ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Grateloupia taiwanensis plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021618	TTA	4	800	811	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970496
2	NC_021618	ACTCT	3	902	915	14	20 %	40 %	0 %	40 %	7 %	51970496
3	NC_021618	TTAAT	3	2030	2043	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
4	NC_021618	AGAA	3	3581	3592	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970504
5	NC_021618	TAAA	3	5256	5266	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51970500
6	NC_021618	AT	6	5998	6008	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970506
7	NC_021618	TA	6	7285	7296	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021618	ATTA	3	7330	7342	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
9	NC_021618	AAAT	3	7920	7930	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_021618	ATA	4	8357	8369	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021618	TAAT	3	8803	8814	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021618	ATA	4	8895	8906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970484
13	NC_021618	TTAG	3	9815	9826	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	51970503
14	NC_021618	GTT	4	10374	10385	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970486
15	NC_021618	ATA	4	12049	12060	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021618	TAC	4	12109	12120	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970486
17	NC_021618	TGC	4	12127	12138	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51970486
18	NC_021618	AT	7	12765	12777	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
19	NC_021618	CTC	4	15570	15581	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	51970483
20	NC_021618	TAAA	3	16461	16473	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51970488
21	NC_021618	TAA	4	16895	16906	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021618	TTA	4	17391	17401	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
23	NC_021618	TAAA	3	17474	17484	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021618	TTAAAT	3	17499	17517	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_021618	TATT	3	17749	17760	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970487
26	NC_021618	AAT	4	20242	20253	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970487
27	NC_021618	AAC	4	23107	23118	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51970486
28	NC_021618	AAAT	3	24043	24053	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51970488
29	NC_021618	CAAT	3	24153	24163	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51970488
30	NC_021618	AATAC	3	24173	24186	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
31	NC_021618	TCAA	3	26825	26836	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	51970501
32	NC_021618	AAAT	3	27088	27100	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51970501
33	NC_021618	GTTT	3	29600	29610	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51970502
34	NC_021618	AATT	3	31288	31298	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970502
35	NC_021618	TTAA	3	31346	31356	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970502
36	NC_021618	ATT	4	31937	31947	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970503
37	NC_021618	ATA	4	33141	33152	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_021618	TTAA	4	33169	33183	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51970495
39	NC_021618	AAAT	3	33723	33734	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021618	AAT	4	33851	33863	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_021618	CAAA	3	35667	35677	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51970504
42	NC_021618	TCA	4	37299	37310	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970485
43	NC_021618	AAT	4	39408	39419	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970506
44	NC_021618	AT	8	39734	39748	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51970506
45	NC_021618	ATA	4	39819	39830	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970506
46	NC_021618	AAAT	5	40849	40868	20	75 %	25 %	0 %	0 %	10 %	51970502
47	NC_021618	TAA	4	40894	40906	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970502
48	NC_021618	AATA	4	42993	43008	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51970486
49	NC_021618	AAT	4	43521	43531	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970486
50	NC_021618	ACTC	3	44378	44388	11	25 %	25 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
51	NC_021618	AAG	4	45362	45373	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970494
52	NC_021618	TA	7	45825	45838	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_021618	TAGAA	3	45885	45899	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	51970496
54	NC_021618	AAT	4	46677	46689	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970496
55	NC_021618	TTAC	3	46989	47000	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51970496
56	NC_021618	TAA	5	47392	47407	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
57	NC_021618	AAT	4	47586	47597	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970498
58	NC_021618	TAC	4	47672	47683	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970498
59	NC_021618	TAAA	3	48061	48071	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021618	AT	6	49276	49286	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021618	AT	6	49632	49642	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
62	NC_021618	ATT	4	50659	50671	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970505
63	NC_021618	ACA	4	51246	51256	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	51970505
64	NC_021618	ATTT	3	51574	51585	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970505
65	NC_021618	CTA	4	51664	51674	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51970505
66	NC_021618	AAT	4	51872	51884	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51970505
67	NC_021618	CTAT	3	51981	51991	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51970505
68	NC_021618	TAAAA	3	54141	54154	14	80 %	20 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
69	NC_021618	CAAT	3	54277	54289	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	51970492
70	NC_021618	AT	6	55299	55311	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
71	NC_021618	AT	6	56433	56443	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
72	NC_021618	TTGA	3	56623	56633	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
73	NC_021618	AAAT	5	56655	56675	21	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021618	TTTA	3	60343	60354	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970504
75	NC_021618	TA	6	60863	60875	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
76	NC_021618	GAA	4	61254	61265	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970505
77	NC_021618	ACT	4	62850	62860	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
78	NC_021618	TA	9	62872	62888	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_021618	GCTTCA	3	64221	64239	19	16.67 %	33.33 %	16.67 %	33.33 %	10 %	Non-Coding
80	NC_021618	TCCT	3	66779	66791	13	0 %	50 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
81	NC_021618	TTTA	3	69295	69306	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970487
82	NC_021618	TTTA	3	70333	70344	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970487
83	NC_021618	TA	6	70935	70945	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_021618	TAA	4	71597	71607	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021618	TTTA	4	71753	71768	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_021618	GTTT	3	72897	72908	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	51970490
87	NC_021618	AT	6	73137	73148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021618	AAGA	3	74769	74780	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970490
89	NC_021618	A	13	75113	75125	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51970490
90	NC_021618	GTAAA	3	75523	75537	15	60 %	20 %	20 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_021618	TAG	4	75568	75578	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021618	ATT	4	75747	75758	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970494
93	NC_021618	AGG	4	77224	77235	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51970494
94	NC_021618	AGCT	3	78230	78242	13	25 %	25 %	25 %	25 %	7 %	51970503
95	NC_021618	AAGA	3	80203	80214	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970489
96	NC_021618	AT	7	80422	80434	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970489
97	NC_021618	ACA	4	81365	81376	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51970487
98	NC_021618	AAAC	3	81810	81820	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51970487
99	NC_021618	TAT	4	83295	83306	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970502
100	NC_021618	GGA	4	83358	83369	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51970502
101	NC_021618	TAAT	4	83909	83923	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
102	NC_021618	TTAA	3	84924	84936	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970502
103	NC_021618	TAA	4	85102	85112	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970502
104	NC_021618	ATA	5	86601	86615	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51970502
105	NC_021618	AAGA	3	87680	87691	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970500
106	NC_021618	GAAG	3	87987	87998	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	51970500
107	NC_021618	ATT	4	88120	88130	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51970505
108	NC_021618	TAAA	4	88159	88174	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	51970505
109	NC_021618	ATAG	3	88187	88198	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51970505
110	NC_021618	TAA	4	88276	88287	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
111	NC_021618	GTA	5	90374	90387	14	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51970492
112	NC_021618	TA	6	93642	93653	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51970489
113	NC_021618	AT	6	94290	94300	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
114	NC_021618	TAAA	3	94623	94634	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51970491
115	NC_021618	TA	6	96620	96630	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970486
116	NC_021618	AAATA	4	97129	97148	20	80 %	20 %	0 %	0 %	10 %	51970486
117	NC_021618	TA	6	97888	97898	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970486
118	NC_021618	TAC	4	98387	98398	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51970485
119	NC_021618	AATT	3	100883	100894	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
120	NC_021618	TCT	4	101051	101061	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51970489
121	NC_021618	ATTT	3	101199	101209	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51970489
122	NC_021618	TCT	4	102480	102490	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51970490
123	NC_021618	TC	6	103061	103071	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	51970490
124	NC_021618	TTGA	3	103499	103511	13	25 %	50 %	25 %	0 %	7 %	51970490
125	NC_021618	AAATT	4	104185	104205	21	60 %	40 %	0 %	0 %	4 %	Non-Coding
126	NC_021618	TAA	4	104241	104252	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
127	NC_021618	ATA	4	104277	104287	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
128	NC_021618	T	13	104319	104331	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51970504
129	NC_021618	TTTA	3	104604	104615	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
130	NC_021618	ATA	4	105103	105114	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970484
131	NC_021618	ATG	4	105253	105264	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970484
132	NC_021618	TTAT	3	105968	105979	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970487
133	NC_021618	TCT	4	106662	106674	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	51970487
134	NC_021618	ATTT	3	106775	106786	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970487
135	NC_021618	ATTA	3	108075	108087	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
136	NC_021618	TAA	4	108239	108250	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970493
137	NC_021618	ATA	4	110136	110146	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970494
138	NC_021618	TA	6	111057	111067	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970504
139	NC_021618	AAG	4	112032	112043	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970492
140	NC_021618	TA	8	112234	112248	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51970500
141	NC_021618	TAT	4	113160	113171	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51970503
142	NC_021618	ATTTT	3	115003	115017	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51970498
143	NC_021618	AT	7	115733	115745	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970497
144	NC_021618	TTTC	3	115770	115781	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51970497
145	NC_021618	TTGA	3	116145	116156	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	51970499
146	NC_021618	TGAT	3	117340	117351	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
147	NC_021618	AT	6	117988	117998	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970502
148	NC_021618	TAAG	3	118392	118403	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51970502
149	NC_021618	TTC	4	118904	118915	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970502
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151	NC_021618	TATT	3	120148	120159	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970497
152	NC_021618	TCT	4	121815	121826	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970498
153	NC_021618	TAT	4	122840	122852	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970497
154	NC_021618	ATTT	3	123652	123663	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970500
155	NC_021618	TTGT	3	124265	124275	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51970498
156	NC_021618	ATTT	3	126435	126446	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	51970497
157	NC_021618	ATT	4	127172	127184	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
158	NC_021618	TGT	4	127312	127323	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970486
159	NC_021618	TTA	4	129235	129246	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
160	NC_021618	TA	6	129587	129597	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
161	NC_021618	TA	6	129695	129705	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
162	NC_021618	TA	8	130185	130199	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
163	NC_021618	TAA	4	130682	130692	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
164	NC_021618	CATA	3	131911	131923	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	51970493
165	NC_021618	GAT	4	132437	132449	13	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	7 %	51970493
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167	NC_021618	TA	6	133883	133894	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51970493
168	NC_021618	TGT	4	135117	135128	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51970493
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173	NC_021618	AT	6	136308	136318	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
174	NC_021618	AGT	4	136756	136767	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970505
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179	NC_021618	TAT	5	139351	139364	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
180	NC_021618	AAAG	3	139387	139398	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
181	NC_021618	TTGA	3	139420	139431	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
182	NC_021618	TTTG	3	141239	141250	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	51970483
183	NC_021618	AATC	3	143521	143531	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
184	NC_021618	ATG	4	144985	144996	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970492
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186	NC_021618	TA	6	146842	146852	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970493
187	NC_021618	TTTA	3	147104	147114	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
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192	NC_021618	TAA	4	153583	153593	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970484
193	NC_021618	TAT	4	154272	154284	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
194	NC_021618	TTGC	3	155522	155532	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	51970484
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199	NC_021618	TGATA	3	158320	158333	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	51970491
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213	NC_021618	AAGA	3	171539	171550	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
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220	NC_021618	TTTG	3	177454	177464	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51970503
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224	NC_021618	TA	7	179412	179425	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970506
225	NC_021618	TA	7	180200	180212	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
226	NC_021618	ACTT	3	181665	181676	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
227	NC_021618	TAA	4	181900	181910	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
228	NC_021618	TTCATA	3	182400	182416	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	51970486
229	NC_021618	TA	6	182568	182578	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970492
230	NC_021618	TGA	4	182759	182769	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970492
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234	NC_021618	AT	7	183246	183259	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970492
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236	NC_021618	TA	7	184294	184306	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970492
237	NC_021618	AAT	4	184594	184605	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
238	NC_021618	ATAC	3	185004	185014	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51970485
239	NC_021618	CTTT	3	185967	185977	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51970488
240	NC_021618	AT	6	187286	187297	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51970488
241	NC_021618	TAT	4	187664	187674	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
242	NC_021618	AT	6	188359	188369	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
243	NC_021618	ATA	4	189331	189342	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
244	NC_021618	TTGC	3	189810	189821	12	0 %	50 %	25 %	25 %	8 %	51970494
245	NC_021618	ATTT	3	190441	190452	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51970498

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Grateloupia taiwanensis plastid