ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Nilaparvata lugens mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021748	ATT	4	416	427	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534091
2	NC_021748	TTAA	4	590	605	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52534091
3	NC_021748	AATT	3	819	830	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52534091
4	NC_021748	TTTAAA	3	1180	1198	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
5	NC_021748	TTTAAA	3	1591	1609	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
6	NC_021748	TTTAAA	3	2002	2020	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
7	NC_021748	AACC	3	3650	3661	12	50 %	0 %	0 %	50 %	8 %	52534092
8	NC_021748	TAT	4	3885	3895	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534092
9	NC_021748	TTAAA	3	4669	4682	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	52534092
10	NC_021748	ATTAT	3	5604	5617	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	52534092
11	NC_021748	ATT	4	5844	5855	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534092
12	NC_021748	TAA	4	6022	6032	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52534092
13	NC_021748	TTTAT	3	6109	6123	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	52534092
14	NC_021748	TAT	5	6380	6394	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52534092
15	NC_021748	ATT	4	6931	6942	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534092
16	NC_021748	TAAT	3	7026	7037	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52534092
17	NC_021748	AAATT	3	7384	7397	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	52534092
18	NC_021748	ATAAA	4	7470	7489	20	80 %	20 %	0 %	0 %	5 %	52534092
19	NC_021748	AAT	4	7521	7531	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52534092
20	NC_021748	AAATT	4	7870	7889	20	60 %	40 %	0 %	0 %	10 %	52534092
21	NC_021748	TAAA	3	8334	8344	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52534092
22	NC_021748	A	14	8542	8555	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52534092
23	NC_021748	A	15	8566	8580	15	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	52534092
24	NC_021748	ATAA	3	8761	8772	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	52534092
25	NC_021748	A	16	8947	8962	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	52534092
26	NC_021748	AAAT	3	9245	9256	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52534092
27	NC_021748	TAAA	3	9281	9292	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	52534092
28	NC_021748	A	16	9435	9450	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	52534092
29	NC_021748	TAA	4	9519	9530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	52534092
30	NC_021748	A	13	9554	9566	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52534092
31	NC_021748	AAAATA	4	9642	9665	24	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	8 %	52534092
32	NC_021748	TATAA	3	9702	9715	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	52534092
33	NC_021748	A	13	9892	9904	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52534092
34	NC_021748	ATA	5	10118	10131	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52534092
35	NC_021748	TAA	4	10144	10155	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52534092
36	NC_021748	ATTA	3	10200	10212	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52534092
37	NC_021748	AATTA	3	10213	10227	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	52534092
38	NC_021748	A	33	10835	10867	33	100 %	0 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021748	A	12	10940	10951	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021748	TATC	3	11123	11134	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52534093
41	NC_021748	TCATT	3	11517	11531	15	20 %	60 %	0 %	20 %	0 %	52534093
42	NC_021748	ATT	4	11553	11563	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52534093
43	NC_021748	TTA	4	11872	11883	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52534093
44	NC_021748	A	15	12202	12216	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	52534093
45	NC_021748	ATT	4	12250	12262	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52534093
46	NC_021748	GAAAAA	3	12333	12351	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	52534093
47	NC_021748	ATAA	3	12416	12427	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52534093
48	NC_021748	A	17	12620	12636	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	52534093
49	NC_021748	AAATTA	3	13046	13063	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	52534093
50	NC_021748	TAAA	3	13590	13600	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_021748	TAAT	4	13862	13878	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
52	NC_021748	GATTA	3	13987	14001	15	40 %	40 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
53	NC_021748	A	12	14034	14045	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021748	TA	9	15278	15294	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_021748	AT	8	15347	15361	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
56	NC_021748	AT	8	15417	15431	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_021748	AT	9	15463	15479	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021748	TAT	4	15493	15503	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021748	T	28	15570	15597	28	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021748	AAAT	5	15662	15680	19	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_021748	AT	13	15700	15724	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021748	AT	11	15727	15747	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_021748	AT	10	15750	15770	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
64	NC_021748	AT	8	15772	15787	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021748	AT	11	15790	15810	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
66	NC_021748	AT	7	15816	15831	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
67	NC_021748	AT	9	15841	15858	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
68	NC_021748	TA	7	15856	15868	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_021748	AT	8	15881	15896	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
70	NC_021748	AT	8	15923	15939	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
71	NC_021748	AT	6	15968	15981	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_021748	TTATAT	4	16078	16100	23	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021748	TAAA	4	16107	16122	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
74	NC_021748	TTAA	3	16146	16156	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
75	NC_021748	AAAG	3	17483	17494	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Nilaparvata lugens mitochondrion