Tetra-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus massoniana chloroplast
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| S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| 1 | NC_021439 | GATG | 3 | 1625 | 1637 | 13 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
| 2 | NC_021439 | TCTA | 3 | 3467 | 3477 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | Non-Coding |
| 3 | NC_021439 | ATGA | 3 | 4365 | 4376 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 4 | NC_021439 | CCTT | 3 | 6198 | 6208 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272162 |
| 5 | NC_021439 | ATGT | 3 | 6945 | 6955 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 6 | NC_021439 | CTTT | 3 | 7269 | 7279 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | Non-Coding |
| 7 | NC_021439 | ATTC | 3 | 8609 | 8620 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | Non-Coding |
| 8 | NC_021439 | TTTA | 3 | 10232 | 10242 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272163 |
| 9 | NC_021439 | ATTT | 3 | 12928 | 12940 | 13 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272163 |
| 10 | NC_021439 | AAAT | 3 | 15192 | 15203 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 11 | NC_021439 | ATGA | 3 | 26245 | 26256 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
| 12 | NC_021439 | ATCC | 3 | 26491 | 26501 | 11 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 9 % | Non-Coding |
| 13 | NC_021439 | TAGA | 3 | 33071 | 33081 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 14 | NC_021439 | GAAA | 3 | 40487 | 40497 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 15 | NC_021439 | TTTA | 3 | 41408 | 41419 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
| 16 | NC_021439 | GATA | 3 | 42863 | 42874 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
| 17 | NC_021439 | ATTT | 3 | 44988 | 44998 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 18 | NC_021439 | GAAA | 3 | 48827 | 48838 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
| 19 | NC_021439 | GAAA | 3 | 49640 | 49650 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 20 | NC_021439 | GAAG | 3 | 50858 | 50869 | 12 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
| 21 | NC_021439 | TCTA | 3 | 50995 | 51006 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 0 % | 51272164 |
| 22 | NC_021439 | TGAA | 3 | 51100 | 51111 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
| 23 | NC_021439 | ATTC | 3 | 52783 | 52794 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
| 24 | NC_021439 | TCGT | 3 | 61236 | 61246 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
| 25 | NC_021439 | AATT | 3 | 64827 | 64837 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 26 | NC_021439 | TTCT | 4 | 69436 | 69450 | 15 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 6 % | 51272164 |
| 27 | NC_021439 | AATT | 3 | 79267 | 79277 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 28 | NC_021439 | TTTC | 3 | 81107 | 81118 | 12 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
| 29 | NC_021439 | GATC | 3 | 82763 | 82774 | 12 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
| 30 | NC_021439 | ATCC | 3 | 86533 | 86544 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 51272164 |
| 31 | NC_021439 | GAGG | 3 | 89803 | 89814 | 12 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
| 32 | NC_021439 | AGGT | 3 | 90011 | 90022 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
| 33 | NC_021439 | CTAT | 3 | 91406 | 91417 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
| 34 | NC_021439 | AACC | 3 | 91635 | 91647 | 13 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 7 % | 51272164 |
| 35 | NC_021439 | ATGG | 3 | 100446 | 100457 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
| 36 | NC_021439 | TTCT | 3 | 101088 | 101098 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
| 37 | NC_021439 | TTCT | 3 | 101460 | 101470 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
| 38 | NC_021439 | TCCA | 3 | 104929 | 104940 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 51272164 |
| 39 | NC_021439 | TTCA | 3 | 107663 | 107674 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
| 40 | NC_021439 | TTGA | 3 | 108155 | 108165 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
| 41 | NC_021439 | AAAG | 3 | 110302 | 110313 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
| 42 | NC_021439 | TCTA | 3 | 111031 | 111042 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | Non-Coding |
| 43 | NC_021439 | ATAA | 3 | 111121 | 111131 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 44 | NC_021439 | AAAG | 3 | 111132 | 111142 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
| 45 | NC_021439 | TGAG | 3 | 114766 | 114778 | 13 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 7 % | 51272169 |
| 46 | NC_021439 | TCAA | 3 | 116690 | 116700 | 11 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272169 |
| 47 | NC_021439 | TTGA | 3 | 118630 | 118640 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272169 |