ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Taiwania flousiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021441	GCT	4	602	613	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272177
2	NC_021441	ATC	4	1862	1872	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272177
3	NC_021441	AAG	4	2076	2087	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272177
4	NC_021441	ATG	4	2950	2961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272177
5	NC_021441	ATA	4	4259	4270	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021441	TTA	4	7707	7717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
7	NC_021441	CAT	4	12717	12727	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272177
8	NC_021441	ATT	4	18389	18399	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021441	CTG	4	18498	18509	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272178
10	NC_021441	ATC	4	20948	20960	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
11	NC_021441	ATT	4	21819	21830	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021441	TAA	4	22165	22175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021441	TAT	4	22422	22433	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021441	TAT	4	22933	22943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021441	TTA	4	24765	24775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
16	NC_021441	TAT	4	24842	24852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
17	NC_021441	ATT	4	25788	25798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272178
18	NC_021441	AAC	4	28569	28580	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272178
19	NC_021441	CAA	4	31063	31074	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272178
20	NC_021441	ATT	4	35610	35620	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021441	TAA	4	36570	36581	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
22	NC_021441	CTG	4	37097	37108	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272179
23	NC_021441	AAC	4	38237	38248	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272179
24	NC_021441	TTA	4	41918	41929	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021441	TAA	4	46469	46479	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272179
26	NC_021441	CAG	4	47636	47647	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272179
27	NC_021441	AAT	4	48518	48528	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272179
28	NC_021441	GAA	4	49452	49462	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
29	NC_021441	AGA	4	53459	53470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
30	NC_021441	TTA	4	54246	54257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
31	NC_021441	ATT	4	56653	56665	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51272180
32	NC_021441	GTG	4	57406	57417	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021441	ATG	4	62857	62867	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021441	CTT	4	62963	62975	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
35	NC_021441	ATT	4	63269	63280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021441	ATT	4	67126	67136	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021441	GTA	4	67790	67801	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
38	NC_021441	TAA	4	72249	72260	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272180
39	NC_021441	TAT	4	72258	72268	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272180
40	NC_021441	ATA	5	72312	72325	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51272180
41	NC_021441	AGA	4	73541	73552	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
42	NC_021441	AGA	4	76130	76140	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272180
43	NC_021441	AAT	4	78267	78277	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272180
44	NC_021441	AGA	4	78809	78820	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
45	NC_021441	TAA	4	79914	79925	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272180
46	NC_021441	AGA	4	82670	82680	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272180
47	NC_021441	AGA	8	83748	83770	23	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
48	NC_021441	ATT	4	86561	86573	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51272180
49	NC_021441	AAT	4	88401	88412	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272180
50	NC_021441	TTA	4	90064	90075	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272180
51	NC_021441	CTT	4	97303	97314	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272180
52	NC_021441	CTT	4	102530	102540	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272180
53	NC_021441	ATA	4	106430	106440	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272184
54	NC_021441	AAT	6	106444	106460	17	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	5 %	51272184
55	NC_021441	GAA	4	108856	108867	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272184
56	NC_021441	ACC	4	113948	113959	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021441	TCT	4	117041	117052	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272184
58	NC_021441	TCT	4	118339	118350	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272184
59	NC_021441	GCT	4	120764	120775	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272184
60	NC_021441	TTC	4	123147	123158	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	51272184
61	NC_021441	AAT	4	123212	123226	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
62	NC_021441	AAG	4	126294	126305	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272185
63	NC_021441	ATT	4	127114	127126	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Taiwania flousiana chloroplast