ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Triticum urartu chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021762	CAG	4	675	686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52578227
2	NC_021762	AAGT	3	781	791	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52578227
3	NC_021762	TCTTT	3	2575	2589	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52578227
4	NC_021762	A	17	3543	3559	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_021762	CATT	3	3707	3718	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021762	AT	6	4169	4179	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021762	AT	7	4185	4197	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_021762	AAT	4	4469	4480	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021762	TCTCT	3	4683	4696	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	52578227
10	NC_021762	TTTAA	3	5934	5947	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021762	TTCT	3	6868	6878	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52578227
12	NC_021762	GAA	4	8173	8184	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021762	CAAAT	3	8459	8473	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
14	NC_021762	GAAA	3	10128	10139	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52578228
15	NC_021762	TTG	4	10533	10543	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52578228
16	NC_021762	A	14	11201	11214	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021762	AG	6	11251	11261	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021762	CGTAG	3	12159	12172	14	20 %	20 %	40 %	20 %	7 %	Non-Coding
19	NC_021762	AAT	4	13859	13870	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_021762	CT	6	14234	14244	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021762	TC	8	14618	14633	16	0 %	50 %	0 %	50 %	6 %	Non-Coding
22	NC_021762	TA	7	14641	14653	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021762	CTTT	3	14877	14888	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021762	AAAT	3	16603	16613	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021762	TTTC	3	16941	16951	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021762	ATCA	3	17495	17505	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021762	TACCT	3	17804	17817	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
28	NC_021762	ATGA	3	17866	17877	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_021762	A	15	18065	18079	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_021762	ATA	4	18839	18849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021762	TTTC	3	20235	20247	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	52578228
32	NC_021762	AGA	4	20261	20272	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52578228
33	NC_021762	CAACTT	3	20705	20722	18	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	5 %	52578228
34	NC_021762	AAC	4	22917	22928	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52578228
35	NC_021762	AAT	5	24605	24619	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	52578228
36	NC_021762	AGAA	3	24836	24847	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52578228
37	NC_021762	TTCA	3	27491	27501	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52578228
38	NC_021762	A	12	29491	29502	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	52578228
39	NC_021762	TTAA	3	29706	29717	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021762	ATT	4	29784	29796	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_021762	AGAA	3	30691	30701	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_021762	AT	6	30733	30743	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021762	GTT	5	31467	31481	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52578228
44	NC_021762	TA	6	31945	31956	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021762	ATTG	3	32127	32138	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_021762	TGC	4	32197	32208	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52578229
47	NC_021762	CTTT	3	32465	32475	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021762	AAAT	3	34252	34263	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52578229
49	NC_021762	TAGTT	3	35958	35972	15	20 %	60 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_021762	TA	6	36181	36191	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_021762	ATTG	3	38135	38145	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52578229
52	NC_021762	AAGA	3	39382	39393	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52578229
53	NC_021762	GACT	3	39421	39432	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	52578229
54	NC_021762	AATG	3	39781	39792	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52578229
55	NC_021762	CTA	4	39851	39862	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52578229
56	NC_021762	TG	6	40223	40233	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	52578229
57	NC_021762	CTAG	3	40325	40337	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	52578229
58	NC_021762	ATCA	3	42412	42422	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	52578229
59	NC_021762	AGT	4	42772	42782	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52578229
60	NC_021762	TCCT	3	42821	42832	12	0 %	50 %	0 %	50 %	0 %	52578229
61	NC_021762	T	15	42921	42935	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	52578229
62	NC_021762	CCATA	3	43698	43712	15	40 %	20 %	0 %	40 %	0 %	52578229
63	NC_021762	TTCA	3	44098	44109	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021762	AAT	4	44839	44849	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021762	ATCTT	3	44850	44864	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
66	NC_021762	GAAA	3	44933	44943	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021762	GGGGAA	3	45032	45050	19	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_021762	TA	6	45861	45871	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_021762	AAAT	3	46188	46199	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021762	TAAA	3	46252	46262	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_021762	AGAA	3	46388	46399	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021762	TTGA	3	46712	46724	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_021762	TAT	5	47372	47387	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_021762	CTTT	3	47416	47427	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
75	NC_021762	A	15	47804	47818	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_021762	ATAAAT	3	47900	47918	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
77	NC_021762	CTT	4	47928	47939	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
78	NC_021762	TTATCT	3	48063	48079	17	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
79	NC_021762	CAGA	3	48544	48554	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52578229
80	NC_021762	AGAA	3	50352	50362	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
81	NC_021762	TAA	6	50387	50403	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
82	NC_021762	AAACT	3	50898	50912	15	60 %	20 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
83	NC_021762	AATT	3	54034	54045	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021762	TGCA	3	55596	55608	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	52578230
85	NC_021762	GATCAT	3	56309	56325	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
86	NC_021762	AT	6	56368	56378	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_021762	AATA	3	56391	56402	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021762	AAAG	3	57286	57297	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_021762	AAAATC	3	57312	57328	17	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
90	NC_021762	TTTTA	4	57783	57801	19	20 %	80 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
91	NC_021762	GAA	4	58571	58581	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021762	ACTA	3	58825	58835	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
93	NC_021762	TTC	4	60791	60802	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52578230
94	NC_021762	TTGT	3	62942	62954	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_021762	T	12	63134	63145	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
96	NC_021762	TTTC	3	63362	63373	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_021762	TTA	4	63401	63412	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
98	NC_021762	TTCA	3	64223	64234	12	25 %	50 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
99	NC_021762	AAAG	3	64340	64350	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_021762	TCT	4	64503	64515	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
101	NC_021762	AAAGA	3	64999	65012	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
102	NC_021762	TATT	3	65216	65226	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_021762	TTC	5	65266	65280	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
104	NC_021762	GAAA	3	65540	65551	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
105	NC_021762	TAAA	3	65763	65774	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_021762	TA	7	66367	66379	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_021762	TAA	4	67053	67064	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_021762	ATGT	3	67665	67675	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52578232
109	NC_021762	AGAA	3	68526	68537	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	52578232
110	NC_021762	GAAA	4	71906	71921	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	52578232
111	NC_021762	AGA	4	74378	74389	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52578232
112	NC_021762	TAT	5	75435	75448	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52578232
113	NC_021762	A	17	76325	76341	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	52578232
114	NC_021762	T	12	76650	76661	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	52578232
115	NC_021762	T	12	76668	76679	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	52578232
116	NC_021762	TTAT	3	79998	80009	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52578232
117	NC_021762	CTT	5	80569	80582	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52578232
118	NC_021762	TCTT	3	80662	80673	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52578232
119	NC_021762	AGAAT	3	81054	81067	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	52578232
120	NC_021762	GAAA	3	81079	81089	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52578232
121	NC_021762	TTC	4	81683	81693	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52578232
122	NC_021762	GCG	4	82782	82792	11	0 %	0 %	66.67 %	33.33 %	9 %	52578232
123	NC_021762	CAGG	4	82833	82847	15	25 %	0 %	50 %	25 %	6 %	52578232
124	NC_021762	GC	6	82862	82872	11	0 %	0 %	50 %	50 %	9 %	52578232
125	NC_021762	CT	6	82991	83002	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	52578232
126	NC_021762	TA	6	85748	85759	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52578232
127	NC_021762	ATAGA	3	85766	85779	14	60 %	20 %	20 %	0 %	7 %	52578232
128	NC_021762	TCAAAA	4	86677	86700	24	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	8 %	52578232
129	NC_021762	ATTCTT	3	89443	89461	19	16.67 %	66.67 %	0 %	16.67 %	10 %	52578232
130	NC_021762	TTTGTT	3	89927	89945	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	52578232
131	NC_021762	TTCT	3	90066	90076	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52578232
132	NC_021762	TAC	4	90819	90830	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52578232
133	NC_021762	AAAC	3	94945	94957	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	52578232
134	NC_021762	ATCC	3	95079	95090	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	52578232
135	NC_021762	ACGG	3	98192	98203	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	Non-Coding
136	NC_021762	AGGT	3	98476	98487	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_021762	AACG	3	99801	99812	12	50 %	0 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
138	NC_021762	AAAG	4	101123	101138	16	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_021762	GAAT	3	102738	102748	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_021762	AAGG	3	102750	102761	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
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146	NC_021762	TC	6	115565	115576	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	52578232

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Triticum urartu chloroplast