ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Rozella allomycis mitochondrion

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021611	ATTA	4	77	92	16	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021611	TA	6	199	209	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
3	NC_021611	TAAT	3	265	276	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021611	TTAA	3	361	371	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
5	NC_021611	TAT	4	384	395	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021611	TAA	4	519	530	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021611	ATATAA	3	659	677	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
8	NC_021611	ATT	5	705	720	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
9	NC_021611	AT	8	735	751	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
10	NC_021611	AT	7	812	827	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_021611	TAAA	4	977	992	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
12	NC_021611	AGAA	3	1041	1051	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021611	ATTA	3	1082	1094	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
14	NC_021611	TAAA	4	1120	1135	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
15	NC_021611	TTATAT	3	1191	1207	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
16	NC_021611	TAT	4	1273	1283	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_021611	TA	6	1303	1313	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021611	ATT	4	1372	1383	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_021611	AAATT	3	1408	1422	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_021611	ATT	4	1459	1469	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021611	AATTAT	3	1558	1576	19	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
22	NC_021611	TAAA	3	1635	1646	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021611	TAT	4	1694	1705	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021611	TTA	4	1792	1802	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
25	NC_021611	TA	8	1799	1814	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_021611	TAT	5	2115	2129	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_021611	AAAT	3	2238	2249	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021611	AT	7	2308	2320	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
29	NC_021611	TTAA	3	2321	2332	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_021611	AAAT	5	2400	2419	20	75 %	25 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
31	NC_021611	ATT	4	2484	2495	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021611	TAAA	4	2548	2563	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_021611	ATTA	3	2592	2602	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021611	TTTA	3	2696	2707	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
35	NC_021611	ATT	4	2739	2750	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021611	ATAA	6	2787	2810	24	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021611	TTA	5	2879	2892	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
38	NC_021611	AATT	3	2959	2969	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
39	NC_021611	TAAA	3	3193	3205	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_021611	AATT	3	3339	3349	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_021611	TA	6	3351	3363	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
42	NC_021611	TA	6	3987	3997	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51750199
43	NC_021611	TAT	4	4149	4159	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
44	NC_021611	TAT	4	4258	4270	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
45	NC_021611	TAT	4	4287	4297	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
46	NC_021611	ATTA	3	4431	4442	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
47	NC_021611	ATT	4	4465	4475	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
48	NC_021611	TA	6	4611	4622	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
49	NC_021611	TAT	5	4820	4833	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
50	NC_021611	TTA	4	4858	4868	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
51	NC_021611	AT	6	4913	4924	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
52	NC_021611	AAAT	3	4951	4961	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51750199
53	NC_021611	AATT	3	5021	5032	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
54	NC_021611	TAT	5	5128	5143	16	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51750199
55	NC_021611	ATT	12	5158	5193	36	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51750199
56	NC_021611	TAT	4	5201	5212	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51750199
57	NC_021611	AT	6	5231	5243	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51750199
58	NC_021611	ATT	7	5277	5297	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
59	NC_021611	TTTA	5	5582	5600	19	25 %	75 %	0 %	0 %	10 %	51750199
60	NC_021611	TA	6	5701	5712	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
61	NC_021611	TTAT	4	5960	5975	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51750199
62	NC_021611	ATT	5	5989	6002	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
63	NC_021611	ATTA	3	6013	6024	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
64	NC_021611	TTATA	3	6057	6072	16	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51750199
65	NC_021611	TAT	4	6192	6203	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51750199
66	NC_021611	ATTT	3	6620	6631	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51750199
67	NC_021611	ATTT	3	6694	6704	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51750199
68	NC_021611	TAT	4	6743	6755	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
69	NC_021611	TA	6	6924	6935	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51750199
70	NC_021611	ATTT	3	6995	7005	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51750199
71	NC_021611	TATT	4	7186	7200	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	51750199
72	NC_021611	TTAT	3	7349	7360	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51750199
73	NC_021611	ATA	4	7426	7437	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51750199
74	NC_021611	ATTT	3	7589	7601	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51750199
75	NC_021611	TAT	4	7920	7931	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51750199
76	NC_021611	AT	19	8239	8274	36	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
77	NC_021611	TA	14	8274	8300	27	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
78	NC_021611	AT	9	8329	8345	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
79	NC_021611	TA	8	8347	8362	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
80	NC_021611	TTTA	3	8445	8456	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_021611	CTAT	3	8480	8491	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
82	NC_021611	ATACT	3	8498	8511	14	40 %	40 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
83	NC_021611	ATTT	4	8532	8547	16	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
84	NC_021611	TA	6	8601	8611	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021611	TATT	4	8668	8682	15	25 %	75 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
86	NC_021611	TAAA	3	8686	8696	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
87	NC_021611	ATCT	3	8750	8761	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021611	TA	7	8871	8883	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
89	NC_021611	TA	9	8913	8929	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
90	NC_021611	TA	8	8941	8955	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
91	NC_021611	TA	6	8958	8968	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
92	NC_021611	AT	7	9091	9103	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51750199
93	NC_021611	TTTA	3	9113	9124	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51750199
94	NC_021611	TA	8	9163	9178	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51750199
95	NC_021611	TAT	4	9191	9203	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
96	NC_021611	TTA	4	9204	9214	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
97	NC_021611	TAT	7	9274	9294	21	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
98	NC_021611	ATT	4	9295	9305	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
99	NC_021611	TAT	6	9310	9326	17	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51750199
100	NC_021611	TATATC	3	9332	9348	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	51750199
101	NC_021611	TA	8	9398	9414	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51750199
102	NC_021611	TAT	4	9426	9438	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
103	NC_021611	TTAT	3	9647	9658	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51750199
104	NC_021611	TAT	4	10029	10041	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
105	NC_021611	TAT	5	10122	10135	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
106	NC_021611	TAT	4	10255	10267	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
107	NC_021611	TAA	4	10287	10299	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51750199
108	NC_021611	TATT	3	10349	10360	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51750199
109	NC_021611	TAT	5	10511	10525	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51750199
110	NC_021611	TAT	4	10640	10650	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
111	NC_021611	TATATT	3	10719	10736	18	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	5 %	51750199
112	NC_021611	TAT	5	10737	10750	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51750199
113	NC_021611	ATT	4	10871	10881	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51750199
114	NC_021611	AT	6	11033	11043	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51750199
115	NC_021611	TA	7	11070	11083	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51750199
116	NC_021611	ATA	4	11132	11143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51750199
117	NC_021611	ATATT	3	11187	11200	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	51750199
118	NC_021611	ATATT	3	11406	11420	15	40 %	60 %	0 %	0 %	0 %	51750199
119	NC_021611	ATTTT	3	11434	11448	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51750199
120	NC_021611	TAT	5	11462	11476	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	51750199
121	NC_021611	TAT	4	11500	11511	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51750199
122	NC_021611	ATT	4	11568	11579	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
123	NC_021611	TA	12	11860	11885	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
124	NC_021611	ATA	4	11906	11916	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding

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