ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus massoniana chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021439	ATC	4	2152	2162	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272162
2	NC_021439	AGA	4	2364	2375	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272162
3	NC_021439	AAT	4	4659	4670	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
4	NC_021439	CTA	4	6271	6281	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272162
5	NC_021439	TTA	4	9341	9351	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
6	NC_021439	TGT	4	12376	12387	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51272163
7	NC_021439	CAT	4	20331	20341	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272163
8	NC_021439	TCT	5	21337	21350	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	51272163
9	NC_021439	CTT	4	21905	21915	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272163
10	NC_021439	GTT	4	22757	22768	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51272163
11	NC_021439	CTT	4	25396	25407	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272163
12	NC_021439	GTT	4	31893	31903	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51272164
13	NC_021439	AGA	4	36200	36210	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272164
14	NC_021439	TAA	4	37132	37143	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272164
15	NC_021439	TCT	4	39168	39179	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272164
16	NC_021439	AAT	4	41615	41625	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272164
17	NC_021439	GGA	4	45688	45699	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	51272164
18	NC_021439	ATA	4	49172	49182	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272164
19	NC_021439	AAT	4	56925	56935	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272164
20	NC_021439	ATA	4	62378	62389	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272164
21	NC_021439	CTT	5	63610	63623	14	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	51272164
22	NC_021439	TAT	4	64652	64662	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272164
23	NC_021439	TAT	4	65592	65602	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272164
24	NC_021439	ATA	4	66211	66223	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51272164
25	NC_021439	TTC	4	68000	68010	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272164
26	NC_021439	TTC	4	78317	78328	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272164
27	NC_021439	AGA	4	78492	78502	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272164
28	NC_021439	CTG	4	80211	80222	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272164
29	NC_021439	GAA	4	80257	80268	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272164
30	NC_021439	TTC	4	83087	83098	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272164
31	NC_021439	TTA	4	87312	87323	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272164
32	NC_021439	TCA	4	92394	92404	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272164
33	NC_021439	TGG	4	93750	93761	12	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	8 %	51272164
34	NC_021439	AGA	4	94167	94178	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272164
35	NC_021439	GAA	4	99913	99924	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272164
36	NC_021439	ATT	4	106534	106545	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272164
37	NC_021439	AGA	4	106901	106913	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51272164
38	NC_021439	ATA	4	107048	107058	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272164
39	NC_021439	TAA	4	107759	107769	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272164
40	NC_021439	TAC	4	108194	108204	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272164
41	NC_021439	GTA	4	109817	109828	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272164
42	NC_021439	TAC	4	118669	118679	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272169
43	NC_021439	TCT	4	118876	118887	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272169

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Pinus massoniana chloroplast