Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus taeda chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021440ATC4295529651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272169
2NC_021440AGA4316731781266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272169
3NC_021440AAT4546254731266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_021440CTA4710571151133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272170
5NC_021440CAT421125211351133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272171
6NC_021440TCT42213422144110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272171
7NC_021440CTT42270822718110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272171
8NC_021440GTT42355823569120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51272171
9NC_021440ATT429492295021133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_021440GTT43298132991110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51272171
11NC_021440GTA433321333321233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272171
12NC_021440AGA437299373091166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51272171
13NC_021440TAA438235382461266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272171
14NC_021440AAT442353423631166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272171
15NC_021440GGA446429464401233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51272171
16NC_021440ATA449934499441166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272171
17NC_021440CTT45215252162110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272171
18NC_021440AAT457652576621166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272171
19NC_021440ATA463097631081266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272171
20NC_021440CTT56432964342140 %66.67 %0 %33.33 %7 %51272171
21NC_021440TAT465368653781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51272171
22NC_021440TAT466307663171133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51272171
23NC_021440AAT466951669611166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272171
24NC_021440TTC46872668736110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272171
25NC_021440GGT47608976100120 %33.33 %66.67 %0 %8 %51272171
26NC_021440TTC47905079061120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272171
27NC_021440AGA479225792351166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51272171
28NC_021440CTG48095780968120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272171
29NC_021440TTC48383483845120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272171
30NC_021440TCA493126931361133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272171
31NC_021440TGG49453794548120 %33.33 %66.67 %0 %8 %51272171
32NC_021440AGA494954949651266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272171
33NC_021440GAA41005231005341266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272171
34NC_021440ATA41031841031951266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272171
35NC_021440AGA41087081087201366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51272171
36NC_021440TAA41095591095691166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272171
37NC_021440TAC41099941100041133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272171
38NC_021440TCA41108221108321133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272171
39NC_021440GTA41116251116361233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272171
40NC_021440TAC41204791204891133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272176
41NC_021440TCT4120692120703120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272176