ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glycine cyrtoloba voucher CSIRO:G1267 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021645	AAGT	3	1023	1033	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52617587
2	NC_021645	TA	7	1614	1627	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_021645	T	15	1924	1938	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
4	NC_021645	TCT	5	2114	2127	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	52617587
5	NC_021645	ATAA	3	2612	2623	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617587
6	NC_021645	ATA	4	2973	2984	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617587
7	NC_021645	AAAT	4	3944	3958	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_021645	A	13	4375	4387	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021645	TAAAA	3	4459	4472	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
10	NC_021645	TA	6	4517	4528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021645	TAT	4	4841	4851	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021645	ATCGAA	3	4975	4993	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
13	NC_021645	AT	19	5198	5233	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021645	A	13	7212	7224	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
15	NC_021645	GGAA	3	8955	8967	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	52617587
16	NC_021645	AGAA	3	9373	9384	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
17	NC_021645	C	12	9534	9545	12	0 %	0 %	0 %	100 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021645	A	15	9546	9560	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_021645	TAG	4	10038	10050	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_021645	A	12	10151	10162	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021645	AAGA	3	10195	10205	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021645	GTTT	3	10308	10320	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021645	ATA	4	10371	10382	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021645	ATA	4	10494	10505	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021645	ACTAAT	3	10569	10587	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
26	NC_021645	CAAA	3	11071	11082	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52617587
27	NC_021645	AAAT	3	12821	12833	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
28	NC_021645	A	14	13102	13115	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_021645	TCTA	3	14064	14074	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
30	NC_021645	T	13	14279	14291	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021645	AACAAA	3	14322	14339	18	83.33 %	0 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
32	NC_021645	ATT	4	14487	14498	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_021645	AAT	4	14517	14528	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
34	NC_021645	AAT	4	15677	15689	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52617588
35	NC_021645	TA	6	16691	16701	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617588
36	NC_021645	AAAG	3	17711	17722	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617588
37	NC_021645	TA	7	17798	17810	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617588
38	NC_021645	TATC	4	18287	18302	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
39	NC_021645	TAGA	4	18311	18326	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
40	NC_021645	TCTT	3	21056	21067	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617588
41	NC_021645	TAT	4	23550	23560	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_021645	AGA	4	23681	23691	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52617588
43	NC_021645	TTTA	3	23986	23996	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021645	TAAA	3	24235	24246	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021645	ATTA	3	24574	24584	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021645	TAT	4	24621	24633	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
47	NC_021645	TCTA	3	24642	24653	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021645	TAAT	3	24735	24745	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_021645	ATAA	4	24816	24831	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
50	NC_021645	ATATAA	3	24965	24983	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
51	NC_021645	ATTT	3	25447	25458	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021645	CT	7	25762	25774	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
53	NC_021645	AAGAAA	3	25840	25858	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_021645	AAGC	3	26499	26509	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52617588
55	NC_021645	TA	6	26803	26813	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617588
56	NC_021645	TA	6	28471	28482	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021645	GA	6	28481	28492	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
58	NC_021645	ATT	4	28888	28901	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_021645	AAAG	3	28933	28944	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
60	NC_021645	TA	7	29748	29761	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_021645	ATA	5	29886	29900	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_021645	TTTCT	3	30835	30848	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021645	TGTT	3	31382	31393	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021645	A	16	31819	31834	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
65	NC_021645	AT	6	32070	32081	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021645	AATT	3	32551	32562	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021645	ACAA	3	32690	32700	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
68	NC_021645	T	15	32730	32744	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
69	NC_021645	TTCA	3	32870	32881	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
70	NC_021645	TTAA	3	33111	33123	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021645	TA	7	33170	33184	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_021645	AATCT	3	33229	33242	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
73	NC_021645	AT	6	33865	33875	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021645	ATA	4	34209	34220	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_021645	A	12	35213	35224	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52617589
76	NC_021645	AAC	4	37832	37843	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52617589
77	NC_021645	CAAA	3	38547	38558	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52617589
78	NC_021645	A	17	38819	38835	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	52617589
79	NC_021645	CTTTT	3	38893	38906	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	52617589
80	NC_021645	GAA	4	39341	39353	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52617589
81	NC_021645	GGTC	3	39766	39777	12	0 %	25 %	50 %	25 %	8 %	52617589
82	NC_021645	CAT	4	41153	41164	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52617589
83	NC_021645	A	13	43037	43049	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52617589
84	NC_021645	TAA	4	46107	46118	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_021645	AAAT	3	46200	46210	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_021645	AAT	4	46247	46258	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
87	NC_021645	ACTT	3	46414	46424	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617589
88	NC_021645	GTT	5	46898	46912	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52617589
89	NC_021645	TAA	4	47436	47446	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
90	NC_021645	AT	7	47683	47695	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
91	NC_021645	GAAA	3	47926	47936	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021645	TAT	4	47966	47977	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
93	NC_021645	CTG	4	48124	48135	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52617589
94	NC_021645	CTCTT	3	48525	48538	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
95	NC_021645	AT	7	48695	48708	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
96	NC_021645	TA	7	48718	48731	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
97	NC_021645	TA	6	49258	49268	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617589
98	NC_021645	AATT	3	49868	49880	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52617589
99	NC_021645	TAAA	3	50145	50156	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
100	NC_021645	TGT	4	50383	50394	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52617589
101	NC_021645	AATATA	3	51782	51798	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
102	NC_021645	A	13	51820	51832	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
103	NC_021645	T	16	51983	51998	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
104	NC_021645	AATA	4	52196	52212	17	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
105	NC_021645	AT	8	53203	53217	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
106	NC_021645	GAT	5	54329	54342	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
107	NC_021645	AAAG	3	54535	54545	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617590
108	NC_021645	TTTTTG	3	54718	54735	18	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
109	NC_021645	TA	6	54764	54777	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
110	NC_021645	TTTA	3	54899	54909	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
111	NC_021645	TTTC	3	55357	55368	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
112	NC_021645	TTTCTT	3	55461	55478	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
113	NC_021645	T	12	55809	55820	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	52617590
114	NC_021645	ATAA	3	56366	56378	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	52617590
115	NC_021645	ATTT	3	56585	56595	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617590
116	NC_021645	TTAT	3	57294	57306	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
117	NC_021645	TAT	4	57360	57370	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
118	NC_021645	ATG	4	57825	57836	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52617590
119	NC_021645	AAT	5	57941	57955	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52617590
120	NC_021645	AT	6	59041	59052	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_021645	A	13	59151	59163	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
122	NC_021645	TA	6	59161	59171	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
123	NC_021645	ATA	4	59187	59199	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_021645	TTCT	3	59563	59574	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021645	TATT	3	60079	60089	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_021645	TAT	4	60181	60191	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
127	NC_021645	A	12	60389	60400	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
128	NC_021645	A	13	62843	62855	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
129	NC_021645	A	12	62905	62916	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_021645	TA	7	63264	63276	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_021645	TTCT	4	64026	64040	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_021645	TTG	4	64269	64280	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_021645	AAATT	3	64316	64329	14	60 %	40 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_021645	AT	6	64421	64431	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_021645	AT	11	65390	65410	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
136	NC_021645	TAGGGA	3	65448	65465	18	33.33 %	16.67 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
137	NC_021645	AT	17	65599	65632	34	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
138	NC_021645	AGAATA	3	65742	65760	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
139	NC_021645	TTAATC	3	66359	66376	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
140	NC_021645	AATT	3	66406	66416	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
141	NC_021645	GAAA	3	66678	66689	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52617591
142	NC_021645	A	12	67231	67242	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52617591
143	NC_021645	AAGA	3	67353	67363	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_021645	TA	7	68019	68032	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
145	NC_021645	AAAT	3	68055	68065	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_021645	CTTT	3	68195	68206	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021645	AT	6	68582	68593	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
148	NC_021645	AT	7	68833	68847	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52617591
149	NC_021645	TTAT	3	69008	69018	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617591
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152	NC_021645	GATA	3	69814	69826	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	52617591
153	NC_021645	TAT	4	69923	69935	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52617591
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161	NC_021645	AAT	4	74410	74421	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617591
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165	NC_021645	CTTT	3	79119	79130	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52617591
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177	NC_021645	AATT	3	82207	82217	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617591
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179	NC_021645	T	13	83050	83062	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	52617591
180	NC_021645	AATT	3	83205	83216	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52617591
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237	NC_021645	TATAT	3	124021	124035	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	52617591
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242	NC_021645	CATT	3	125719	125729	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52617591
243	NC_021645	TTCA	3	126046	126058	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	52617591
244	NC_021645	ATAA	3	126717	126728	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52617591
245	NC_021645	TA	6	126822	126832	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52617591
246	NC_021645	TATT	3	126863	126873	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52617591
247	NC_021645	TCGG	3	130195	130205	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	52617591
248	NC_021645	TTTTC	3	133043	133057	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52617591
249	NC_021645	TAA	4	136752	136763	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52617591
250	NC_021645	AATAGA	3	137087	137103	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	52617591
251	NC_021645	T	14	142857	142870	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
252	NC_021645	TCAA	3	143470	143482	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617595
253	NC_021645	ATCA	3	145239	145251	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52617595
254	NC_021645	ACC	4	145428	145438	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	52617595
255	NC_021645	AAAG	3	147081	147091	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52617595
256	NC_021645	TATT	3	148125	148136	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52617595
257	NC_021645	TATT	3	150076	150087	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
258	NC_021645	ATC	4	150237	150247	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
259	NC_021645	ATC	4	151663	151673	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52617595
260	NC_021645	GAA	5	152129	152143	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	52617595

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Glycine cyrtoloba voucher CSIRO:G1267 chloroplast