ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glycine stenophita voucher CSIRO:G1974 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021646	AAGT	3	1012	1022	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52617596
2	NC_021646	TA	6	1603	1614	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021646	TATAGA	3	1884	1901	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021646	TCT	5	2108	2121	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52617596
5	NC_021646	ATAA	3	2606	2617	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617596
6	NC_021646	ATA	4	2967	2978	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617596
7	NC_021646	TAAA	3	4457	4468	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021646	TA	6	4508	4518	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021646	TAT	5	4831	4844	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_021646	ATCGAA	3	4952	4970	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
11	NC_021646	AT	19	5164	5199	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021646	T	12	6970	6981	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021646	GGAA	3	8937	8949	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	52617596
14	NC_021646	AGAA	3	9355	9366	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021646	C	13	9516	9528	13	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021646	TAG	4	10017	10029	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021646	AAAT	3	10132	10143	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021646	AAGA	3	10180	10190	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021646	GTTT	3	10293	10305	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_021646	ATA	4	10356	10367	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021646	ATA	4	10417	10427	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021646	ATA	4	10479	10490	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021646	ACTAAT	3	10547	10565	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
24	NC_021646	CAAA	3	11053	11064	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52617596
25	NC_021646	AAAT	3	12796	12808	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
26	NC_021646	A	12	13077	13088	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021646	TCTA	3	14043	14053	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021646	T	14	14164	14177	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_021646	TTTC	3	14267	14277	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021646	ATT	4	14468	14479	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021646	AAT	4	14498	14509	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021646	TA	6	15050	15060	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021646	AAT	4	15658	15670	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617596
34	NC_021646	TA	6	16667	16678	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52617596
35	NC_021646	AAAG	3	17689	17700	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617596
36	NC_021646	TA	7	17776	17788	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617596
37	NC_021646	T	15	18232	18246	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
38	NC_021646	TATC	4	18266	18281	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
39	NC_021646	TAGA	4	18290	18305	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_021646	TATC	4	18337	18352	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
41	NC_021646	TAGA	4	18361	18376	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
42	NC_021646	AT	6	18658	18668	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021646	TCTT	3	21124	21135	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617597
44	NC_021646	TAT	4	23618	23628	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
45	NC_021646	AGA	4	23749	23759	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52617597
46	NC_021646	ATTTTT	3	24051	24069	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
47	NC_021646	TAAA	3	24315	24326	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
48	NC_021646	TAT	4	24675	24687	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
49	NC_021646	TCTA	3	24696	24707	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
50	NC_021646	ATTT	3	24747	24759	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_021646	TAAT	3	24780	24790	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021646	ATTTTT	3	24920	24938	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
53	NC_021646	TTA	4	24963	24973	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_021646	ATATAA	3	25006	25024	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
55	NC_021646	CT	7	25804	25816	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021646	AAGAAA	3	25881	25899	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_021646	AAGC	3	26540	26550	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52617597
58	NC_021646	TA	6	26844	26854	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617597
59	NC_021646	AATA	3	28576	28586	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021646	ATT	4	28925	28938	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_021646	TA	7	29785	29798	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_021646	ATA	4	29923	29934	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021646	AATAA	3	30373	30387	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
64	NC_021646	ATCAT	3	30462	30476	15	40 %	40 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021646	TTTCT	3	30879	30892	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021646	TGTT	3	31411	31422	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021646	A	16	31853	31868	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021646	AT	7	32105	32118	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_021646	TAGAA	3	32312	32326	15	60 %	20 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_021646	AATT	3	32596	32607	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_021646	ACAA	3	32726	32736	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021646	TTCA	3	32901	32912	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021646	TTTC	3	33098	33108	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021646	AATT	3	33149	33161	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
75	NC_021646	AATCT	3	33242	33255	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
76	NC_021646	ATAGAT	3	33718	33735	18	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
77	NC_021646	A	13	33932	33944	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_021646	AT	6	34050	34060	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_021646	ATA	4	34394	34405	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021646	A	12	35399	35410	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52617597
81	NC_021646	AAC	4	38018	38029	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52617597
82	NC_021646	A	12	38666	38677	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52617597
83	NC_021646	GAA	4	39528	39540	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52617597
84	NC_021646	GGTC	3	39953	39964	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	52617597
85	NC_021646	CAT	4	41340	41351	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52617598
86	NC_021646	A	13	43224	43236	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52617598
87	NC_021646	TAA	4	46303	46314	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021646	ATATA	3	46333	46346	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_021646	AAAT	3	46396	46406	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_021646	AAT	4	46443	46454	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021646	ACTT	3	46605	46615	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617598
92	NC_021646	GTT	5	47089	47103	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52617598
93	NC_021646	TAA	4	47500	47510	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_021646	AT	7	47748	47760	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
95	NC_021646	GAAA	3	47991	48001	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_021646	TAT	4	48031	48042	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
97	NC_021646	CTG	4	48189	48200	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617598
98	NC_021646	CTCTT	3	48590	48603	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
99	NC_021646	AT	8	48762	48777	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
100	NC_021646	TA	7	48787	48800	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
101	NC_021646	A	13	49494	49506	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52617598
102	NC_021646	AATT	3	49936	49948	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617598
103	NC_021646	TAAA	3	50213	50224	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_021646	TGT	4	50451	50462	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52617598
105	NC_021646	AATATA	3	51850	51866	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
106	NC_021646	A	12	51893	51904	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
107	NC_021646	A	13	52446	52458	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
108	NC_021646	AAAT	4	53094	53109	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
109	NC_021646	TTTTTG	3	53201	53219	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
110	NC_021646	AT	6	53263	53273	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_021646	GAT	4	54360	54370	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
112	NC_021646	AAAG	3	54590	54600	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617598
113	NC_021646	TTTTG	3	54774	54787	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021646	TA	6	54816	54829	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
115	NC_021646	TTTA	3	54951	54961	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
116	NC_021646	TTTC	3	55404	55415	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021646	TAAA	3	56329	56339	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52617598
118	NC_021646	ATAA	3	56388	56400	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52617598
119	NC_021646	ATTT	3	56608	56618	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617598
120	NC_021646	T	16	57262	57277	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
121	NC_021646	TTAT	3	57336	57348	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_021646	ATG	4	57884	57895	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617598
123	NC_021646	AAT	5	58000	58014	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52617598
124	NC_021646	AT	6	59097	59107	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
125	NC_021646	TA	7	59146	59159	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
126	NC_021646	ATAAAT	3	59223	59240	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
127	NC_021646	ATA	4	59247	59259	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
128	NC_021646	AT	6	59265	59275	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
129	NC_021646	TTCT	3	59637	59648	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
130	NC_021646	TATT	3	60153	60163	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
131	NC_021646	A	13	60188	60200	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
132	NC_021646	TAT	4	60257	60267	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
133	NC_021646	TA	7	63548	63560	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_021646	TTCT	4	64310	64324	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
135	NC_021646	TTG	4	64553	64564	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
136	NC_021646	AAAT	3	64600	64612	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
137	NC_021646	AT	6	64705	64715	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
138	NC_021646	AT	8	65675	65690	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
139	NC_021646	AT	8	65971	65987	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
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249	NC_021646	CATT	3	126029	126039	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617600
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252	NC_021646	TA	6	127132	127142	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617600
253	NC_021646	TATT	3	127173	127183	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617600
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255	NC_021646	TTTTC	3	133336	133350	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52617600
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257	NC_021646	AATAGA	3	137380	137396	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	52617600
258	NC_021646	T	12	142493	142504	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
259	NC_021646	T	15	143159	143173	15	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
260	NC_021646	TCAA	3	143773	143785	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617603
261	NC_021646	ACC	4	145731	145741	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	52617603
262	NC_021646	AAAG	3	147384	147394	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617603
263	NC_021646	TATT	3	148428	148439	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52617603
264	NC_021646	TATT	3	150379	150390	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
265	NC_021646	ATC	4	150540	150550	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
266	NC_021646	ATC	4	151966	151976	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52617604
267	NC_021646	GAA	5	152432	152446	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	52617604

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Glycine stenophita voucher CSIRO:G1974 chloroplast