230
21	NC_021762	TTA	4	63401	63412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021762	TCT	4	64503	64515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021762	TTC	5	65266	65280	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021762	TAA	4	67053	67064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021762	AGA	4	74378	74389	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52578232
26	NC_021762	TAT	5	75435	75448	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52578232
27	NC_021762	CTT	5	80569	80582	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52578232
28	NC_021762	TTC	4	81683	81693	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52578232
29	NC_021762	GCG	4	82782	82792	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	52578232
30	NC_021762	TAC	4	90819	90830	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52578232
31	NC_021762	TAA	4	105468	105478	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52578232
32	NC_021762	CAA	4	109854	109864	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	52578232

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum urartu chloroplast