ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glycine falcata voucher CSIRO:G1718 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021649	TTCT	3	133	144	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021649	AAGT	3	1013	1023	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52617621
3	NC_021649	CATT	3	1566	1578	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
4	NC_021649	TA	6	1613	1624	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021649	TCT	4	2120	2131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617621
6	NC_021649	ATAA	3	2616	2627	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617621
7	NC_021649	ATA	4	2977	2988	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617621
8	NC_021649	ATT	4	4519	4529	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021649	TA	6	4529	4539	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_021649	TAT	4	4843	4854	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021649	TAAA	3	4890	4901	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021649	CGAAAT	3	4963	4981	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
13	NC_021649	AT	20	5173	5210	38	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_021649	A	15	7203	7217	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_021649	GGAA	3	9077	9089	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	52617622
16	NC_021649	AT	8	9669	9684	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
17	NC_021649	AAAT	3	10279	10290	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021649	AAGA	3	10327	10337	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021649	GTTT	3	10440	10452	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_021649	ATA	4	10503	10514	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021649	ATA	4	10564	10574	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021649	ATA	4	10626	10637	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021649	ACTAAT	3	10701	10719	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
24	NC_021649	CAAA	3	11203	11214	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52617622
25	NC_021649	CAA	4	12701	12712	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
26	NC_021649	A	12	13237	13248	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021649	TTTTG	3	13292	13306	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
28	NC_021649	GAAAA	3	13440	13454	15	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
29	NC_021649	TTGAT	3	13772	13786	15	20 %	60 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021649	TCTA	3	14230	14240	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
31	NC_021649	T	13	14350	14362	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021649	TTTC	3	14452	14462	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021649	ATT	4	14651	14662	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021649	AAT	4	14681	14692	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021649	AAT	4	15837	15849	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617622
36	NC_021649	TA	6	16845	16856	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52617622
37	NC_021649	AAAG	3	17867	17878	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617622
38	NC_021649	TA	7	17954	17966	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617622
39	NC_021649	TATC	4	18444	18459	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
40	NC_021649	TAGA	4	18468	18483	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
41	NC_021649	A	18	18682	18699	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
42	NC_021649	TCTT	3	21183	21194	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617622
43	NC_021649	TAT	4	23677	23687	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021649	AGA	4	23808	23818	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52617623
45	NC_021649	ATTTTT	3	24110	24128	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
46	NC_021649	TAAA	3	24362	24373	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021649	ATTA	3	24703	24713	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021649	TAT	4	24750	24762	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021649	TCTA	3	24771	24782	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_021649	AAGA	3	24838	24848	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
51	NC_021649	TAAT	3	24855	24865	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021649	TATC	4	24872	24887	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
53	NC_021649	ATTTTT	3	24999	25017	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_021649	TCTAT	3	25018	25032	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
55	NC_021649	CT	7	25888	25900	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021649	AAGAAA	3	25968	25986	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_021649	AAGC	3	26639	26649	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52617623
58	NC_021649	AATA	3	28675	28685	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021649	ATT	4	29019	29031	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021649	TTA	4	29032	29044	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_021649	AATTGA	3	29250	29267	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_021649	TTCT	3	29721	29732	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021649	ATA	6	30022	30039	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
64	NC_021649	AATAA	3	30479	30493	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021649	ATCAT	3	30568	30582	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
66	NC_021649	T	13	30989	31001	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
67	NC_021649	A	13	31424	31436	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
68	NC_021649	T	13	31560	31572	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021649	A	12	31992	32003	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021649	AT	7	32237	32250	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021649	TAGAA	3	32446	32460	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_021649	AATT	3	32732	32743	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021649	TTCA	3	33041	33052	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021649	AATCT	3	33388	33401	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
75	NC_021649	AT	6	33882	33893	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_021649	A	21	33928	33948	21	100 %	0 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
77	NC_021649	AT	6	34199	34209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
78	NC_021649	ATA	4	34542	34553	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
79	NC_021649	A	12	34589	34600	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
80	NC_021649	AATG	3	34907	34918	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52617623
81	NC_021649	A	12	35528	35539	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52617623
82	NC_021649	AAC	4	38147	38158	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52617623
83	NC_021649	A	14	38795	38808	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52617623
84	NC_021649	T	15	39249	39263	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	52617623
85	NC_021649	GAA	4	39636	39648	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52617623
86	NC_021649	CAT	4	41448	41459	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52617623
87	NC_021649	A	13	43332	43344	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52617623
88	NC_021649	AAT	4	46449	46460	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
89	NC_021649	ACTT	3	46616	46626	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617624
90	NC_021649	TAG	4	47095	47106	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
91	NC_021649	A	14	47406	47419	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_021649	TTAA	3	47429	47440	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_021649	A	12	47566	47577	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
94	NC_021649	TAA	4	47662	47672	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_021649	AT	7	47910	47922	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021649	GAAA	3	48151	48161	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
97	NC_021649	TAT	5	48191	48205	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_021649	CTG	4	48352	48363	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617624
99	NC_021649	AT	11	48914	48934	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_021649	TA	7	48944	48957	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_021649	AAT	4	49623	49635	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617624
102	NC_021649	AATT	3	50091	50103	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617624
103	NC_021649	TAAA	3	50368	50379	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_021649	TGT	4	50606	50617	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
105	NC_021649	A	18	52059	52076	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
106	NC_021649	T	23	52227	52249	23	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_021649	AAAT	3	52623	52634	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_021649	AT	6	53390	53400	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
109	NC_021649	T	12	53760	53771	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_021649	GAT	4	54490	54500	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_021649	AAAG	3	54696	54706	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617624
112	NC_021649	TTTTTG	3	54879	54895	17	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
113	NC_021649	TA	9	54924	54940	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
114	NC_021649	TTTA	3	55062	55073	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_021649	TA	6	55167	55178	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
116	NC_021649	TTTC	3	55534	55545	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021649	TATCTA	3	55590	55606	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
118	NC_021649	TTTCTT	3	55626	55643	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
119	NC_021649	ATTT	3	56726	56736	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617624
120	NC_021649	TTAT	3	57439	57451	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
121	NC_021649	ATG	4	58004	58015	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617624
122	NC_021649	AAT	4	58048	58059	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617624
123	NC_021649	AT	6	59144	59154	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
124	NC_021649	TA	6	59193	59204	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021649	AT	6	59270	59280	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_021649	ATA	7	59291	59311	21	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_021649	AT	6	59318	59328	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_021649	ATA	4	59339	59351	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_021649	TTCT	3	59719	59730	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_021649	TATT	3	60235	60245	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_021649	TAT	4	60337	60347	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
132	NC_021649	TTC	4	62426	62437	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52617625
133	NC_021649	A	16	63229	63244	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
134	NC_021649	A	13	63291	63303	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
135	NC_021649	TTCT	4	64406	64420	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
136	NC_021649	TTG	4	64649	64660	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_021649	AT	6	64801	64811	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_021649	AT	9	65774	65791	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
139	NC_021649	AT	8	66079	66093	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
140	NC_021649	AGAATA	3	66197	66215	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
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142	NC_021649	AATT	3	66861	66871	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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148	NC_021649	CTTT	3	68639	68650	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
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245	NC_021649	AT	9	125031	125047	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	52617626
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248	NC_021649	CATT	3	126291	126301	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617626
249	NC_021649	ATAA	3	127289	127300	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617626
250	NC_021649	TATT	3	127435	127445	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617626
251	NC_021649	TCGG	3	130746	130756	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	52617626
252	NC_021649	TTTTC	3	133733	133747	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52617626
253	NC_021649	TAA	4	137442	137453	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617626
254	NC_021649	AATAGA	3	137777	137793	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	52617626
255	NC_021649	T	13	142889	142901	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
256	NC_021649	T	15	143556	143570	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
257	NC_021649	TCAA	3	144170	144182	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617629
258	NC_021649	ATCA	3	145939	145951	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617629
259	NC_021649	ACC	4	146128	146138	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	52617629
260	NC_021649	AAAG	3	147781	147791	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617629
261	NC_021649	TATT	3	148825	148836	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52617629
262	NC_021649	TATT	3	150776	150787	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
263	NC_021649	ATC	4	150937	150947	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
264	NC_021649	ATC	4	152371	152381	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52617629
265	NC_021649	GAA	5	152837	152851	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	52617629

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Glycine falcata voucher CSIRO:G1718 chloroplast