ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Elophila interruptalis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021756	TTTAT	3	127	141	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
2	NC_021756	TAT	4	220	230	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021756	TAA	4	395	406	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534101
4	NC_021756	ATT	7	702	723	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534101
5	NC_021756	TTA	4	934	945	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534101
6	NC_021756	ATT	4	1029	1041	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52534101
7	NC_021756	TAA	4	1081	1092	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534101
8	NC_021756	AATTAA	4	1166	1189	24	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	52534101
9	NC_021756	TTAA	4	1191	1206	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52534101
10	NC_021756	TAT	4	1962	1973	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534101
11	NC_021756	AATT	3	1977	1987	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52534101
12	NC_021756	AGG	4	2130	2140	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	52534101
13	NC_021756	AT	7	2795	2809	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52534101
14	NC_021756	ATA	4	2857	2868	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534101
15	NC_021756	ATT	4	2902	2912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534101
16	NC_021756	TTAA	3	3194	3204	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52534101
17	NC_021756	ATT	4	3886	3896	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021756	ATTAA	3	4122	4136	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	52534102
19	NC_021756	TATTT	4	4621	4641	21	20 %	80 %	0 %	0 %	9 %	52534102
20	NC_021756	ATT	4	5631	5642	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534102
21	NC_021756	AATT	3	5845	5856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52534102
22	NC_021756	ATTT	4	5878	5892	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	52534102
23	NC_021756	ATT	4	5895	5905	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534102
24	NC_021756	TTTA	4	5958	5973	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
25	NC_021756	AATT	3	6110	6121	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021756	ATT	4	6293	6304	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021756	AT	30	6303	6359	57	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_021756	ATT	4	6426	6437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534102
29	NC_021756	TAAA	3	6472	6483	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	52534102
30	NC_021756	TAT	4	6779	6790	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534102
31	NC_021756	ATT	4	6958	6968	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534102
32	NC_021756	ATATA	3	7002	7016	15	60 %	40 %	0 %	0 %	0 %	52534102
33	NC_021756	TAAA	3	7222	7232	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52534102
34	NC_021756	ATA	4	7402	7413	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534102
35	NC_021756	TAA	4	7840	7852	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534102
36	NC_021756	A	14	8088	8101	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52534102
37	NC_021756	A	20	8111	8130	20	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	52534102
38	NC_021756	ATTAAT	3	8409	8426	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	52534102
39	NC_021756	ATA	4	8515	8526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534102
40	NC_021756	AAT	4	9013	9023	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52534102
41	NC_021756	TAAA	3	9050	9060	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52534102
42	NC_021756	AAAT	3	9134	9144	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52534102
43	NC_021756	AAAAT	3	9223	9236	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	52534102
44	NC_021756	AT	6	9413	9424	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52534102
45	NC_021756	AACTTT	3	9558	9576	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	52534102
46	NC_021756	AT	8	9690	9704	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52534102
47	NC_021756	A	13	9729	9741	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	52534102
48	NC_021756	ATT	5	9975	9988	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021756	ATT	4	10032	10042	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534102
50	NC_021756	ATT	5	10187	10201	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52534102
51	NC_021756	AAT	4	10250	10261	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534102
52	NC_021756	TTTA	3	10293	10304	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52534102
53	NC_021756	TAA	7	10438	10458	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	4 %	52534102
54	NC_021756	T	14	10825	10838	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	52534102
55	NC_021756	ATTT	3	11119	11129	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52534102
56	NC_021756	AATTTT	3	11452	11469	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	52534102
57	NC_021756	TAAT	3	11692	11703	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	52534102
58	NC_021756	TATTAA	3	11784	11801	18	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	52534102
59	NC_021756	ATA	4	12206	12216	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52534102
60	NC_021756	TAAAA	3	12381	12394	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	52534102
61	NC_021756	AAT	4	12785	12796	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021756	T	14	13007	13020	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021756	TTTTAA	3	13241	13257	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_021756	TAAT	3	13282	13292	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021756	AT	6	13466	13477	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021756	CTTTAA	3	13487	13503	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
67	NC_021756	TATAA	3	13636	13650	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021756	ATT	4	14780	14791	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021756	TAATT	3	14804	14818	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021756	TTA	4	14920	14932	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021756	TTAA	3	14978	14989	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021756	T	19	15038	15056	19	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
73	NC_021756	AT	8	15221	15235	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Elophila interruptalis mitochondrion