ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Utricularia gibba chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021449	AGA	4	230	242	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	Non-Coding
2	NC_021449	AAGT	3	1063	1073	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51970448
3	NC_021449	CATT	3	2382	2392	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51970448
4	NC_021449	AGA	4	2593	2605	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51970448
5	NC_021449	ATTCAT	3	2799	2816	18	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	51970448
6	NC_021449	CATT	3	3597	3609	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
7	NC_021449	AAAG	3	4634	4644	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
8	NC_021449	ACA	4	4860	4871	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021449	TCTCT	3	5213	5226	14	0 %	60 %	0 %	40 %	7 %	51970448
10	NC_021449	ATGG	3	6086	6096	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	51970448
11	NC_021449	GCTT	3	6272	6282	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	Non-Coding
12	NC_021449	TAAA	4	6367	6382	16	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
13	NC_021449	TAC	4	6914	6925	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021449	N	12	6925	6936	12	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021449	CAA	4	6960	6970	11	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021449	T	13	7475	7487	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
17	NC_021449	AATAA	3	7947	7962	16	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
18	NC_021449	TTATT	3	7998	8013	16	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
19	NC_021449	A	12	8094	8105	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
20	NC_021449	TGT	4	8173	8184	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
21	NC_021449	TAAA	3	10286	10297	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51970448
22	NC_021449	CTTT	3	11116	11127	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51970449
23	NC_021449	TTTCT	3	11758	11772	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	51970449
24	NC_021449	TTTTTA	3	12404	12422	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
25	NC_021449	TTATAA	3	13458	13475	18	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
26	NC_021449	A	13	14741	14753	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_021449	TAGA	3	15006	15017	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51970449
28	NC_021449	GAAT	3	18264	18274	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51970449
29	NC_021449	CTT	4	20510	20520	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51970449
30	NC_021449	CCTTG	3	22130	22143	14	0 %	40 %	20 %	40 %	7 %	51970449
31	NC_021449	TA	6	26789	26799	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021449	TTAAGT	3	26847	26863	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	Non-Coding
33	NC_021449	TTC	5	27397	27410	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
34	NC_021449	T	14	27835	27848	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_021449	A	12	27866	27877	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021449	TTA	4	28647	28658	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
37	NC_021449	ATTT	3	29410	29421	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
38	NC_021449	TAT	4	29426	29437	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
39	NC_021449	ATA	4	29808	29819	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
40	NC_021449	TAT	5	30536	30549	14	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
41	NC_021449	TAT	4	30816	30827	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
42	NC_021449	GGGA	3	31926	31936	11	25 %	0 %	75 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021449	GAAA	3	33500	33511	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970450
44	NC_021449	CTTAT	3	33856	33869	14	20 %	60 %	0 %	20 %	7 %	51970450
45	NC_021449	TTCT	3	34558	34569	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
46	NC_021449	AG	6	34667	34677	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_021449	AATT	3	34997	35008	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
48	NC_021449	TAA	5	35389	35404	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
49	NC_021449	CAAAA	3	35414	35428	15	80 %	0 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
50	NC_021449	AAAG	3	35941	35952	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_021449	CTT	4	36353	36364	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970450
52	NC_021449	ATG	4	37888	37898	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970450
53	NC_021449	GCA	4	39786	39797	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51970450
54	NC_021449	ATG	4	40112	40122	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970450
55	NC_021449	AAAG	3	40173	40184	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970450
56	NC_021449	TA	7	41546	41558	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
57	NC_021449	A	14	41576	41589	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
58	NC_021449	AAATA	3	43592	43606	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
59	NC_021449	ACCT	3	43852	43863	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
60	NC_021449	ATT	7	43897	43916	20	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	10 %	Non-Coding
61	NC_021449	TA	12	43916	43940	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021449	TTA	4	43938	43948	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_021449	T	13	45026	45038	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
64	NC_021449	TA	6	45448	45458	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
65	NC_021449	ATTT	3	46286	46297	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
66	NC_021449	GGTT	3	46882	46893	12	0 %	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_021449	TTTA	3	49795	49806	12	25 %	75 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_021449	TTA	4	50061	50072	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021449	A	14	50175	50188	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
70	NC_021449	ATA	4	53014	53025	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51970451
71	NC_021449	TCAA	3	53182	53193	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021449	ATCT	3	53273	53285	13	25 %	50 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
73	NC_021449	AT	6	55367	55377	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
74	NC_021449	TAG	4	55479	55490	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_021449	GTTA	4	55612	55626	15	25 %	50 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
76	NC_021449	TACTTA	3	57727	57745	19	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	10 %	Non-Coding
77	NC_021449	CAAA	3	57986	57997	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51970451
78	NC_021449	TTA	4	58264	58274	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
79	NC_021449	ATT	4	58398	58409	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
80	NC_021449	AATT	3	58505	58516	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51970451
81	NC_021449	AGGC	3	58893	58904	12	25 %	0 %	50 %	25 %	8 %	51970451
82	NC_021449	AT	6	60337	60347	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51970451
83	NC_021449	TTTC	3	61370	61381	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
84	NC_021449	ATA	4	61774	61784	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021449	AT	6	61839	61849	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
86	NC_021449	TTTC	4	63149	63164	16	0 %	75 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
87	NC_021449	GAA	4	63393	63404	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
88	NC_021449	AAAG	3	64485	64495	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_021449	TTTAT	3	65363	65376	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
90	NC_021449	GAAA	3	65715	65726	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970452
91	NC_021449	AAAT	3	65789	65800	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
92	NC_021449	AAATA	3	66175	66189	15	80 %	20 %	0 %	0 %	6 %	51970452
93	NC_021449	TCTTT	3	66305	66318	14	0 %	80 %	0 %	20 %	7 %	Non-Coding
94	NC_021449	AAAT	4	66969	66983	15	75 %	25 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
95	NC_021449	AAAG	3	68515	68525	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51970452
96	NC_021449	TCC	4	69781	69791	11	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	9 %	51970452
97	NC_021449	AAAG	3	69837	69847	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51970452
98	NC_021449	TTTTC	3	69907	69921	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	51970452
99	NC_021449	GGTT	3	71268	71279	12	0 %	50 %	50 %	0 %	8 %	51970452
100	NC_021449	TCT	4	71639	71650	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51970452
101	NC_021449	TTTC	3	71797	71808	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51970452
102	NC_021449	AGAT	3	72224	72235	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51970452
103	NC_021449	TATTTT	3	72517	72535	19	16.67 %	83.33 %	0 %	0 %	10 %	51970452
104	NC_021449	TTTA	3	73021	73031	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51970452
105	NC_021449	A	12	73128	73139	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	51970452
106	NC_021449	AAT	4	74246	74256	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970452
107	NC_021449	TGATCA	3	74757	74773	17	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	51970452
108	NC_021449	AT	7	74895	74907	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51970452
109	NC_021449	CAAAT	3	75983	75996	14	60 %	20 %	0 %	20 %	7 %	51970452
110	NC_021449	AGA	4	77793	77804	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970452
111	NC_021449	AAAT	3	78901	78911	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51970452
112	NC_021449	GGTTAT	3	79291	79309	19	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	10 %	51970452
113	NC_021449	AATA	3	79499	79510	12	75 %	25 %	0 %	0 %	0 %	51970452
114	NC_021449	TTTC	3	79919	79930	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	51970452
115	NC_021449	CAAT	3	80367	80377	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51970452
116	NC_021449	GAT	4	82339	82349	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970452
117	NC_021449	GAT	4	83719	83729	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51970452
118	NC_021449	GAT	4	86753	86764	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970452
119	NC_021449	TGA	4	88429	88440	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51970452
120	NC_021449	N	12	91608	91619	12	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51970452
121	NC_021449	ATA	4	91999	92009	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51970452
122	NC_021449	TTTCG	3	94211	94224	14	0 %	60 %	20 %	20 %	7 %	51970452
123	NC_021449	TTTGTT	3	94603	94621	19	0 %	83.33 %	16.67 %	0 %	10 %	51970452
124	NC_021449	ATTT	8	95995	96027	33	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51970456
125	NC_021449	ATTAGT	3	96525	96541	17	33.33 %	50 %	16.67 %	0 %	5 %	51970456
126	NC_021449	ATCC	3	99598	99609	12	25 %	25 %	0 %	50 %	8 %	51970456
127	NC_021449	TCTA	3	99991	100002	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51970456
128	NC_021449	AGGT	3	103081	103092	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	51970456
129	NC_021449	TAAG	3	104201	104211	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51970456
130	NC_021449	GAAAA	3	104822	104835	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	51970456
131	NC_021449	GGAA	3	106236	106246	11	50 %	0 %	50 %	0 %	9 %	51970456
132	NC_021449	TAT	4	107638	107650	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51970456
133	NC_021449	AAG	4	108287	108298	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51970456
134	NC_021449	TTAAT	3	110287	110301	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51970456
135	NC_021449	CAAT	3	110874	110884	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51970456
136	NC_021449	GAAA	3	111756	111767	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51970456
137	NC_021449	A	15	113278	113292	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	51970456
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140	NC_021449	AATA	3	116627	116637	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51970456
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144	NC_021449	AATTT	3	119729	119743	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51970456
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152	NC_021449	ATTT	3	124308	124318	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51970456
153	NC_021449	TAAT	5	124756	124775	20	50 %	50 %	0 %	0 %	10 %	51970456
154	NC_021449	TCAA	3	124995	125006	12	50 %	25 %	0 %	25 %	8 %	51970456
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157	NC_021449	TTCC	3	127686	127696	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	51970456
158	NC_021449	CTTA	3	129721	129731	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51970456
159	NC_021449	GGAT	3	134323	134334	12	25 %	25 %	50 %	0 %	8 %	51970456
160	NC_021449	ACTAAT	3	137391	137407	17	50 %	33.33 %	0 %	16.67 %	5 %	51970456
161	NC_021449	TAAA	8	137901	137932	32	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51970456
162	NC_021449	CT	6	140710	140721	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	51970456
163	NC_021449	CTA	4	142064	142074	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51970456
164	NC_021449	N	12	142313	142324	12	0 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
165	NC_021449	CATAC	3	143003	143016	14	40 %	20 %	0 %	40 %	7 %	51970456
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167	NC_021449	AGAA	3	148508	148518	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51970456
168	NC_021449	TTTG	3	149135	149145	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51970456
169	NC_021449	ATC	4	150203	150213	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
170	NC_021449	ATC	4	151583	151593	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Utricularia gibba chloroplast