ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum monococcum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021760	CAG	4	675	686	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52577848
2	NC_021760	AAT	4	4485	4496	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021760	GAA	4	8192	8203	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021760	TTG	4	10552	10562	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52577849
5	NC_021760	AAT	4	13871	13882	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021760	ATA	4	18850	18860	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021760	AGA	4	20272	20283	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52577849
8	NC_021760	AAC	4	22928	22939	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52577849
9	NC_021760	AAT	5	24616	24630	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	52577849
10	NC_021760	ATT	4	29795	29807	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021760	GTT	5	31478	31492	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52577849
12	NC_021760	TGC	4	32208	32219	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52577850
13	NC_021760	CTA	4	39873	39884	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52577850
14	NC_021760	AGT	4	42800	42810	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52577850
15	NC_021760	AAT	4	44868	44878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021760	TAT	5	47401	47416	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_021760	CTT	4	47956	47967	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021760	ATA	5	50417	50430	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_021760	GAA	4	58895	58905	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021760	TTC	4	61115	61126	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52577851
21	NC_021760	TTA	4	63721	63732	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021760	TCT	4	64824	64836	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021760	TTC	5	65587	65601	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021760	TAA	4	67374	67385	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021760	AGA	4	74701	74712	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52577852
26	NC_021760	TAT	5	75758	75771	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52577852
27	NC_021760	CTT	5	80892	80905	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52577852
28	NC_021760	TTC	4	82006	82016	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52577852
29	NC_021760	CTT	4	86975	86986	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52577852
30	NC_021760	TAC	4	91444	91455	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52577852
31	NC_021760	TAA	4	106082	106092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52577855
32	NC_021760	CAA	4	110475	110485	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	52577855

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Triticum monococcum chloroplast