ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Glycine tomentella voucher CSIRO:G1403 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021636	TTCT	3	133	144	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
2	NC_021636	AAGT	3	1013	1023	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	52085056
3	NC_021636	CATT	3	1557	1569	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
4	NC_021636	TA	6	1604	1615	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021636	TCT	4	2107	2118	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52085056
6	NC_021636	ATAA	3	2603	2614	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	52085056
7	NC_021636	ATA	4	2964	2975	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52085056
8	NC_021636	AAAT	4	3936	3950	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_021636	ATT	4	4508	4518	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_021636	TA	9	4518	4534	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
11	NC_021636	TAT	4	4840	4851	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021636	TAAA	3	4887	4898	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021636	ATCGAA	3	4958	4976	19	50 %	16.67 %	16.67 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
14	NC_021636	AT	24	5170	5215	46	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021636	A	13	7206	7218	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_021636	GGAA	3	9078	9090	13	50 %	0 %	50 %	0 %	7 %	52085056
17	NC_021636	AAAT	3	10278	10289	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
18	NC_021636	AAGA	3	10326	10336	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021636	GTTT	3	10439	10451	13	0 %	75 %	25 %	0 %	7 %	Non-Coding
20	NC_021636	ATA	4	10502	10513	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021636	ATA	4	10521	10532	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021636	ATA	4	10582	10592	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021636	ATA	4	10639	10650	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021636	ACTAAT	3	10707	10725	19	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
25	NC_021636	CAAA	3	11209	11220	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	52085057
26	NC_021636	CAA	4	12704	12715	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021636	A	18	12953	12970	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
28	NC_021636	A	13	13236	13248	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_021636	TTTTG	3	13292	13306	15	0 %	80 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
30	NC_021636	A	12	13366	13377	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021636	A	18	13441	13458	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
32	NC_021636	TCTA	3	14206	14216	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021636	TTTC	3	14424	14434	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021636	ATT	4	14623	14634	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021636	AAT	4	14653	14664	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021636	AT	6	14810	14820	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021636	AAT	4	15805	15817	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	52085057
38	NC_021636	TA	6	16812	16823	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085057
39	NC_021636	AAAG	3	17834	17845	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52085057
40	NC_021636	TA	7	17921	17933	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52085057
41	NC_021636	T	13	18381	18393	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_021636	TATC	4	18413	18428	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
43	NC_021636	TAGA	4	18437	18452	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
44	NC_021636	TCTT	3	21174	21185	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52085057
45	NC_021636	TAT	4	23668	23678	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
46	NC_021636	AGA	4	23799	23809	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	52085057
47	NC_021636	ATTTTT	3	24101	24119	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
48	NC_021636	TAAA	3	24353	24364	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021636	ATTA	3	24694	24704	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
50	NC_021636	TAT	4	24729	24741	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
51	NC_021636	TCTA	3	24750	24761	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021636	AAGA	3	24817	24827	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
53	NC_021636	ATTTTT	3	24974	24992	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
54	NC_021636	TCTAT	3	24993	25007	15	20 %	60 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
55	NC_021636	CT	7	25857	25869	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021636	AAGAAA	3	25935	25953	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
57	NC_021636	AAGC	3	26606	26616	11	50 %	0 %	25 %	25 %	9 %	52085057
58	NC_021636	TA	6	26910	26920	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52085057
59	NC_021636	AATA	3	28642	28652	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021636	ATT	4	28986	28999	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
61	NC_021636	ATT	4	29001	29011	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021636	AATTGA	4	29213	29236	24	50 %	33.33 %	16.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
63	NC_021636	TTCT	3	29690	29701	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
64	NC_021636	ATA	4	29997	30008	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021636	A	14	30451	30464	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021636	A	12	31385	31396	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021636	TGTT	3	31496	31507	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021636	A	12	31892	31903	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_021636	A	13	31936	31948	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_021636	AT	6	32182	32193	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
71	NC_021636	TAATA	3	32389	32403	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
72	NC_021636	AATT	3	32670	32681	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
73	NC_021636	TTCA	3	32977	32988	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021636	AATCT	3	33318	33331	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
75	NC_021636	AT	6	33806	33817	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
76	NC_021636	ATA	4	34403	34414	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_021636	A	12	35386	35397	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52085058
78	NC_021636	AAC	4	38005	38016	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	52085058
79	NC_021636	A	14	38653	38666	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52085058
80	NC_021636	A	14	38980	38993	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52085058
81	NC_021636	CTTTT	3	39103	39117	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52085058
82	NC_021636	GAA	4	39490	39502	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	52085058
83	NC_021636	CAT	4	41302	41313	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	52085058
84	NC_021636	A	13	43186	43198	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	52085058
85	NC_021636	AAT	4	46309	46320	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
86	NC_021636	GTT	5	46960	46974	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	52085058
87	NC_021636	TAGA	4	47209	47224	16	50 %	25 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
88	NC_021636	A	14	47274	47287	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_021636	TTAA	3	47297	47308	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_021636	A	12	47434	47445	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021636	TAA	4	47530	47540	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021636	AT	7	47778	47790	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
93	NC_021636	GAAA	3	48019	48029	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
94	NC_021636	TAT	4	48059	48070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
95	NC_021636	CTG	4	48217	48228	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085058
96	NC_021636	CTCTT	3	48618	48631	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	Non-Coding
97	NC_021636	AT	8	48791	48806	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
98	NC_021636	TA	7	48812	48825	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
99	NC_021636	AATT	3	49957	49969	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	52085058
100	NC_021636	TAAA	3	50234	50245	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
101	NC_021636	TGT	4	50472	50483	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	52085058
102	NC_021636	A	16	51914	51929	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
103	NC_021636	AAAT	3	52480	52491	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
104	NC_021636	TAAA	3	52977	52987	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
105	NC_021636	AT	6	53244	53254	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
106	NC_021636	T	13	53616	53628	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
107	NC_021636	GAT	4	54347	54357	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
108	NC_021636	AAAG	3	54553	54563	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52085059
109	NC_021636	TTTTTG	3	54736	54752	17	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
110	NC_021636	TA	6	54781	54794	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
111	NC_021636	TTTA	3	54916	54927	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
112	NC_021636	TA	6	55021	55032	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
113	NC_021636	TTTC	3	55384	55395	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
114	NC_021636	TATCTA	3	55440	55456	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	Non-Coding
115	NC_021636	ATTT	3	56572	56582	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52085059
116	NC_021636	A	12	57123	57134	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
117	NC_021636	TTAT	3	57288	57300	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
118	NC_021636	TAT	4	57370	57380	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
119	NC_021636	ATG	4	57853	57864	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	52085059
120	NC_021636	AAT	4	57897	57908	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52085059
121	NC_021636	AT	6	58993	59003	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
122	NC_021636	ATA	4	59088	59099	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_021636	ATA	4	59121	59133	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_021636	T	12	60019	60030	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
125	NC_021636	TAT	4	60116	60126	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
126	NC_021636	TTCT	3	60273	60283	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
127	NC_021636	TTC	4	62205	62216	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	52085059
128	NC_021636	AATA	3	62398	62409	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
129	NC_021636	A	14	63065	63078	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
130	NC_021636	TA	7	63423	63435	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
131	NC_021636	TTCT	4	64185	64199	15	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
132	NC_021636	TTG	4	64428	64439	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
133	NC_021636	T	13	64544	64556	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
134	NC_021636	AT	6	64582	64592	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
135	NC_021636	AT	8	65551	65566	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
136	NC_021636	AT	18	65839	65874	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
137	NC_021636	AGAATA	3	65978	65996	19	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	10 %	Non-Coding
138	NC_021636	TTTA	3	66271	66282	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
139	NC_021636	AATT	3	66632	66642	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
140	NC_021636	GAAA	3	66903	66914	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	52085060
141	NC_021636	A	12	67456	67467	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	52085060
142	NC_021636	AATT	3	67472	67482	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	52085060
143	NC_021636	AAGA	3	67574	67584	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
144	NC_021636	AAAT	3	67679	67690	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
145	NC_021636	AAAT	3	68272	68282	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
146	NC_021636	CTTT	3	68408	68419	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
147	NC_021636	AT	7	69008	69022	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	52085060
148	NC_021636	CTG	4	69231	69242	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	52085060
149	NC_021636	AAGA	3	69728	69738	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52085060
150	NC_021636	A	17	69964	69980	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	52085060
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175	NC_021636	TA	6	81517	81528	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085060
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178	NC_021636	TTCT	3	82127	82138	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	52085060
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180	NC_021636	AATT	3	83411	83422	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	52085060
181	NC_021636	T	13	83454	83466	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	52085060
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233	NC_021636	TATT	3	122458	122469	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	52085060
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242	NC_021636	TATT	3	127152	127162	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	52085060
243	NC_021636	TCGG	3	130463	130473	11	0 %	25 %	50 %	25 %	9 %	52085060
244	NC_021636	TTTTC	3	133450	133464	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	52085060
245	NC_021636	TAA	4	137158	137169	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	52085060
246	NC_021636	AATAGA	3	137493	137509	17	66.67 %	16.67 %	16.67 %	0 %	5 %	52085060
247	NC_021636	T	12	142600	142611	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
248	NC_021636	T	18	143266	143283	18	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
249	NC_021636	TCAA	3	143883	143895	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52085064
250	NC_021636	ATCA	3	145652	145664	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	52085064
251	NC_021636	ACC	4	145841	145851	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	52085064
252	NC_021636	AAAG	3	147494	147504	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	52085064
253	NC_021636	TATT	3	148538	148549	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	52085064
254	NC_021636	TATT	3	150489	150500	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
255	NC_021636	ATC	4	150650	150660	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
256	NC_021636	ATC	4	152076	152086	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	52085064
257	NC_021636	GAA	5	152542	152556	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	52085064

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Glycine tomentella voucher CSIRO:G1403 chloroplast