ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Ganoderma lucidum mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021750	GGAAA	3	263	277	15	60 %	0 %	40 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021750	AAT	4	1364	1375	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021750	TAAA	3	3593	3603	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021750	AT	6	3947	3957	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021750	TATT	3	4100	4111	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021750	TAA	4	5221	5232	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021750	AATA	3	5443	5453	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021750	AT	6	5904	5914	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021750	AAAAAT	3	6043	6059	17	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_021750	TTA	4	7110	7121	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
11	NC_021750	AATA	3	7844	7855	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	52600341
12	NC_021750	TAT	4	8150	8162	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52600341
13	NC_021750	ATTTT	3	8518	8531	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	52600341
14	NC_021750	TA	6	9076	9086	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021750	ATT	4	9284	9295	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
16	NC_021750	TCA	4	9622	9632	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52600341
17	NC_021750	AGTT	3	10824	10834	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52600341
18	NC_021750	AATA	3	10855	10866	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52600341
19	NC_021750	AGAA	3	11428	11438	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52600341
20	NC_021750	AAAG	3	12286	12296	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52600341
21	NC_021750	ATTT	3	12345	12356	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52600341
22	NC_021750	TAT	4	12580	12591	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
23	NC_021750	ATT	4	12950	12961	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
24	NC_021750	TTTA	3	14086	14097	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021750	TTATT	3	14414	14428	15	20 %	80 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021750	ATA	4	14677	14688	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021750	TAA	4	14816	14827	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_021750	TAA	4	15526	15537	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
29	NC_021750	ATA	4	15647	15657	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021750	AGT	4	15703	15713	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021750	TTTA	3	16105	16116	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021750	TAAA	3	16542	16552	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021750	AACT	3	16996	17007	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021750	AAT	4	17050	17061	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021750	ATAA	3	17770	17785	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
36	NC_021750	AAT	4	18621	18631	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021750	TAA	4	19216	19228	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_021750	ATT	4	19959	19969	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021750	TTAA	3	20200	20211	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021750	ATTA	4	20345	20360	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_021750	TAA	4	20554	20565	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	52600341
42	NC_021750	AT	6	20841	20851	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52600341
43	NC_021750	ATT	4	21830	21840	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52600341
44	NC_021750	TAAT	3	22278	22290	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52600341
45	NC_021750	A	12	22412	22423	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
46	NC_021750	AAAT	5	22869	22887	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	52600341
47	NC_021750	A	13	22948	22960	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52600341
48	NC_021750	AAAAAT	3	23077	23095	19	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	10 %	52600341
49	NC_021750	TAT	4	23176	23187	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
50	NC_021750	AATT	3	23274	23285	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52600341
51	NC_021750	TGTT	3	23766	23776	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021750	TAAA	3	24093	24104	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_021750	TTA	4	24236	24247	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
54	NC_021750	TAT	4	24303	24314	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600341
55	NC_021750	TTCA	3	24406	24416	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52600341
56	NC_021750	TAA	5	24716	24729	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52600341
57	NC_021750	TTTAGC	3	25159	25176	18	16.67 %	50 %	16.67 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021750	ATT	4	26153	26165	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_021750	ATTATA	3	26313	26331	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
60	NC_021750	CTTTA	3	26530	26543	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	52600342
61	NC_021750	ATA	4	26604	26614	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021750	TA	6	27485	27495	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52600342
63	NC_021750	TTATT	3	28060	28074	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	52600342
64	NC_021750	TTTA	3	28200	28210	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52600342
65	NC_021750	TTAAGT	3	28222	28239	18	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	52600342
66	NC_021750	ATTT	3	28240	28251	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52600342
67	NC_021750	TAT	5	28788	28801	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52600342
68	NC_021750	AAAC	3	29136	29147	12	75 %	0 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021750	TTCTTT	3	30048	30065	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	52600342
70	NC_021750	T	13	30544	30556	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021750	ATA	4	31017	31027	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021750	TAT	4	31412	31423	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600342
73	NC_021750	TAAAA	3	31915	31928	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
74	NC_021750	TAA	4	32445	32456	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52600342
75	NC_021750	AGT	4	32899	32910	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52600342
76	NC_021750	ATAA	4	33019	33034	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
77	NC_021750	ATA	4	33262	33272	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_021750	AATATA	3	33362	33378	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_021750	ATT	4	34300	34311	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600342
80	NC_021750	ATTT	3	34401	34412	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52600342
81	NC_021750	AAT	4	34560	34571	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52600342
82	NC_021750	AATT	3	34733	34744	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
83	NC_021750	TTA	5	35009	35026	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
84	NC_021750	GCTC	3	35058	35068	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021750	TA	6	35121	35132	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021750	GATTC	3	35460	35474	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	Non-Coding
87	NC_021750	A	13	35572	35584	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_021750	ATA	4	35649	35660	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
89	NC_021750	T	12	36735	36746	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	52600342
90	NC_021750	AATT	3	37698	37709	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52600342
91	NC_021750	AAAT	3	37746	37757	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52600342
92	NC_021750	AAATTA	3	38246	38264	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	52600342
93	NC_021750	AGT	4	38329	38339	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52600342
94	NC_021750	TAT	4	38680	38691	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600342
95	NC_021750	TTA	4	38928	38939	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	52600342
96	NC_021750	ATACT	3	40067	40081	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	52600342
97	NC_021750	TAA	4	40349	40361	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52600342
98	NC_021750	TTC	4	40907	40918	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52600342
99	NC_021750	TTTTA	3	42225	42239	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	52600342
100	NC_021750	TAT	4	42989	43000	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52600342
101	NC_021750	TTAG	3	43065	43076	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	52600342
102	NC_021750	TTTA	3	43114	43124	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52600342
103	NC_021750	AT	6	43608	43619	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52600342
104	NC_021750	AATT	3	44202	44214	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52600342
105	NC_021750	TTTA	3	44539	44550	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52600342
106	NC_021750	ATTAT	4	44591	44611	21	40 %	60 %	0 %	0 %	9 %	52600342
107	NC_021750	A	15	45230	45244	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
108	NC_021750	GTA	4	46578	46588	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52600342
109	NC_021750	TA	7	47776	47788	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52600342
110	NC_021750	CTTA	3	48764	48774	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52600343
111	NC_021750	AAGT	3	48825	48835	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52600343
112	NC_021750	TTAT	3	49101	49112	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52600343
113	NC_021750	ATT	4	49413	49425	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021750	AAT	4	49561	49571	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
115	NC_021750	TA	6	49608	49618	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_021750	ATT	4	50462	50473	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021750	TTAT	3	50545	50555	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_021750	TA	6	50556	50567	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
119	NC_021750	TTTA	3	51036	51046	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
120	NC_021750	AAT	4	51467	51478	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_021750	AAT	4	51527	51537	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_021750	ATA	5	51833	51847	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52600343
123	NC_021750	ATA	5	51954	51967	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52600343
124	NC_021750	TTTTGT	4	52729	52752	24	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021750	TA	6	52765	52776	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
126	NC_021750	AATAT	3	52779	52792	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
127	NC_021750	TAT	4	52882	52892	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_021750	TAA	4	52899	52910	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_021750	ATA	4	53108	53118	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
130	NC_021750	TGT	4	53215	53226	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
131	NC_021750	TAA	4	53392	53404	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
132	NC_021750	TA	6	54189	54199	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52600342
133	NC_021750	TAA	4	55911	55922	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52600343
134	NC_021750	TTA	4	58683	58693	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_021750	TTAA	3	59705	59717	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52600343
136	NC_021750	TAAT	3	60362	60373	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52600343

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Ganoderma lucidum mitochondrion