ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Glycine stenophita voucher CSIRO:G1974 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021646	AAGT	3	1012	1022	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52617596
2	NC_021646	ATAA	3	2606	2617	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617596
3	NC_021646	TAAA	3	4457	4468	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021646	GGAA	3	8937	8949	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	52617596
5	NC_021646	AGAA	3	9355	9366	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021646	AAAT	3	10132	10143	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021646	AAGA	3	10180	10190	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021646	GTTT	3	10293	10305	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021646	CAAA	3	11053	11064	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52617596
10	NC_021646	AAAT	3	12796	12808	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021646	TCTA	3	14043	14053	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021646	TTTC	3	14267	14277	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021646	AAAG	3	17689	17700	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617596
14	NC_021646	TATC	4	18266	18281	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
15	NC_021646	TAGA	4	18290	18305	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
16	NC_021646	TATC	4	18337	18352	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
17	NC_021646	TAGA	4	18361	18376	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_021646	TCTT	3	21124	21135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617597
19	NC_021646	TAAA	3	24315	24326	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021646	TCTA	3	24696	24707	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021646	ATTT	3	24747	24759	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
22	NC_021646	TAAT	3	24780	24790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021646	AAGC	3	26540	26550	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52617597
24	NC_021646	AATA	3	28576	28586	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021646	TGTT	3	31411	31422	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
26	NC_021646	AATT	3	32596	32607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021646	ACAA	3	32726	32736	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021646	TTCA	3	32901	32912	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
29	NC_021646	TTTC	3	33098	33108	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021646	AATT	3	33149	33161	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
31	NC_021646	GGTC	3	39953	39964	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	52617597
32	NC_021646	AAAT	3	46396	46406	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021646	ACTT	3	46605	46615	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617598
34	NC_021646	GAAA	3	47991	48001	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
35	NC_021646	AATT	3	49936	49948	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617598
36	NC_021646	TAAA	3	50213	50224	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021646	AAAT	4	53094	53109	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_021646	AAAG	3	54590	54600	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617598
39	NC_021646	TTTA	3	54951	54961	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
40	NC_021646	TTTC	3	55404	55415	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
41	NC_021646	TAAA	3	56329	56339	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617598
42	NC_021646	ATAA	3	56388	56400	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52617598
43	NC_021646	ATTT	3	56608	56618	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617598
44	NC_021646	TTAT	3	57336	57348	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
45	NC_021646	TTCT	3	59637	59648	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_021646	TATT	3	60153	60163	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_021646	TTCT	4	64310	64324	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
48	NC_021646	AAAT	3	64600	64612	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021646	AATT	3	66758	66768	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021646	GAAA	3	67030	67041	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617600
51	NC_021646	AATT	3	67578	67588	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617600
52	NC_021646	AAGA	3	67679	67689	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_021646	CAAA	3	67783	67794	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021646	AAAT	3	68379	68389	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_021646	CTTT	3	68519	68530	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_021646	AAGA	3	69851	69861	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617600
57	NC_021646	GATA	3	70130	70142	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	52617600
58	NC_021646	ACCC	3	70472	70483	12	25 %	0 %	0 %	75 %	0 %	52617600
59	NC_021646	AAAG	3	70766	70776	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617600
60	NC_021646	ATTT	3	70998	71008	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
61	NC_021646	ATTC	3	71230	71241	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52617600
62	NC_021646	ATTT	3	71570	71581	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52617600
63	NC_021646	TAAA	3	73883	73894	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617600
64	NC_021646	TATT	3	74896	74906	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
65	NC_021646	CCAA	3	76013	76023	11	50 %	0 %	0 %	50 %	9 %	52617600
66	NC_021646	TGTT	3	78423	78434	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	52617600
67	NC_021646	ATCA	3	79054	79065	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	52617600
68	NC_021646	TTCT	3	82258	82269	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617600
69	NC_021646	AATT	3	83558	83569	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52617600
70	NC_021646	GACT	3	84787	84798	12	25 %	25 %	25 %	25 %	8 %	52617600
71	NC_021646	TTCT	3	86036	86046	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52617600
72	NC_021646	TTCT	3	87987	87997	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	52617600
73	NC_021646	CTTT	3	89086	89097	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617600
74	NC_021646	TGAT	3	91041	91053	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	52617600
75	NC_021646	AATA	3	91885	91897	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52617600
76	NC_021646	TTGA	3	92768	92780	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	52617600
77	NC_021646	ACTT	3	93066	93076	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617600
78	NC_021646	AGAT	3	96175	96185	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52617600
79	NC_021646	CCCT	3	98149	98159	11	0 %	25 %	0 %	75 %	9 %	52617600
80	NC_021646	TCTA	3	102864	102875	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52617600
81	NC_021646	GAGG	3	105604	105615	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	52617600
82	NC_021646	AGGT	3	105816	105827	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	52617600
83	NC_021646	TTTA	3	109593	109605	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	52617600
84	NC_021646	GAAA	3	113721	113731	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617600
85	NC_021646	ATTT	3	114527	114537	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
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87	NC_021646	AAAT	3	116715	116725	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617600
88	NC_021646	ATTT	3	117852	117863	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52617600
89	NC_021646	ACTA	3	119810	119820	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	52617600
90	NC_021646	ATCA	3	120519	120530	12	50 %	25 %	0 %	25 %	0 %	52617600
91	NC_021646	ATAA	3	120557	120567	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617600
92	NC_021646	TCAT	3	120744	120755	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	52617600
93	NC_021646	TATT	3	122505	122516	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52617600
94	NC_021646	ATTT	3	123104	123114	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
95	NC_021646	TAAA	3	123411	123421	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617600
96	NC_021646	AAAT	3	125572	125582	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617600
97	NC_021646	CATT	3	126029	126039	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617600
98	NC_021646	TTCA	3	126356	126368	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	52617600
99	NC_021646	ATAA	3	127027	127038	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617600
100	NC_021646	TATT	3	127173	127183	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
101	NC_021646	TCGG	3	130488	130498	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	52617600
102	NC_021646	TCAA	3	143773	143785	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617603
103	NC_021646	AAAG	3	147384	147394	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617603
104	NC_021646	TATT	3	148428	148439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52617603
105	NC_021646	TATT	3	150379	150390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Glycine stenophita voucher CSIRO:G1974 chloroplast