ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Prinsepia utilis plastid

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021455	TAT	4	65	77	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_021455	TAA	4	256	267	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
3	NC_021455	CAG	4	1020	1031	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51194365
4	NC_021455	TAA	4	5103	5114	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
5	NC_021455	ATA	4	6937	6947	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021455	ATA	4	7338	7349	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021455	TTA	5	8379	8393	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
8	NC_021455	ACA	4	11120	11131	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51194365
9	NC_021455	TAT	4	12742	12753	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021455	ATA	4	13515	13526	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
11	NC_021455	ACT	4	14650	14661	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51194366
12	NC_021455	TTA	4	16358	16369	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
13	NC_021455	ATT	4	21071	21081	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51194366
14	NC_021455	GTT	4	23514	23525	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51194366
15	NC_021455	ATT	4	28265	28277	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
16	NC_021455	GAA	5	29634	29647	14	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021455	ATA	4	31490	31500	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021455	ATA	4	32861	32872	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
19	NC_021455	ATA	4	36868	36878	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021455	TCT	4	38253	38263	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51194367
21	NC_021455	ATG	4	39792	39802	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51194367
22	NC_021455	GCA	4	41690	41701	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51194367
23	NC_021455	ATA	4	43567	43577	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
24	NC_021455	TTA	4	52665	52676	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021455	ATA	4	55688	55698	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51194368
26	NC_021455	TAT	5	58179	58193	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
27	NC_021455	TAT	4	60322	60333	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
28	NC_021455	TTA	4	61122	61132	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_021455	ATT	4	66286	66297	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_021455	CCT	4	67363	67374	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021455	TTA	4	68606	68617	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021455	TCT	4	79228	79239	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51194373
33	NC_021455	TAT	4	82902	82912	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51194373
34	NC_021455	TAT	4	84980	84991	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51194373
35	NC_021455	CTT	4	85389	85400	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51194373
36	NC_021455	GAT	4	85860	85870	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51194373
37	NC_021455	GAT	4	87228	87238	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51194373
38	NC_021455	CTT	4	88744	88754	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51194373
39	NC_021455	GAT	4	90261	90272	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51194373
40	NC_021455	TGT	4	100470	100480	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51194373
41	NC_021455	AAG	4	101101	101112	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51194373
42	NC_021455	GAA	5	110553	110567	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	51194373
43	NC_021455	AAG	4	112797	112808	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51194373
44	NC_021455	ATT	4	113448	113460	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51194373
45	NC_021455	TAT	4	114722	114734	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51194373
46	NC_021455	TAA	5	115438	115452	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51194373
47	NC_021455	TTA	4	115581	115592	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51194373
48	NC_021455	TAA	4	121929	121941	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51194373
49	NC_021455	ATT	4	122087	122099	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51194373
50	NC_021455	TCT	4	128578	128589	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51194373
51	NC_021455	TAA	4	129341	129352	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51194373
52	NC_021455	TTC	6	130691	130709	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	51194373
53	NC_021455	CTT	4	140151	140162	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51194373
54	NC_021455	ACA	5	140785	140798	14	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	7 %	51194373
55	NC_021455	ATA	4	145728	145740	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
56	NC_021455	ACC	4	149503	149513	11	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	9 %	51194373
57	NC_021455	ATC	4	150985	150996	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51194373
58	NC_021455	GAA	4	152502	152512	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51194373
59	NC_021455	ATC	4	154019	154029	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021455	ATC	4	155387	155397	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51194373
61	NC_021455	GAA	5	155856	155870	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	51194373
62	NC_021455	ATT	4	156279	156291	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Prinsepia utilis plastid