ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Glycine falcata voucher CSIRO:G1718 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021649	TCT	4	2120	2131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617621
2	NC_021649	ATA	4	2977	2988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617621
3	NC_021649	ATT	4	4519	4529	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021649	TAT	4	4843	4854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021649	ATA	4	10503	10514	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021649	ATA	4	10564	10574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021649	ATA	4	10626	10637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021649	CAA	4	12701	12712	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021649	ATT	4	14651	14662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021649	AAT	4	14681	14692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021649	AAT	4	15837	15849	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617622
12	NC_021649	TAT	4	23677	23687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021649	AGA	4	23808	23818	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52617623
14	NC_021649	TAT	4	24750	24762	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_021649	ATT	4	29019	29031	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_021649	TTA	4	29032	29044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021649	ATA	6	30022	30039	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
18	NC_021649	ATA	4	34542	34553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_021649	AAC	4	38147	38158	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52617623
20	NC_021649	GAA	4	39636	39648	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52617623
21	NC_021649	CAT	4	41448	41459	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52617623
22	NC_021649	AAT	4	46449	46460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021649	TAG	4	47095	47106	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
24	NC_021649	TAA	4	47662	47672	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021649	TAT	5	48191	48205	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_021649	CTG	4	48352	48363	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617624
27	NC_021649	AAT	4	49623	49635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617624
28	NC_021649	TGT	4	50606	50617	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
29	NC_021649	GAT	4	54490	54500	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021649	ATG	4	58004	58015	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
31	NC_021649	AAT	4	58048	58059	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617624
32	NC_021649	ATA	7	59291	59311	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021649	ATA	4	59339	59351	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
34	NC_021649	TAT	4	60337	60347	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_021649	TTC	4	62426	62437	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617625
36	NC_021649	TTG	4	64649	64660	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021649	CTG	4	69463	69474	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617626
38	NC_021649	TAT	4	70334	70346	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52617626
39	NC_021649	AAT	5	71507	71520	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617626
40	NC_021649	ATT	4	73888	73899	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52617626
41	NC_021649	AAT	4	74821	74832	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617626
42	NC_021649	TAT	5	80346	80360	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	52617626
43	NC_021649	CAA	4	80805	80816	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52617626
44	NC_021649	ATA	4	81597	81607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	52617626
45	NC_021649	TGT	4	81764	81774	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52617626
46	NC_021649	ACG	4	84156	84167	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617626
47	NC_021649	CTT	4	84199	84210	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617626
48	NC_021649	GAT	4	84667	84677	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52617626
49	NC_021649	GAT	4	86101	86111	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	52617626
50	NC_021649	TTA	4	99595	99606	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52617626
51	NC_021649	AAT	4	110616	110627	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617626
52	NC_021649	GAA	4	110793	110804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52617626
53	NC_021649	AGA	4	112398	112408	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52617626
54	NC_021649	GTT	4	117374	117385	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52617626
55	NC_021649	TTA	4	120398	120408	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52617626
56	NC_021649	TTC	4	120428	120439	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617626
57	NC_021649	AAT	4	125062	125074	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617626
58	NC_021649	TAA	4	137442	137453	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617626
59	NC_021649	ACC	4	146128	146138	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	52617629
60	NC_021649	ATC	4	150937	150947	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021649	ATC	4	152371	152381	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52617629
62	NC_021649	GAA	5	152837	152851	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	52617629

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Glycine falcata voucher CSIRO:G1718 chloroplast