ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Taiwania flousiana chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021441	GCT	4	602	613	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272177
2	NC_021441	GGAT	3	1336	1348	13	25 %	25 %	50 %	0 %	7 %	Non-Coding
3	NC_021441	TAAT	3	1437	1448	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021441	TATT	3	1540	1551	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51272177
5	NC_021441	TTGA	3	1798	1809	12	25 %	50 %	25 %	0 %	0 %	51272177
6	NC_021441	ATC	4	1862	1872	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272177
7	NC_021441	AAG	4	2076	2087	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272177
8	NC_021441	TCCA	4	2691	2706	16	25 %	25 %	0 %	50 %	6 %	51272177
9	NC_021441	AAAATT	3	2899	2917	19	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	10 %	51272177
10	NC_021441	ATG	4	2950	2961	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272177
11	NC_021441	TAAA	3	3808	3819	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021441	ATTA	3	3934	3944	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021441	ATA	4	4259	4270	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021441	AAAT	3	5151	5162	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272177
15	NC_021441	TTAA	3	7244	7255	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021441	TTCTT	3	7476	7490	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	Non-Coding
17	NC_021441	TTA	4	7707	7717	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
18	NC_021441	AATT	3	8354	8365	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	51272177
19	NC_021441	TA	8	9016	9031	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
20	NC_021441	TA	6	9034	9044	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
21	NC_021441	AT	6	9091	9101	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021441	CAT	4	12717	12727	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272177
23	NC_021441	AAAG	3	16522	16533	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51272177
24	NC_021441	AT	8	18067	18085	19	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
25	NC_021441	TA	6	18089	18103	15	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
26	NC_021441	CT	6	18229	18239	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021441	ATT	4	18389	18399	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021441	CTG	4	18498	18509	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272178
29	NC_021441	AG	6	19014	19025	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	51272178
30	NC_021441	ATC	4	20948	20960	13	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
31	NC_021441	GTTT	3	21400	21411	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
32	NC_021441	ATT	4	21819	21830	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
33	NC_021441	TAA	4	22165	22175	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
34	NC_021441	TA	7	22184	22196	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
35	NC_021441	TAT	4	22422	22433	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
36	NC_021441	TAT	4	22933	22943	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
37	NC_021441	AAAT	3	23020	23030	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
38	NC_021441	TGAT	3	23546	23556	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	51272178
39	NC_021441	TA	7	24687	24699	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
40	NC_021441	TTA	4	24765	24775	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
41	NC_021441	TAT	4	24842	24852	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
42	NC_021441	TA	6	25197	25207	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
43	NC_021441	AAAT	3	25364	25375	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272178
44	NC_021441	ACAA	3	25729	25740	12	75 %	0 %	0 %	25 %	8 %	51272178
45	NC_021441	ATT	4	25788	25798	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272178
46	NC_021441	ATTT	3	28542	28552	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
47	NC_021441	AAC	4	28569	28580	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272178
48	NC_021441	ATTTT	5	29227	29251	25	20 %	80 %	0 %	0 %	8 %	51272178
49	NC_021441	CAA	4	31063	31074	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272178
50	NC_021441	AGAAAA	3	33209	33227	19	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	5 %	51272178
51	NC_021441	AAAG	3	34504	34514	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51272178
52	NC_021441	AAAG	3	34530	34540	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51272178
53	NC_021441	AAAG	3	34556	34566	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
54	NC_021441	AAAG	3	34582	34592	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
55	NC_021441	AAAG	3	34608	34618	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
56	NC_021441	A	16	34746	34761	16	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51272178
57	NC_021441	A	13	35127	35139	13	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51272178
58	NC_021441	A	27	35471	35497	27	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
59	NC_021441	ATT	4	35610	35620	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
60	NC_021441	TAA	4	36570	36581	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
61	NC_021441	AT	13	36834	36859	26	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
62	NC_021441	CAAT	3	37017	37029	13	50 %	25 %	0 %	25 %	7 %	Non-Coding
63	NC_021441	CTG	4	37097	37108	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272179
64	NC_021441	TTCT	3	37655	37667	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	51272179
65	NC_021441	AAAT	3	37724	37736	13	75 %	25 %	0 %	0 %	7 %	51272179
66	NC_021441	AAC	4	38237	38248	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272179
67	NC_021441	TA	10	38903	38923	21	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
68	NC_021441	TA	6	38932	38942	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
69	NC_021441	ATTG	3	39466	39476	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	51272179
70	NC_021441	TAAA	3	40365	40375	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51272179
71	NC_021441	T	13	41012	41024	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
72	NC_021441	TTA	4	41918	41929	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_021441	AAAT	3	42125	42136	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021441	AATA	3	42367	42378	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
75	NC_021441	TC	6	42522	42533	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
76	NC_021441	TA	6	42774	42784	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
77	NC_021441	A	15	43117	43131	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
78	NC_021441	A	15	45108	45122	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
79	NC_021441	TAA	4	46469	46479	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272179
80	NC_021441	AAAT	3	47432	47443	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
81	NC_021441	CAG	4	47636	47647	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272179
82	NC_021441	AAT	4	48518	48528	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272179
83	NC_021441	AT	6	48571	48581	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
84	NC_021441	GAA	4	49452	49462	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
85	NC_021441	TA	6	50497	50507	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272180
86	NC_021441	TTCT	3	51747	51759	13	0 %	75 %	0 %	25 %	7 %	51272180
87	NC_021441	ATTTA	3	52951	52964	14	40 %	60 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
88	NC_021441	AAGA	3	52969	52979	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
89	NC_021441	AGA	4	53459	53470	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
90	NC_021441	TTA	4	54246	54257	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
91	NC_021441	TTTC	3	54621	54632	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	51272180
92	NC_021441	ATCA	3	54693	54703	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	51272180
93	NC_021441	ATATT	3	55870	55884	15	40 %	60 %	0 %	0 %	6 %	51272180
94	NC_021441	ATT	4	56653	56665	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51272180
95	NC_021441	ATTT	3	56792	56802	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
96	NC_021441	TATC	3	57354	57365	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
97	NC_021441	GTG	4	57406	57417	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
98	NC_021441	CATT	4	57808	57823	16	25 %	50 %	0 %	25 %	6 %	Non-Coding
99	NC_021441	AAAT	3	58675	58685	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
100	NC_021441	CTAC	3	60030	60041	12	25 %	25 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
101	NC_021441	TCTGA	3	61843	61856	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
102	NC_021441	TGAA	3	62109	62119	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	Non-Coding
103	NC_021441	ATG	4	62857	62867	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
104	NC_021441	CTT	4	62963	62975	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
105	NC_021441	ATT	4	63269	63280	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
106	NC_021441	TC	6	63872	63882	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
107	NC_021441	A	12	64327	64338	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
108	NC_021441	CCTT	3	65851	65861	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	Non-Coding
109	NC_021441	ATT	4	67126	67136	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
110	NC_021441	GTA	4	67790	67801	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
111	NC_021441	ATTA	4	69226	69241	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	51272180
112	NC_021441	ATTG	3	70215	70226	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	51272180
113	NC_021441	AATA	3	70227	70238	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272180
114	NC_021441	TTCA	3	70338	70348	11	25 %	50 %	0 %	25 %	9 %	51272180
115	NC_021441	TATT	3	71506	71516	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51272180
116	NC_021441	AT	6	72176	72186	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272180
117	NC_021441	TAA	4	72249	72260	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272180
118	NC_021441	TAT	4	72258	72268	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272180
119	NC_021441	AATAT	3	72293	72307	15	60 %	40 %	0 %	0 %	6 %	51272180
120	NC_021441	ATA	5	72312	72325	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51272180
121	NC_021441	TA	6	72382	72393	12	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	51272180
122	NC_021441	TA	7	72408	72421	14	50 %	50 %	0 %	0 %	0 %	51272180
123	NC_021441	TA	9	72424	72440	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51272180
124	NC_021441	AGA	4	73541	73552	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
125	NC_021441	ATTC	3	76006	76017	12	25 %	50 %	0 %	25 %	8 %	51272180
126	NC_021441	AGA	4	76130	76140	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272180
127	NC_021441	TTTTA	3	76333	76347	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51272180
128	NC_021441	CTTT	3	76353	76363	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272180
129	NC_021441	ATTT	3	76780	76791	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51272180
130	NC_021441	GAAA	3	77247	77257	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51272180
131	NC_021441	ATGA	3	77869	77881	13	50 %	25 %	25 %	0 %	7 %	51272180
132	NC_021441	AAT	4	78267	78277	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272180
133	NC_021441	AGA	4	78809	78820	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272180
134	NC_021441	GTGA	3	79515	79525	11	25 %	25 %	50 %	0 %	9 %	51272180
135	NC_021441	TTATT	3	79895	79908	14	20 %	80 %	0 %	0 %	7 %	51272180
136	NC_021441	TAA	4	79914	79925	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272180
137	NC_021441	T	12	80244	80255	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51272180
138	NC_021441	AGAA	3	80891	80902	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	51272180
139	NC_021441	AATT	3	81442	81452	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272180
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151	NC_021441	ATTG	3	84088	84098	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	51272180
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174	NC_021441	TGAT	3	101865	101875	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	51272180
175	NC_021441	AAAT	3	102498	102509	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272180
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180	NC_021441	TAGTA	3	105467	105481	15	40 %	40 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
181	NC_021441	ATGT	3	106399	106409	11	25 %	50 %	25 %	0 %	9 %	51272184
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195	NC_021441	TAAG	3	113315	113325	11	50 %	25 %	25 %	0 %	9 %	51272184
196	NC_021441	AAAT	3	113572	113582	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51272184
197	NC_021441	ACC	4	113948	113959	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
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199	NC_021441	TATAAT	3	115708	115724	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
200	NC_021441	TATAAT	3	115729	115745	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
201	NC_021441	TTTTTC	3	116559	116576	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	51272184
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214	NC_021441	TTTC	3	127561	127572	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
215	NC_021441	A	18	127746	127763	18	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
216	NC_021441	AT	6	127773	127783	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
217	NC_021441	TTAT	5	130282	130302	21	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
218	NC_021441	TAAA	3	130614	130625	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
219	NC_021441	TA	8	130712	130727	16	50 %	50 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
220	NC_021441	AT	7	130973	130985	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Taiwania flousiana chloroplast