ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Phaeocystis globosa strain Pg-G(A) chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021637	TTAA	3	67	78	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021637	CAATAC	3	649	667	19	50 %	16.67 %	0 %	33.33 %	5 %	52085064
3	NC_021637	TAAA	3	2353	2363	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52085065
4	NC_021637	TTTTC	3	2549	2562	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	52085065
5	NC_021637	TGCA	3	4953	4963	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	52085065
6	NC_021637	AAAT	3	6088	6099	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021637	GTTT	3	7911	7921	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	52085065
8	NC_021637	TTCC	3	9578	9588	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	52085065
9	NC_021637	TAA	4	10055	10067	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52085065
10	NC_021637	TTA	4	10824	10836	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021637	TAT	4	14237	14249	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	52085066
12	NC_021637	TTTA	3	14319	14330	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021637	TA	6	15105	15115	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52085066
14	NC_021637	ATT	4	16470	16481	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52085066
15	NC_021637	TGAT	3	17435	17446	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	52085066
16	NC_021637	TAAA	3	17851	17861	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_021637	TAAA	3	18197	18207	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52085066
18	NC_021637	TCT	4	20186	20196	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52085066
19	NC_021637	CTG	4	20450	20461	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085066
20	NC_021637	ATT	4	21230	21240	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021637	TAAA	5	21267	21287	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021637	ATTACA	3	21316	21332	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	52085066
23	NC_021637	TAT	4	21420	21430	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52085066
24	NC_021637	TTTA	3	21895	21906	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021637	TGG	4	22996	23006	11	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	9 %	52085066
26	NC_021637	ATTT	3	25016	25026	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52085067
27	NC_021637	GTTGGT	3	31884	31901	18	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	52085068
28	NC_021637	AGTT	3	33594	33604	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52085068
29	NC_021637	CGT	4	33652	33663	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085068
30	NC_021637	CGT	4	34019	34030	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085068
31	NC_021637	ATT	4	34569	34580	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021637	TTTA	3	35631	35642	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_021637	ATTT	3	36086	36096	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52085068
34	NC_021637	AATT	3	36814	36825	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085069
35	NC_021637	TGA	4	37717	37728	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52085069
36	NC_021637	ATTA	3	38517	38528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085069
37	NC_021637	AT	6	38883	38893	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021637	TAAAAA	3	39070	39087	18	83.33 %	16.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
39	NC_021637	TATT	3	39144	39155	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021637	AT	7	39599	39612	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_021637	ACA	4	46345	46356	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52085069
42	NC_021637	CAA	4	51191	51202	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52085069
43	NC_021637	AT	7	52872	52885	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
44	NC_021637	ACTT	3	55225	55235	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	52085070
45	NC_021637	ATT	4	55473	55483	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52085070
46	NC_021637	CCA	4	57311	57322	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	52085070
47	NC_021637	CTAA	3	57671	57681	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	52085070
48	NC_021637	CAT	4	59907	59917	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52085070
49	NC_021637	ATTA	3	60843	60853	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021637	ATAA	3	61154	61164	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	52085071
51	NC_021637	CTGC	3	62081	62093	13	0 %	25 %	25 %	50 %	7 %	Non-Coding
52	NC_021637	AATT	3	62535	62546	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
53	NC_021637	AATT	3	62810	62821	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021637	GGAA	3	62883	62894	12	50 %	0 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
55	NC_021637	TTAT	3	63501	63511	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_021637	AAG	4	63739	63750	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	52085071
57	NC_021637	TAT	4	63819	63829	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
58	NC_021637	ATGCT	3	64280	64294	15	20 %	40 %	20 %	20 %	6 %	52085071
59	NC_021637	TGT	4	64759	64769	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52085071
60	NC_021637	ATT	4	66365	66376	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021637	TCT	4	66408	66419	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52085072
62	NC_021637	CGAT	3	66529	66539	11	25 %	25 %	25 %	25 %	9 %	52085072
63	NC_021637	ATTG	3	66753	66763	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	52085072
64	NC_021637	ATTT	3	67518	67528	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021637	CAT	4	67989	67999	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52085072
66	NC_021637	ATTA	3	68569	68579	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
67	NC_021637	TAAA	3	70554	70565	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52085072
68	NC_021637	AT	6	73198	73209	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021637	GTT	4	73423	73433	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52085072
70	NC_021637	AAAT	3	74400	74410	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
71	NC_021637	TAT	4	74673	74684	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	52085073
72	NC_021637	GCT	4	76758	76769	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085073
73	NC_021637	AAAG	3	77435	77446	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021637	AT	8	77758	77772	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
75	NC_021637	TAGA	3	78992	79003	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52085073
76	NC_021637	TAATT	3	79783	79796	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
77	NC_021637	TGT	4	80057	80068	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52085073
78	NC_021637	TGT	4	80472	80482	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	52085073
79	NC_021637	AGA	4	81672	81684	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52085073
80	NC_021637	TGC	4	81739	81749	11	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	9 %	52085073
81	NC_021637	TAA	4	82240	82251	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52085073
82	NC_021637	AT	6	82634	82645	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085073
83	NC_021637	CTAA	3	83475	83486	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021637	TTTA	3	84148	84159	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
85	NC_021637	ATA	5	84798	84812	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	52085074
86	NC_021637	CTT	4	87677	87687	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	52085074
87	NC_021637	TCGT	3	87787	87797	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	52085074
88	NC_021637	CGTC	3	89115	89125	11	0 %	25 %	25 %	50 %	9 %	52085074
89	NC_021637	TAAG	3	90385	90396	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	52085074
90	NC_021637	TAT	4	92537	92547	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	52085074
91	NC_021637	AAAT	3	94950	94962	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
92	NC_021637	TAA	4	95082	95092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
93	NC_021637	CTTT	3	96041	96052	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52085074
94	NC_021637	ACCA	3	96554	96566	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	52085074
95	NC_021637	TAAT	3	96753	96764	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085074
96	NC_021637	GCTT	3	96785	96795	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	52085074
97	NC_021637	CACCC	3	99039	99053	15	20 %	0 %	0 %	80 %	6 %	Non-Coding
98	NC_021637	ATTA	3	100613	100624	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085075
99	NC_021637	TA	6	101581	101591	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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