ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Polycarpa mytiligera complete mitochondrial genome

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021464	TCCT	3	482	493	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	51106509
2	NC_021464	ATTT	3	1209	1219	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51106509
3	NC_021464	GTTT	3	2497	2507	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51106509
4	NC_021464	TTG	4	2719	2730	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51106509
5	NC_021464	TTTAA	3	2858	2872	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
6	NC_021464	TTAAG	3	2920	2933	14	40 %	40 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_021464	TGATT	3	3032	3045	14	20 %	60 %	20 %	0 %	7 %	Non-Coding
8	NC_021464	ATT	4	3180	3190	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021464	AAAG	3	4104	4115	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021464	ATCT	3	4281	4292	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021464	AAAG	3	4340	4351	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021464	TAT	4	5305	5315	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51106509
13	NC_021464	ATTTA	3	5840	5854	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51106509
14	NC_021464	TTTTA	3	5907	5921	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51106509
15	NC_021464	ATT	4	5948	5959	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106509
16	NC_021464	TAT	4	6037	6047	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51106509
17	NC_021464	TATT	3	6294	6304	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51106509
18	NC_021464	TTA	4	6335	6346	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106509
19	NC_021464	TTTTG	3	6609	6622	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	51106509
20	NC_021464	TATT	3	6627	6637	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51106509
21	NC_021464	ATATT	3	6764	6778	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51106509
22	NC_021464	TA	6	6870	6880	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51106509
23	NC_021464	AGTT	3	6966	6976	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021464	TTTA	3	7264	7276	13	25 %	75 %	0 %	0 %	7 %	51106509
25	NC_021464	ATTT	3	7280	7291	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106509
26	NC_021464	GTT	4	9480	9491	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51106509
27	NC_021464	TTTA	3	9662	9673	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106509
28	NC_021464	GTT	4	9763	9773	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51106509
29	NC_021464	TGGT	3	10125	10135	11	0 %	50 %	50 %	0 %	9 %	51106510
30	NC_021464	TTATT	3	10136	10150	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51106510
31	NC_021464	TCTTT	3	10299	10312	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	51106510
32	NC_021464	TTTA	3	10517	10527	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51106510
33	NC_021464	CTT	4	10689	10700	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51106510
34	NC_021464	TA	6	11098	11108	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51106510
35	NC_021464	TAA	4	11440	11451	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51106510
36	NC_021464	TTTTTA	3	11814	11832	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51106510
37	NC_021464	TAT	4	11938	11949	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106510
38	NC_021464	TAA	4	12324	12335	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51106510
39	NC_021464	TTTA	3	12506	12517	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51106510
40	NC_021464	TAGG	3	12900	12910	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	51106510
41	NC_021464	TTA	4	12914	12925	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106510
42	NC_021464	TAT	4	13076	13087	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51106510
43	NC_021464	TTTA	3	13238	13248	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51106510
44	NC_021464	GTTT	3	14231	14241	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51106510

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Polycarpa mytiligera complete mitochondrial genome