ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Glycine dolichocarpa voucher CSIRO:G1134 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021648TTCT3133144120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
2NC_021648AAGT3101310231150 %25 %25 %0 %9 %52617613
3NC_021648CATT3155715691325 %50 %0 %25 %7 %Non-Coding
4NC_021648TA6160416151250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
5NC_021648TCT421072118120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52617613
6NC_021648ATAA3260326141275 %25 %0 %0 %8 %52617613
7NC_021648ATA4296429751266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52617613
8NC_021648AAAT4393639501575 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_021648ATT4450945191133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_021648TA7451945311350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_021648TAT4483748481233.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_021648TAAA3488448951275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_021648CGAAAT3495749751950 %16.67 %16.67 %16.67 %10 %Non-Coding
14NC_021648AT23516552084450 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
15NC_021648GGAA3905590671350 %0 %50 %0 %7 %52617613
16NC_021648C1296349645120 %0 %0 %100 %0 %Non-Coding
17NC_021648AAAT310256102671275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
18NC_021648AAGA310304103141175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
19NC_021648GTTT31041810430130 %75 %25 %0 %7 %Non-Coding
20NC_021648ATA410500105111266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_021648ATA510563105771566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
22NC_021648ATA410618106291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_021648ACTAAT310693107111950 %33.33 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
24NC_021648CAAA311195112061275 %0 %0 %25 %8 %52617613
25NC_021648CAA412691127021266.67 %0 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
26NC_021648AAAG412765127811775 %0 %25 %0 %5 %Non-Coding
27NC_021648A14129481296114100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_021648A16132271324216100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
29NC_021648TTTTG31328613300150 %80 %20 %0 %6 %Non-Coding
30NC_021648A19134351345319100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
31NC_021648TCTA314201142111125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
32NC_021648TTTC31441914429110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
33NC_021648ATT414617146281233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
34NC_021648AAT414647146581266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
35NC_021648A13147771478913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_021648AAT415808158201366.67 %33.33 %0 %0 %7 %52617613
37NC_021648TA616815168261250 %50 %0 %0 %8 %52617614
38NC_021648AAAG317837178481275 %0 %25 %0 %8 %52617614
39NC_021648TA717924179361350 %50 %0 %0 %7 %52617614
40NC_021648TATC418415184301625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
41NC_021648TAGA418439184541650 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
42NC_021648TCTT32118621197120 %75 %0 %25 %8 %52617614
43NC_021648TAT423680236901133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
44NC_021648AGA423811238211166.67 %0 %33.33 %0 %9 %52617614
45NC_021648ATTTTT324113241311916.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
46NC_021648TAAA324365243761275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
47NC_021648ATTA324706247161150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
48NC_021648TAT424741247531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
49NC_021648TCTA324762247731225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
50NC_021648AAGA324829248391175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
51NC_021648ATTTTT324986250041916.67 %83.33 %0 %0 %10 %Non-Coding
52NC_021648TCTAT325005250191520 %60 %0 %20 %6 %Non-Coding
53NC_021648T182502325040180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
54NC_021648CT72587125883130 %50 %0 %50 %7 %Non-Coding
55NC_021648AAGAAA325949259671983.33 %0 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
56NC_021648AAGC326620266301150 %0 %25 %25 %9 %52617614
57NC_021648TA626924269341150 %50 %0 %0 %9 %52617614
58NC_021648AATA328656286661175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
59NC_021648ATT429000290131433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
60NC_021648AATTGA329215292321850 %33.33 %16.67 %0 %0 %Non-Coding
61NC_021648TTCT32968629697120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
62NC_021648ATA529990300041566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
63NC_021648A14304523046514100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
64NC_021648T123052430535120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
65NC_021648ATCAT330539305531540 %40 %0 %20 %6 %Non-Coding
66NC_021648TGTT33150431515120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding
67NC_021648A12319413195212100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
68NC_021648AT732195322081450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_021648TAATA332404324181560 %40 %0 %0 %6 %Non-Coding
70NC_021648AATT332685326961250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
71NC_021648A15327843279815100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
72NC_021648TTCA332998330091225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
73NC_021648AATCT333339333521440 %40 %0 %20 %7 %Non-Coding
74NC_021648AT633827338381250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
75NC_021648A13338783389013100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
76NC_021648AT634138341481150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
77NC_021648ATA434424344351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
78NC_021648A12354073541812100 %0 %0 %0 %8 %52617614
79NC_021648AAC438026380371266.67 %0 %0 %33.33 %8 %52617615
80NC_021648A13386743868613100 %0 %0 %0 %7 %52617615
81NC_021648A14390003901314100 %0 %0 %0 %7 %52617615
82NC_021648T153912439138150 %100 %0 %0 %6 %52617615
83NC_021648GAA439511395231366.67 %0 %33.33 %0 %7 %52617615
84NC_021648CAT441323413341233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %52617615
85NC_021648A13432074321913100 %0 %0 %0 %7 %52617615
86NC_021648AAT446330463411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
87NC_021648ACTT346492465021125 %50 %0 %25 %9 %52617615
88NC_021648GTT54697646990150 %66.67 %33.33 %0 %6 %52617615
89NC_021648TAGA447225472401650 %25 %25 %0 %6 %Non-Coding
90NC_021648A17472904730617100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
91NC_021648TTAA347316473271250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
92NC_021648A14474534746614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
93NC_021648TAA447551475611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
94NC_021648AT747795478071350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
95NC_021648GAAA348036480461175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
96NC_021648TAT448076480871233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
97NC_021648CTG44823448245120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %52617615
98NC_021648CTCTT34863548648140 %60 %0 %40 %7 %Non-Coding
99NC_021648AT848807488221650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
100NC_021648TA748828488411450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
101NC_021648AATT349973499851350 %50 %0 %0 %7 %52617615
102NC_021648TAAA350250502611275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_021648TGT45048850499120 %66.67 %33.33 %0 %8 %52617615
104NC_021648A17519255194117100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
105NC_021648T155209252106150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
106NC_021648AAAT352480524911275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_021648TAAA352977529871175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_021648AT653244532541150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
109NC_021648AATCGA353561535771750 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
110NC_021648T155361853632150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
111NC_021648GAT454351543611133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
112NC_021648AAAG354557545671175 %0 %25 %0 %9 %52617615
113NC_021648TTTTTG35474054757180 %83.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
114NC_021648TA654786547991450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
115NC_021648TTTA354921549321225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
116NC_021648TA655026550371250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
117NC_021648TTTC35538355394120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
118NC_021648TATCTA355439554551733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
119NC_021648TATCTA355460554761733.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
120NC_021648T195549655514190 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
121NC_021648ATTT356594566041125 %75 %0 %0 %9 %52617615
122NC_021648G125664556656120 %0 %100 %0 %8 %52617615
123NC_021648TTAT357304573161325 %75 %0 %0 %7 %Non-Coding
124NC_021648TAT457386573961133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
125NC_021648ATG457869578801233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %52617616
126NC_021648AAT457913579241266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52617616
127NC_021648AT659009590191150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
128NC_021648ATA459104591151266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
129NC_021648ATA459124591361366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
130NC_021648ATA459140591521366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
131NC_021648TATT360036600461125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
132NC_021648TAT460138601481133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
133NC_021648T136019360205130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
134NC_021648TTCT36029960309110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
135NC_021648TTC46223062241120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52617616
136NC_021648AATA362423624341275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
137NC_021648A13630326304413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
138NC_021648A12630916310212100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
139NC_021648TA663447634571150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_021648TTCT46420764221150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
141NC_021648TTG46445064461120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
142NC_021648AT664602646121150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
143NC_021648AT1265589656112350 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
144NC_021648AT1865878659133650 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
145NC_021648AGAATA366017660351966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %Non-Coding
146NC_021648GAAA366941669521275 %0 %25 %0 %8 %52617617
147NC_021648A12674946750512100 %0 %0 %0 %8 %52617617
148NC_021648AATT367510675201150 %50 %0 %0 %9 %52617617
149NC_021648AAGA367608676181175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
150NC_021648AAAT368306683161175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
151NC_021648CTTT36844268453120 %75 %0 %25 %0 %Non-Coding
152NC_021648AT769042690561550 %50 %0 %0 %6 %52617617
153NC_021648CTG46926569276120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %52617617
154NC_021648T136974969761130 %100 %0 %0 %0 %52617617
155NC_021648AAAG369766697761175 %0 %25 %0 %9 %52617617
156NC_021648T126993769948120 %100 %0 %0 %0 %52617617
157NC_021648A18700057002218100 %0 %0 %0 %5 %52617617
158NC_021648GATA370054700661350 %25 %25 %0 %7 %52617617
159NC_021648TAT470163701751333.33 %66.67 %0 %0 %7 %52617617
160NC_021648AAAG370691707021275 %0 %25 %0 %8 %52617617
161NC_021648ATTC371156711671225 %50 %0 %25 %8 %52617617
162NC_021648AAT571336713491466.67 %33.33 %0 %0 %7 %52617617
163NC_021648ATTT371496715071225 %75 %0 %0 %0 %52617617
164NC_021648AGTAAA373658736761966.67 %16.67 %16.67 %0 %10 %52617617
165NC_021648ATT473713737241233.33 %66.67 %0 %0 %8 %52617617
166NC_021648TAAA373805738161275 %25 %0 %0 %8 %52617617
167NC_021648TTTC37441874429120 %75 %0 %25 %8 %52617617
168NC_021648AAT474646746571266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52617617
169NC_021648TATT374820748301125 %75 %0 %0 %9 %52617617
170NC_021648AGAAA377234772471480 %0 %20 %0 %7 %52617617
171NC_021648ATCA378966789771250 %25 %0 %25 %0 %52617617
172NC_021648TA779016790281350 %50 %0 %0 %7 %52617617
173NC_021648CTTT37936079371120 %75 %0 %25 %8 %52617617
174NC_021648CTTTT37987779892160 %80 %0 %20 %6 %52617617
175NC_021648TAT580146801601533.33 %66.67 %0 %0 %6 %52617617
176NC_021648TA880177801921650 %50 %0 %0 %6 %52617617
177NC_021648TA780196802091450 %50 %0 %0 %7 %52617617
178NC_021648CAA480619806301266.67 %0 %0 %33.33 %8 %52617617
179NC_021648TA781369813821450 %50 %0 %0 %7 %52617617
180NC_021648ATA481401814111166.67 %33.33 %0 %0 %9 %52617617
181NC_021648TA681547815581250 %50 %0 %0 %8 %52617617
182NC_021648TGT48156881578110 %66.67 %33.33 %0 %9 %52617617
183NC_021648TTCT38215682167120 %75 %0 %25 %8 %52617617
184NC_021648AT683006830161150 %50 %0 %0 %9 %52617617
185NC_021648T138328883300130 %100 %0 %0 %7 %52617617
186NC_021648AATT383443834541250 %50 %0 %0 %8 %52617617
187NC_021648T238348683508230 %100 %0 %0 %4 %52617617
188NC_021648ACG483944839551233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %52617617
189NC_021648CTT48398783998120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52617617
190NC_021648GAT484455844651133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %52617617
191NC_021648ATAGAT484499845222450 %33.33 %16.67 %0 %8 %52617617
192NC_021648GACT384665846761225 %25 %25 %25 %8 %52617617
193NC_021648GAT485881858911133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %52617617
194NC_021648TTCT38591485924110 %75 %0 %25 %9 %52617617
195NC_021648TTCT38786587875110 %75 %0 %25 %9 %52617617
196NC_021648CTTT38896488975120 %75 %0 %25 %8 %52617617
197NC_021648TGAT390919909311325 %50 %25 %0 %7 %52617617
198NC_021648AATA391763917751375 %25 %0 %0 %7 %52617617
199NC_021648TTGA392646926581325 %50 %25 %0 %7 %52617617
200NC_021648ACTT392944929541125 %50 %0 %25 %9 %52617617
201NC_021648A23932589328023100 %0 %0 %0 %8 %52617617
202NC_021648AGAT396051960611150 %25 %25 %0 %9 %52617617
203NC_021648TTTCG39675696769140 %60 %20 %20 %7 %52617617
204NC_021648TTTGTT39715597173190 %83.33 %16.67 %0 %10 %52617617
205NC_021648CCCT39802398033110 %25 %0 %75 %9 %52617617
206NC_021648TTCTAT399031990471716.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %52617617
207NC_021648TTA499372993831233.33 %66.67 %0 %0 %8 %52617617
208NC_021648ATTT399620996311225 %75 %0 %0 %8 %52617617
209NC_021648TCTA31027391027501225 %50 %0 %25 %8 %52617617
210NC_021648GAAAA31030781030921580 %0 %20 %0 %6 %52617617
211NC_021648GAGG31056181056291225 %0 %75 %0 %8 %52617617
212NC_021648AGGT31058301058411225 %25 %50 %0 %8 %52617617
213NC_021648TTTA31096031096151325 %75 %0 %0 %7 %52617617
214NC_021648AAT41103931104041266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52617617
215NC_021648T12110462110473120 %100 %0 %0 %0 %52617617
216NC_021648TTTC3110529110540120 %75 %0 %25 %8 %52617617
217NC_021648GAA41105701105811266.67 %0 %33.33 %0 %8 %52617617
218NC_021648A1311087111088313100 %0 %0 %0 %0 %52617617
219NC_021648A1711200411202017100 %0 %0 %0 %5 %52617617
220NC_021648AGA41121751121851166.67 %0 %33.33 %0 %9 %52617617
221NC_021648T13112557112569130 %100 %0 %0 %7 %52617617
222NC_021648A1611329611331116100 %0 %0 %0 %6 %52617617
223NC_021648GAAA31137311137411175 %0 %25 %0 %9 %52617617
224NC_021648ATTT31145371145471125 %75 %0 %0 %9 %52617617
225NC_021648AGAAA31147321147451480 %0 %20 %0 %7 %52617617
226NC_021648AAAT31149251149361275 %25 %0 %0 %8 %52617617
227NC_021648AAAT31167071167171175 %25 %0 %0 %9 %52617617
228NC_021648AT61168951169061250 %50 %0 %0 %8 %52617617
229NC_021648ACATA31172491172621460 %20 %0 %20 %7 %52617617
230NC_021648ATTT31178571178681225 %75 %0 %0 %8 %52617617
231NC_021648AT71192501192621350 %50 %0 %0 %7 %52617617
232NC_021648TTA41201521201621133.33 %66.67 %0 %0 %9 %52617617
233NC_021648TTC4120182120193120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52617617
234NC_021648ATCA31205071205181250 %25 %0 %25 %0 %52617617
235NC_021648TCAT31207311207421225 %50 %0 %25 %8 %52617617
236NC_021648AT71207531207661450 %50 %0 %0 %7 %52617617
237NC_021648TATT31224941225051225 %75 %0 %0 %0 %52617617
238NC_021648A1712272212273817100 %0 %0 %0 %0 %52617617
239NC_021648TGAATT41227961228192433.33 %50 %16.67 %0 %8 %52617617
240NC_021648TA61229041229161350 %50 %0 %0 %7 %52617617
241NC_021648ATTT31230861230961125 %75 %0 %0 %9 %52617617
242NC_021648ATATT31242981243121540 %60 %0 %0 %6 %52617617
243NC_021648AT91247911248071750 %50 %0 %0 %5 %52617617
244NC_021648AAT41248291248411366.67 %33.33 %0 %0 %7 %52617617
245NC_021648AAAT31255991256091175 %25 %0 %0 %9 %52617617
246NC_021648CATT31260561260661125 %50 %0 %25 %9 %52617617
247NC_021648ATAA31270541270651275 %25 %0 %0 %8 %52617617
248NC_021648TATT31272001272101125 %75 %0 %0 %9 %52617617
249NC_021648TCGG3130538130548110 %25 %50 %25 %9 %52617617
250NC_021648TTTTC3133525133539150 %80 %0 %20 %6 %52617617
251NC_021648TAAA31369821369921175 %25 %0 %0 %9 %52617617
252NC_021648TAA41372341372451266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52617617
253NC_021648AATAGA31375691375851766.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %52617617
254NC_021648T21143339143359210 %100 %0 %0 %4 %Non-Coding
255NC_021648TCAA31439591439711350 %25 %0 %25 %7 %52617621
256NC_021648ATCA31457281457401350 %25 %0 %25 %7 %52617621
257NC_021648ACC41459171459271133.33 %0 %0 %66.67 %9 %52617621
258NC_021648AAAG31475701475801175 %0 %25 %0 %9 %52617621
259NC_021648TATT31486141486251225 %75 %0 %0 %8 %52617621
260NC_021648TATT31505651505761225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
261NC_021648ATC41507261507361133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
262NC_021648ATC41521521521621133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %52617621
263NC_021648GAA51526181526321566.67 %0 %33.33 %0 %6 %52617621