All Imperfect Repeats of Pinus massoniana chloroplast
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S.No. | Genome ID | Motif | Iterations | Start | End | Tract Length | A% | T% | G% | C% | Imperfection % | Protein ID |
---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
1 | NC_021439 | T | 15 | 1376 | 1390 | 15 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
2 | NC_021439 | GATG | 3 | 1625 | 1637 | 13 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 7 % | Non-Coding |
3 | NC_021439 | ATC | 4 | 2152 | 2162 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272162 |
4 | NC_021439 | AGA | 4 | 2364 | 2375 | 12 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272162 |
5 | NC_021439 | TCTA | 3 | 3467 | 3477 | 11 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 9 % | Non-Coding |
6 | NC_021439 | ATGA | 3 | 4365 | 4376 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
7 | NC_021439 | AAT | 4 | 4659 | 4670 | 12 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
8 | NC_021439 | CCTT | 3 | 6198 | 6208 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272162 |
9 | NC_021439 | CTA | 4 | 6271 | 6281 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272162 |
10 | NC_021439 | ATGT | 3 | 6945 | 6955 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
11 | NC_021439 | TTCGA | 3 | 7008 | 7021 | 14 | 20 % | 40 % | 20 % | 20 % | 7 % | Non-Coding |
12 | NC_021439 | CTTT | 3 | 7269 | 7279 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | Non-Coding |
13 | NC_021439 | TCCGT | 3 | 7889 | 7903 | 15 | 0 % | 40 % | 20 % | 40 % | 0 % | Non-Coding |
14 | NC_021439 | GA | 6 | 7951 | 7962 | 12 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
15 | NC_021439 | ATTC | 3 | 8609 | 8620 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | Non-Coding |
16 | NC_021439 | TTA | 4 | 9341 | 9351 | 11 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
17 | NC_021439 | TTTA | 3 | 10232 | 10242 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272163 |
18 | NC_021439 | TGT | 4 | 12376 | 12387 | 12 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272163 |
19 | NC_021439 | ATTT | 3 | 12928 | 12940 | 13 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272163 |
20 | NC_021439 | AAGGA | 3 | 12995 | 13009 | 15 | 60 % | 0 % | 40 % | 0 % | 6 % | 51272163 |
21 | NC_021439 | AAAT | 3 | 15192 | 15203 | 12 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
22 | NC_021439 | T | 23 | 15275 | 15297 | 23 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
23 | NC_021439 | TA | 6 | 19106 | 19117 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272163 |
24 | NC_021439 | CAT | 4 | 20331 | 20341 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272163 |
25 | NC_021439 | TCT | 5 | 21337 | 21350 | 14 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 7 % | 51272163 |
26 | NC_021439 | CTT | 4 | 21905 | 21915 | 11 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272163 |
27 | NC_021439 | TGCTT | 3 | 21978 | 21991 | 14 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 7 % | 51272163 |
28 | NC_021439 | GTT | 4 | 22757 | 22768 | 12 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272163 |
29 | NC_021439 | CTT | 4 | 25396 | 25407 | 12 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 8 % | 51272163 |
30 | NC_021439 | A | 14 | 26179 | 26192 | 14 | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
31 | NC_021439 | ATGA | 3 | 26245 | 26256 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
32 | NC_021439 | ATCC | 3 | 26491 | 26501 | 11 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 9 % | Non-Coding |
33 | NC_021439 | AATTC | 3 | 31687 | 31701 | 15 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 6 % | 51272164 |
34 | NC_021439 | GTT | 4 | 31893 | 31903 | 11 | 0 % | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
35 | NC_021439 | AT | 7 | 32986 | 32998 | 13 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
36 | NC_021439 | TAGA | 3 | 33071 | 33081 | 11 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
37 | NC_021439 | AGA | 4 | 36200 | 36210 | 11 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
38 | NC_021439 | TAA | 4 | 37132 | 37143 | 12 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
39 | NC_021439 | TCT | 4 | 39168 | 39179 | 12 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 8 % | 51272164 |
40 | NC_021439 | GAAA | 3 | 40487 | 40497 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
41 | NC_021439 | TGTATA | 4 | 40557 | 40580 | 24 | 33.33 % | 50 % | 16.67 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
42 | NC_021439 | TTTA | 3 | 41408 | 41419 | 12 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
43 | NC_021439 | AAT | 4 | 41615 | 41625 | 11 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
44 | NC_021439 | AT | 6 | 42832 | 42843 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
45 | NC_021439 | GATA | 3 | 42863 | 42874 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
46 | NC_021439 | ATTT | 3 | 44988 | 44998 | 11 | 25 % | 75 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
47 | NC_021439 | GGA | 4 | 45688 | 45699 | 12 | 33.33 % | 0 % | 66.67 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
48 | NC_021439 | TATTTT | 3 | 48198 | 48215 | 18 | 16.67 % | 83.33 % | 0 % | 0 % | 5 % | 51272164 |
49 | NC_021439 | GAAA | 3 | 48827 | 48838 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
50 | NC_021439 | ATA | 4 | 49172 | 49182 | 11 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
51 | NC_021439 | GAAA | 3 | 49640 | 49650 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
52 | NC_021439 | TC | 6 | 50799 | 50809 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272164 |
53 | NC_021439 | GA | 6 | 50817 | 50827 | 11 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
54 | NC_021439 | GAAG | 3 | 50858 | 50869 | 12 | 50 % | 0 % | 50 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
55 | NC_021439 | TCTA | 3 | 50995 | 51006 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 0 % | 51272164 |
56 | NC_021439 | TGAA | 3 | 51100 | 51111 | 12 | 50 % | 25 % | 25 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
57 | NC_021439 | TC | 6 | 51759 | 51770 | 12 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 8 % | 51272164 |
58 | NC_021439 | ACGGA | 3 | 51818 | 51832 | 15 | 40 % | 0 % | 40 % | 20 % | 0 % | 51272164 |
59 | NC_021439 | GATCC | 3 | 52498 | 52511 | 14 | 20 % | 20 % | 20 % | 40 % | 7 % | 51272164 |
60 | NC_021439 | ATTC | 3 | 52783 | 52794 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
61 | NC_021439 | AAT | 4 | 56925 | 56935 | 11 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
62 | NC_021439 | AATTC | 3 | 58874 | 58887 | 14 | 40 % | 40 % | 0 % | 20 % | 7 % | 51272164 |
63 | NC_021439 | TA | 6 | 59608 | 59618 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
64 | NC_021439 | TCGT | 3 | 61236 | 61246 | 11 | 0 % | 50 % | 25 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
65 | NC_021439 | ATA | 4 | 62378 | 62389 | 12 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
66 | NC_021439 | CT | 6 | 62557 | 62567 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272164 |
67 | NC_021439 | CTT | 5 | 63610 | 63623 | 14 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 7 % | 51272164 |
68 | NC_021439 | T | 13 | 63717 | 63729 | 13 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
69 | NC_021439 | TC | 7 | 64473 | 64485 | 13 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 7 % | 51272164 |
70 | NC_021439 | TAT | 4 | 64652 | 64662 | 11 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
71 | NC_021439 | AATT | 3 | 64827 | 64837 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
72 | NC_021439 | TAT | 4 | 65592 | 65602 | 11 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
73 | NC_021439 | ATTGT | 3 | 66163 | 66176 | 14 | 20 % | 60 % | 20 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
74 | NC_021439 | ATA | 4 | 66211 | 66223 | 13 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
75 | NC_021439 | AAAGA | 3 | 67136 | 67150 | 15 | 80 % | 0 % | 20 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
76 | NC_021439 | TTC | 4 | 68000 | 68010 | 11 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272164 |
77 | NC_021439 | A | 22 | 68014 | 68035 | 22 | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | 4 % | 51272164 |
78 | NC_021439 | TTCT | 4 | 69436 | 69450 | 15 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 6 % | 51272164 |
79 | NC_021439 | T | 14 | 72005 | 72018 | 14 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
80 | NC_021439 | AT | 7 | 73510 | 73523 | 14 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
81 | NC_021439 | TTC | 4 | 78317 | 78328 | 12 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 8 % | 51272164 |
82 | NC_021439 | AGA | 4 | 78492 | 78502 | 11 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
83 | NC_021439 | AT | 6 | 79183 | 79194 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
84 | NC_021439 | AATT | 3 | 79267 | 79277 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
85 | NC_021439 | CT | 6 | 79951 | 79961 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272164 |
86 | NC_021439 | A | 12 | 79996 | 80007 | 12 | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
87 | NC_021439 | CTG | 4 | 80211 | 80222 | 12 | 0 % | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 8 % | 51272164 |
88 | NC_021439 | GAA | 4 | 80257 | 80268 | 12 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
89 | NC_021439 | TTTC | 3 | 81107 | 81118 | 12 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
90 | NC_021439 | GATC | 3 | 82763 | 82774 | 12 | 25 % | 25 % | 25 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
91 | NC_021439 | TC | 6 | 82973 | 82983 | 11 | 0 % | 50 % | 0 % | 50 % | 9 % | 51272164 |
92 | NC_021439 | TTC | 4 | 83087 | 83098 | 12 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 8 % | 51272164 |
93 | NC_021439 | ATCC | 3 | 86533 | 86544 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 51272164 |
94 | NC_021439 | TTA | 4 | 87312 | 87323 | 12 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
95 | NC_021439 | T | 18 | 87321 | 87338 | 18 | 0 % | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
96 | NC_021439 | GAGG | 3 | 89803 | 89814 | 12 | 25 % | 0 % | 75 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
97 | NC_021439 | AGGT | 3 | 90011 | 90022 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
98 | NC_021439 | CTAT | 3 | 91406 | 91417 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
99 | NC_021439 | AACC | 3 | 91635 | 91647 | 13 | 50 % | 0 % | 0 % | 50 % | 7 % | 51272164 |
100 | NC_021439 | TATGA | 3 | 92068 | 92082 | 15 | 40 % | 40 % | 20 % | 0 % | 0 % | 51272164 |
101 | NC_021439 | TCA | 4 | 92394 | 92404 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272164 |
102 | NC_021439 | TGG | 4 | 93750 | 93761 | 12 | 0 % | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
103 | NC_021439 | AGA | 4 | 94167 | 94178 | 12 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
104 | NC_021439 | AATTGG | 3 | 94322 | 94340 | 19 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 10 % | 51272164 |
105 | NC_021439 | AT | 6 | 95370 | 95380 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
106 | NC_021439 | TA | 6 | 95452 | 95462 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
107 | NC_021439 | AT | 6 | 95488 | 95498 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
108 | NC_021439 | GAA | 4 | 99913 | 99924 | 12 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
109 | NC_021439 | ATGG | 3 | 100446 | 100457 | 12 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
110 | NC_021439 | TCTGT | 3 | 100912 | 100925 | 14 | 0 % | 60 % | 20 % | 20 % | 7 % | 51272164 |
111 | NC_021439 | TTCT | 3 | 101088 | 101098 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
112 | NC_021439 | TTCT | 3 | 101460 | 101470 | 11 | 0 % | 75 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272164 |
113 | NC_021439 | TCCA | 3 | 104929 | 104940 | 12 | 25 % | 25 % | 0 % | 50 % | 8 % | 51272164 |
114 | NC_021439 | ATT | 4 | 106534 | 106545 | 12 | 33.33 % | 66.67 % | 0 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
115 | NC_021439 | AGA | 4 | 106901 | 106913 | 13 | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 0 % | 7 % | 51272164 |
116 | NC_021439 | ATA | 4 | 107048 | 107058 | 11 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
117 | NC_021439 | TTCA | 3 | 107663 | 107674 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | 51272164 |
118 | NC_021439 | TAA | 4 | 107759 | 107769 | 11 | 66.67 % | 33.33 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
119 | NC_021439 | TA | 6 | 107827 | 107837 | 11 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
120 | NC_021439 | TTGA | 3 | 108155 | 108165 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272164 |
121 | NC_021439 | TAC | 4 | 108194 | 108204 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272164 |
122 | NC_021439 | GTA | 4 | 109817 | 109828 | 12 | 33.33 % | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 8 % | 51272164 |
123 | NC_021439 | A | 12 | 110064 | 110075 | 12 | 100 % | 0 % | 0 % | 0 % | 8 % | Non-Coding |
124 | NC_021439 | AAAG | 3 | 110302 | 110313 | 12 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
125 | NC_021439 | TCTA | 3 | 111031 | 111042 | 12 | 25 % | 50 % | 0 % | 25 % | 8 % | Non-Coding |
126 | NC_021439 | ATAA | 3 | 111121 | 111131 | 11 | 75 % | 25 % | 0 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
127 | NC_021439 | AAAG | 3 | 111132 | 111142 | 11 | 75 % | 0 % | 25 % | 0 % | 9 % | Non-Coding |
128 | NC_021439 | AT | 6 | 111978 | 111989 | 12 | 50 % | 50 % | 0 % | 0 % | 0 % | Non-Coding |
129 | NC_021439 | TGAG | 3 | 114766 | 114778 | 13 | 25 % | 25 % | 50 % | 0 % | 7 % | 51272169 |
130 | NC_021439 | TCTTCG | 6 | 115149 | 115184 | 36 | 0 % | 50 % | 16.67 % | 33.33 % | 8 % | 51272169 |
131 | NC_021439 | TCAA | 3 | 116690 | 116700 | 11 | 50 % | 25 % | 0 % | 25 % | 9 % | 51272169 |
132 | NC_021439 | ATTTT | 3 | 117904 | 117918 | 15 | 20 % | 80 % | 0 % | 0 % | 6 % | 51272169 |
133 | NC_021439 | TTGA | 3 | 118630 | 118640 | 11 | 25 % | 50 % | 25 % | 0 % | 9 % | 51272169 |
134 | NC_021439 | TAC | 4 | 118669 | 118679 | 11 | 33.33 % | 33.33 % | 0 % | 33.33 % | 9 % | 51272169 |
135 | NC_021439 | TCT | 4 | 118876 | 118887 | 12 | 0 % | 66.67 % | 0 % | 33.33 % | 8 % | 51272169 |