ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Imperfect Repeats of Gnetum montanum chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021438	TCT	4	330	340	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272155
2	NC_021438	AAAT	3	2027	2037	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51272155
3	NC_021438	AATA	3	2318	2328	11	75 %	25 %	0 %	0 %	9 %	51272155
4	NC_021438	A	18	3459	3476	18	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
5	NC_021438	TTG	4	3906	3917	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021438	TA	13	4057	4081	25	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021438	A	12	4589	4600	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021438	TA	21	4595	4636	42	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
9	NC_021438	T	15	4704	4718	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
10	NC_021438	AGAAAA	5	4846	4876	31	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
11	NC_021438	CT	6	6986	6997	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	51272156
12	NC_021438	GCTT	3	7009	7019	11	0 %	50 %	25 %	25 %	9 %	51272156
13	NC_021438	A	12	7574	7585	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	51272156
14	NC_021438	GA	6	7613	7624	12	50 %	0 %	50 %	0 %	8 %	Non-Coding
15	NC_021438	A	13	7776	7788	13	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021438	CTTTT	3	8971	8985	15	0 %	80 %	0 %	20 %	6 %	51272156
17	NC_021438	ATG	4	10532	10542	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51272156
18	NC_021438	CAC	4	12106	12117	12	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	8 %	51272156
19	NC_021438	TATT	5	13855	13874	20	25 %	75 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
20	NC_021438	A	16	14449	14464	16	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
21	NC_021438	CAAA	3	14592	14602	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021438	T	13	15667	15679	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
23	NC_021438	T	13	15685	15697	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
24	NC_021438	TTTG	3	15883	15894	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021438	T	13	16015	16027	13	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021438	AT	7	18119	18131	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
27	NC_021438	ATTT	3	18419	18429	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51272157
28	NC_021438	A	17	18443	18459	17	100 %	0 %	0 %	0 %	5 %	51272157
29	NC_021438	AAAC	3	19230	19242	13	75 %	0 %	0 %	25 %	7 %	51272157
30	NC_021438	A	12	19678	19689	12	100 %	0 %	0 %	0 %	8 %	51272157
31	NC_021438	CTTT	3	22390	22400	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021438	AGAA	4	22891	22905	15	75 %	0 %	25 %	0 %	6 %	Non-Coding
33	NC_021438	GAAA	3	24697	24707	11	75 %	0 %	25 %	0 %	9 %	51272157
34	NC_021438	AT	6	24895	24905	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272157
35	NC_021438	AAAAG	3	26102	26115	14	80 %	0 %	20 %	0 %	7 %	51272157
36	NC_021438	GAAA	3	26393	26404	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51272157
37	NC_021438	AATA	3	26595	26606	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272157
38	NC_021438	TTTC	3	28260	28271	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51272157
39	NC_021438	AAGAA	3	28687	28702	16	80 %	0 %	20 %	0 %	6 %	51272157
40	NC_021438	CGA	4	28886	28898	13	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	7 %	51272157
41	NC_021438	ATAACA	3	31225	31241	17	66.67 %	16.67 %	0 %	16.67 %	5 %	51272157
42	NC_021438	T	12	32125	32136	12	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_021438	AATC	3	33949	33959	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021438	TC	6	35344	35355	12	0 %	50 %	0 %	50 %	8 %	Non-Coding
45	NC_021438	CTTT	3	35414	35424	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272157
46	NC_021438	G	12	37634	37645	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
47	NC_021438	TAT	4	37799	37809	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
48	NC_021438	G	12	37929	37940	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_021438	TA	6	37958	37970	13	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
50	NC_021438	TGTT	3	38322	38333	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
51	NC_021438	CTT	4	38660	38670	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
52	NC_021438	ATTT	3	39880	39890	11	25 %	75 %	0 %	0 %	9 %	51272158
53	NC_021438	TCAA	3	41470	41480	11	50 %	25 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
54	NC_021438	AGC	4	41960	41971	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272158
55	NC_021438	TTTG	3	42456	42466	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272158
56	NC_021438	AAAT	3	43486	43497	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
57	NC_021438	T	17	43603	43619	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	Non-Coding
58	NC_021438	AAG	4	43896	43906	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
59	NC_021438	TTTG	3	45040	45050	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272158
60	NC_021438	CAAA	3	45573	45583	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
61	NC_021438	AAAG	3	45624	45635	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	Non-Coding
62	NC_021438	TA	6	47648	47659	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
63	NC_021438	AACA	3	47927	47937	11	75 %	0 %	0 %	25 %	9 %	51272159
64	NC_021438	TTTC	3	48073	48084	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021438	CTTTTT	3	49144	49161	18	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	5 %	51272159
66	NC_021438	ATAA	3	49617	49628	12	75 %	25 %	0 %	0 %	8 %	51272159
67	NC_021438	TA	6	50509	50520	12	50 %	50 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
68	NC_021438	T	14	51252	51265	14	0 %	100 %	0 %	0 %	0 %	51272159
69	NC_021438	TCT	5	51497	51511	15	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	6 %	51272159
70	NC_021438	TTTC	3	52530	52540	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272159
71	NC_021438	TTTG	3	52871	52882	12	0 %	75 %	25 %	0 %	8 %	51272159
72	NC_021438	T	26	52894	52919	26	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51272159
73	NC_021438	TCT	7	53625	53644	20	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	51272159
74	NC_021438	CTCTTT	3	53645	53663	19	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	10 %	51272159
75	NC_021438	TC	6	53665	53675	11	0 %	50 %	0 %	50 %	9 %	51272159
76	NC_021438	TTC	4	53677	53687	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272159
77	NC_021438	T	17	53688	53704	17	0 %	100 %	0 %	0 %	5 %	51272159
78	NC_021438	CTTTT	4	55496	55516	21	0 %	80 %	0 %	20 %	9 %	51272159
79	NC_021438	T	15	56728	56742	15	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51272159
80	NC_021438	TTTA	3	56932	56943	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51272159
81	NC_021438	G	12	57197	57208	12	0 %	0 %	100 %	0 %	0 %	51272159
82	NC_021438	TTCT	3	57971	57982	12	0 %	75 %	0 %	25 %	8 %	51272159
83	NC_021438	ACT	4	58581	58591	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272159
84	NC_021438	TAATCT	3	59355	59371	17	33.33 %	50 %	0 %	16.67 %	5 %	51272159
85	NC_021438	AT	9	60832	60848	17	50 %	50 %	0 %	0 %	5 %	51272159
86	NC_021438	T	13	61449	61461	13	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51272159
87	NC_021438	TA	7	62907	62920	14	50 %	50 %	0 %	0 %	7 %	51272159
88	NC_021438	A	12	63382	63393	12	100 %	0 %	0 %	0 %	0 %	51272159
89	NC_021438	ATT	4	63640	63651	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272159
90	NC_021438	TTA	4	64922	64933	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272159
91	NC_021438	TTTG	3	64934	64944	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272159
92	NC_021438	TTTG	3	65303	65313	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272159
93	NC_021438	GAAA	3	65868	65879	12	75 %	0 %	25 %	0 %	8 %	51272159
94	NC_021438	TTTG	3	67340	67351	12	0 %	75 %	25 %	0 %	0 %	51272159
95	NC_021438	A	15	67734	67748	15	100 %	0 %	0 %	0 %	6 %	51272159
96	NC_021438	TA	6	68069	68079	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272159
97	NC_021438	CGAAA	3	68323	68336	14	60 %	0 %	20 %	20 %	7 %	51272159
98	NC_021438	ATGA	3	68398	68409	12	50 %	25 %	25 %	0 %	8 %	51272159
99	NC_021438	AT	6	68788	68798	11	50 %	50 %	0 %	0 %	9 %	51272159
100	NC_021438	GATT	3	69057	69068	12	25 %	50 %	25 %	0 %	8 %	51272159
101	NC_021438	TCGAAT	3	71475	71492	18	33.33 %	33.33 %	16.67 %	16.67 %	5 %	51272159
102	NC_021438	TAA	5	71543	71557	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51272159
103	NC_021438	AGA	4	71566	71578	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51272159
104	NC_021438	AGA	7	73673	73693	21	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	4 %	51272159
105	NC_021438	AGA	5	73697	73711	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	51272159
106	NC_021438	AAAAAG	4	73718	73741	24	83.33 %	0 %	16.67 %	0 %	8 %	51272159
107	NC_021438	GTT	4	74221	74231	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51272159
108	NC_021438	CTTT	3	74432	74443	12	0 %	75 %	0 %	25 %	0 %	51272159
109	NC_021438	TGTT	3	75473	75483	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272159
110	NC_021438	TTTTG	3	75608	75621	14	0 %	80 %	20 %	0 %	7 %	51272159
111	NC_021438	TAC	4	76313	76324	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51272159
112	NC_021438	TCT	4	76700	76712	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	Non-Coding
113	NC_021438	GGTAG	3	80462	80475	14	20 %	20 %	60 %	0 %	7 %	Non-Coding
114	NC_021438	GAGG	3	82671	82682	12	25 %	0 %	75 %	0 %	8 %	Non-Coding
115	NC_021438	AGGT	3	82889	82900	12	25 %	25 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
116	NC_021438	CTGAT	3	84253	84266	14	20 %	40 %	20 %	20 %	7 %	Non-Coding
117	NC_021438	CTTT	3	84435	84445	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	Non-Coding
118	NC_021438	AACC	3	84481	84493	13	50 %	0 %	0 %	50 %	7 %	Non-Coding
119	NC_021438	AAGA	3	87138	87149	12	75 %	0 %	25 %	0 %	0 %	51272161
120	NC_021438	T	12	87914	87925	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
121	NC_021438	A	14	88875	88888	14	100 %	0 %	0 %	0 %	7 %	51272162
122	NC_021438	T	14	89101	89114	14	0 %	100 %	0 %	0 %	7 %	51272162
123	NC_021438	TTCT	3	89859	89869	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
124	NC_021438	TTCT	3	89943	89953	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
125	NC_021438	TTCT	3	89973	89983	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
126	NC_021438	TTCT	3	90057	90067	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
127	NC_021438	TTCT	3	90117	90127	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
128	NC_021438	GTTT	3	90568	90578	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272162
129	NC_021438	CTTT	3	90960	90970	11	0 %	75 %	0 %	25 %	9 %	51272162
130	NC_021438	GTTT	3	91149	91159	11	0 %	75 %	25 %	0 %	9 %	51272162
131	NC_021438	TTTTTC	3	91250	91268	19	0 %	83.33 %	0 %	16.67 %	10 %	51272162
132	NC_021438	ATTT	3	91498	91509	12	25 %	75 %	0 %	0 %	8 %	51272162
133	NC_021438	ATTTT	3	91975	91989	15	20 %	80 %	0 %	0 %	6 %	51272162
134	NC_021438	T	12	92623	92634	12	0 %	100 %	0 %	0 %	8 %	51272162
135	NC_021438	T	16	93036	93051	16	0 %	100 %	0 %	0 %	6 %	51272162
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162	NC_021438	CAT	4	114890	114900	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Imperfect Repeats of Gnetum montanum chloroplast