ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Grateloupia taiwanensis plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021618	TTA	4	800	811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970496
2	NC_021618	ATA	4	8357	8369	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_021618	ATA	4	8895	8906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970484
4	NC_021618	GTT	4	10374	10385	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970486
5	NC_021618	ATA	4	12049	12060	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021618	TAC	4	12109	12120	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970486
7	NC_021618	TGC	4	12127	12138	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51970486
8	NC_021618	CTC	4	15570	15581	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	51970483
9	NC_021618	TAA	4	16895	16906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021618	TTA	4	17391	17401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021618	AAT	4	20242	20253	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970487
12	NC_021618	AAC	4	23107	23118	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51970486
13	NC_021618	ATT	4	31937	31947	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970503
14	NC_021618	ATA	4	33141	33152	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021618	AAT	4	33851	33863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_021618	TCA	4	37299	37310	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970485
17	NC_021618	AAT	4	39408	39419	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970506
18	NC_021618	ATA	4	39819	39830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970506
19	NC_021618	TAA	4	40894	40906	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970502
20	NC_021618	AAT	4	43521	43531	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970486
21	NC_021618	AAG	4	45362	45373	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970494
22	NC_021618	AAT	4	46677	46689	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970496
23	NC_021618	TAA	5	47392	47407	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
24	NC_021618	AAT	4	47586	47597	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970498
25	NC_021618	TAC	4	47672	47683	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970498
26	NC_021618	ATT	4	50659	50671	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970505
27	NC_021618	ACA	4	51246	51256	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	51970505
28	NC_021618	CTA	4	51664	51674	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51970505
29	NC_021618	AAT	4	51872	51884	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970505
30	NC_021618	GAA	4	61254	61265	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970505
31	NC_021618	ACT	4	62850	62860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021618	TAA	4	71597	71607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021618	TAG	4	75568	75578	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021618	ATT	4	75747	75758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970494
35	NC_021618	AGG	4	77224	77235	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51970494
36	NC_021618	ACA	4	81365	81376	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51970487
37	NC_021618	TAT	4	83295	83306	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970502
38	NC_021618	GGA	4	83358	83369	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51970502
39	NC_021618	TAA	4	85102	85112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970502
40	NC_021618	ATA	5	86601	86615	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51970502
41	NC_021618	ATT	4	88120	88130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970505
42	NC_021618	TAA	4	88276	88287	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
43	NC_021618	GTA	5	90374	90387	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51970492
44	NC_021618	TAC	4	98387	98398	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970485
45	NC_021618	TCT	4	101051	101061	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51970489
46	NC_021618	TCT	4	102480	102490	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51970490
47	NC_021618	TAA	4	104241	104252	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021618	ATA	4	104277	104287	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
49	NC_021618	ATA	4	105103	105114	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970484
50	NC_021618	ATG	4	105253	105264	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970484
51	NC_021618	TCT	4	106662	106674	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	51970487
52	NC_021618	TAA	4	108239	108250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970493
53	NC_021618	ATA	4	110136	110146	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970494
54	NC_021618	AAG	4	112032	112043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970492
55	NC_021618	TAT	4	113160	113171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970503
56	NC_021618	TTC	4	118904	118915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970502
57	NC_021618	TCT	4	121815	121826	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970498
58	NC_021618	TAT	4	122840	122852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970497
59	NC_021618	ATT	4	127172	127184	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
60	NC_021618	TGT	4	127312	127323	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970486
61	NC_021618	TTA	4	129235	129246	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021618	TAA	4	130682	130692	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_021618	GAT	4	132437	132449	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51970493
64	NC_021618	TGT	4	135117	135128	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970493
65	NC_021618	GTT	4	135823	135834	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970483
66	NC_021618	TTA	4	135865	135877	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970483
67	NC_021618	AGT	4	136756	136767	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970505
68	NC_021618	TAT	4	136993	137004	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970505
69	NC_021618	TAA	5	137677	137691	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51970505
70	NC_021618	TAT	4	137841	137851	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970505
71	NC_021618	TAA	4	138118	138128	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970505
72	NC_021618	TAT	5	139351	139364	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_021618	ATG	4	144985	144996	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970492
74	NC_021618	TAA	4	148026	148037	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970491
75	NC_021618	TAT	4	149670	149680	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970492
76	NC_021618	ATA	4	150230	150241	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970492
77	NC_021618	ATA	5	150664	150678	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51970505
78	NC_021618	TAA	4	153583	153593	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970484
79	NC_021618	TAT	4	154272	154284	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
80	NC_021618	GTT	4	156388	156399	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970484
81	NC_021618	TGT	5	157263	157277	15	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	6 %	51970484
82	NC_021618	AGC	4	159664	159675	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51970491
83	NC_021618	ATT	4	159905	159916	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970491
84	NC_021618	ATT	4	167507	167517	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970499
85	NC_021618	TAA	4	169164	169175	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970499
86	NC_021618	ATT	4	170786	170796	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_021618	ATT	4	170805	170816	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970500
88	NC_021618	AAT	4	172110	172120	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970502
89	NC_021618	TTA	4	172838	172849	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970485
90	NC_021618	GGT	4	176299	176310	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	51970484
91	NC_021618	AAT	4	177204	177214	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970503
92	NC_021618	GTT	4	177503	177513	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51970503
93	NC_021618	AAT	4	179052	179064	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970504
94	NC_021618	TAA	4	181900	181910	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
95	NC_021618	TGA	4	182759	182769	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970492
96	NC_021618	TTA	4	182933	182944	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970492
97	NC_021618	GTT	4	183022	183032	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51970492
98	NC_021618	AAT	4	184594	184605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
99	NC_021618	TAT	4	187664	187674	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_021618	ATA	4	189331	189342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding

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Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Grateloupia taiwanensis plastid