ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Cunninghamia lanceolata chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021437GCT4602613120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272147
2NC_021437CTTT312961306110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
3NC_021437TATT3177117821225 %75 %0 %0 %8 %51272147
4NC_021437TTGA3202920401225 %50 %25 %0 %0 %51272147
5NC_021437ATC4209321031133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272147
6NC_021437AAG4230723181266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272147
7NC_021437TCCA3292229331225 %25 %0 %50 %0 %51272147
8NC_021437AAAATT3313031481966.67 %33.33 %0 %0 %10 %51272147
9NC_021437ATG4318131921233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272147
10NC_021437TAAA3413441451275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
11NC_021437A154236425015100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
12NC_021437AAT4465346641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_021437ATCT3507550861225 %50 %0 %25 %8 %51272147
14NC_021437ATCT3509651071225 %50 %0 %25 %8 %51272147
15NC_021437T1455275540140 %100 %0 %0 %0 %51272147
16NC_021437CTAG3590059111225 %25 %25 %25 %8 %51272147
17NC_021437TCT475917602120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_021437ATT4776377741233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_021437CTT693189334170 %66.67 %0 %33.33 %5 %Non-Coding
20NC_021437TTTC393479357110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
21NC_021437AT8944294581750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
22NC_021437AT6951595261250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_021437T121004910060120 %100 %0 %0 %8 %51272148
24NC_021437AT1312302123282750 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
25NC_021437T181233112348180 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
26NC_021437AAAG317063170741275 %0 %25 %0 %8 %51272148
27NC_021437GAAA317111171211175 %0 %25 %0 %9 %51272148
28NC_021437TA617742177521150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
29NC_021437AAT417820178301166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
30NC_021437CT61847118481110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
31NC_021437CTG41872118732120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272148
32NC_021437AG619237192481250 %0 %50 %0 %8 %51272148
33NC_021437T282131121338280 %100 %0 %0 %3 %Non-Coding
34NC_021437CTTTT32174121755150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
35NC_021437AATT321849218611350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_021437ATT422225222361233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
37NC_021437A14223072232014100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
38NC_021437AAT422613226231166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
39NC_021437AGA422703227141266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
40NC_021437T122444024451120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
41NC_021437AT724476244891450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
42NC_021437TAT424771247811133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
43NC_021437T122524025251120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_021437ATTTT326019260321420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
45NC_021437TAA426069260801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
46NC_021437GGAT326595266051125 %25 %50 %0 %9 %Non-Coding
47NC_021437AAAT327251272621275 %25 %0 %0 %8 %51272148
48NC_021437A13276442765613100 %0 %0 %0 %7 %51272148
49NC_021437ACG427841278521233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272148
50NC_021437ACG427856278671233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272148
51NC_021437ACG427871278821233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272148
52NC_021437ACG427886278971233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272148
53NC_021437ACG427901279121233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272148
54NC_021437TTAT328524285351225 %75 %0 %0 %8 %51272148
55NC_021437AGA529453294671566.67 %0 %33.33 %0 %6 %51272148
56NC_021437AAC430498305091266.67 %0 %0 %33.33 %8 %51272149
57NC_021437CGAAAA330838308551866.67 %0 %16.67 %16.67 %5 %51272149
58NC_021437TTAG332199322091125 %50 %25 %0 %9 %51272149
59NC_021437CAA433084330951266.67 %0 %0 %33.33 %8 %51272149
60NC_021437AT634827348371150 %50 %0 %0 %9 %51272149
61NC_021437AAATA335084350981580 %20 %0 %0 %6 %51272149
62NC_021437ATTC335182351931225 %50 %0 %25 %8 %51272149
63NC_021437TCT43522935241130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51272149
64NC_021437A14365333654614100 %0 %0 %0 %0 %51272149
65NC_021437AAAT336557365681275 %25 %0 %0 %8 %51272149
66NC_021437GCT43704237053120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272149
67NC_021437A13371683718013100 %0 %0 %0 %7 %51272149
68NC_021437A13375163752813100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
69NC_021437GAAA337601376121275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
70NC_021437ATT437641376511133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_021437AT638845388561250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
72NC_021437AT938867388841850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
73NC_021437TAAA338937389481275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
74NC_021437CAAT339086390981350 %25 %0 %25 %7 %Non-Coding
75NC_021437CTG43917039181120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272149
76NC_021437AAAT339805398171375 %25 %0 %0 %7 %51272149
77NC_021437AAC440338403491266.67 %0 %0 %33.33 %8 %51272149
78NC_021437TTGA340406404171225 %50 %25 %0 %8 %51272149
79NC_021437A12404594047012100 %0 %0 %0 %8 %51272149
80NC_021437GCGA340713407241225 %0 %50 %25 %8 %51272149
81NC_021437AT641005410171350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
82NC_021437ATTG341578415881125 %50 %25 %0 %9 %51272149
83NC_021437CTT44257842589120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272149
84NC_021437TTTC34314543155110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
85NC_021437TA643984439941150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
86NC_021437TTA543999440131533.33 %66.67 %0 %0 %0 %Non-Coding
87NC_021437TC64461044621120 %50 %0 %50 %8 %Non-Coding
88NC_021437CA644985449961250 %0 %0 %50 %8 %Non-Coding
89NC_021437AAAG347229472401275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
90NC_021437CTAC348806488171225 %25 %0 %50 %0 %Non-Coding
91NC_021437CTA450547505571133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
92NC_021437TCTGA350632506451420 %40 %20 %20 %7 %Non-Coding
93NC_021437TGAA350897509071150 %25 %25 %0 %9 %Non-Coding
94NC_021437AGG452637526471133.33 %0 %66.67 %0 %9 %Non-Coding
95NC_021437CTTG35268052691120 %50 %25 %25 %8 %Non-Coding
96NC_021437CCTT35425954269110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
97NC_021437AT1654729547613350 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
98NC_021437ATTA356038560491250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
99NC_021437A13563705638213100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
100NC_021437AT856467564811550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
101NC_021437AAAG356594566041175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
102NC_021437GTA456811568221233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272150
103NC_021437GAA458125581351166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51272150
104NC_021437TCT45838758397110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272150
105NC_021437AAAT359469594791175 %25 %0 %0 %9 %51272150
106NC_021437CGAAA361567615811560 %0 %20 %20 %6 %51272150
107NC_021437TTTA361819618311325 %75 %0 %0 %7 %51272150
108NC_021437AAAG362328623401375 %0 %25 %0 %7 %51272150
109NC_021437AATAA362380623931480 %20 %0 %0 %7 %51272150
110NC_021437GAA462426624371266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272150
111NC_021437GAA462441624521266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272150
112NC_021437GAA462456624671266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272150
113NC_021437ATTC364785647961225 %50 %0 %25 %8 %51272150
114NC_021437AGA464912649221166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51272150
115NC_021437AAAT365471654821275 %25 %0 %0 %8 %51272150
116NC_021437TAGG365683656941225 %25 %50 %0 %8 %51272150
117NC_021437GAAA366026660361175 %0 %25 %0 %9 %51272150
118NC_021437ATCT367952679631225 %50 %0 %25 %0 %51272150
119NC_021437TGA468179681901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272150
120NC_021437AAG468206682161166.67 %0 %33.33 %0 %9 %51272150
121NC_021437TTTTA368677686901420 %80 %0 %0 %7 %51272150
122NC_021437GTA468702687121133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51272150
123NC_021437AAT468970689811266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272150
124NC_021437TAA469524695351266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272150
125NC_021437A13697906980213100 %0 %0 %0 %7 %51272150
126NC_021437AATT370312703221150 %50 %0 %0 %9 %51272150
127NC_021437ATAAA371731717451580 %20 %0 %0 %6 %51272150
128NC_021437TGAAG372153721661440 %20 %40 %0 %7 %51272150
129NC_021437A14727017271414100 %0 %0 %0 %7 %51272150
130NC_021437ATTG373054730641125 %50 %25 %0 %9 %51272150
131NC_021437A17734737348917100 %0 %0 %0 %0 %51272150
132NC_021437A25735937361725100 %0 %0 %0 %8 %51272150
133NC_021437TATGTA573936739653033.33 %50 %16.67 %0 %10 %51272150
134NC_021437CAAAA374130741431480 %0 %0 %20 %7 %51272150
135NC_021437A13751587517013100 %0 %0 %0 %7 %51272150
136NC_021437ATT475479754911333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272150
137NC_021437ATTT376315763271325 %75 %0 %0 %7 %51272150
138NC_021437AT1376359763842650 %50 %0 %0 %7 %51272150
139NC_021437T147640276415140 %100 %0 %0 %0 %51272150
140NC_021437ATA577446774601566.67 %33.33 %0 %0 %6 %51272150
141NC_021437T177894378959170 %100 %0 %0 %5 %51272150
142NC_021437TTA479115791261233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51272150
143NC_021437AGAT381124811341150 %25 %25 %0 %9 %51272150
144NC_021437CTTG38140881419120 %50 %25 %25 %8 %51272150
145NC_021437TCCATC382347823651916.67 %33.33 %0 %50 %10 %51272150
146NC_021437CATT383448834591225 %50 %0 %25 %8 %51272150
147NC_021437AT683898839091250 %50 %0 %0 %8 %51272150
148NC_021437T168431484329160 %100 %0 %0 %6 %51272150
149NC_021437TA785252852661550 %50 %0 %0 %6 %51272150
150NC_021437GTT48601086020110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51272150
151NC_021437TACC386476864861125 %25 %0 %50 %9 %51272150
152NC_021437GTAAA387164871771460 %20 %20 %0 %7 %51272150
153NC_021437TTA487397874081233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51272150
154NC_021437AT1187856878772250 %50 %0 %0 %9 %51272150
155NC_021437TTA488068880781133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51272150
156NC_021437TTAT388814888261325 %75 %0 %0 %7 %51272150
157NC_021437TTGT38932189332120 %75 %25 %0 %8 %51272150
158NC_021437A21906039062321100 %0 %0 %0 %4 %51272150
159NC_021437GAAAG390923909361460 %0 %40 %0 %7 %51272150
160NC_021437CTTT39103491044110 %75 %0 %25 %9 %51272150
161NC_021437AAAGA391625916381480 %0 %20 %0 %7 %51272150
162NC_021437AATA392077920881275 %25 %0 %0 %8 %51272150
163NC_021437CTTT39259192603130 %75 %0 %25 %7 %51272150
164NC_021437TAGA393788937981150 %25 %25 %0 %9 %51272150
165NC_021437GAA494261942721266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
166NC_021437TTAT394306943171225 %75 %0 %0 %0 %Non-Coding
167NC_021437AATAA394364943771480 %20 %0 %0 %7 %Non-Coding
168NC_021437TAT494521945331333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
169NC_021437AAT495008950191266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
170NC_021437AGT495158951691233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
171NC_021437AATT396536965471250 %50 %0 %0 %8 %51272153
172NC_021437GAA697335973531966.67 %0 %33.33 %0 %10 %51272153
173NC_021437AAC498074980851266.67 %0 %0 %33.33 %8 %51272153
174NC_021437GAA498136981471266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272153
175NC_021437AAAT399706997161175 %25 %0 %0 %9 %51272153
176NC_021437AAG41001241001361366.67 %0 %33.33 %0 %7 %51272153
177NC_021437AAAG31004341004441175 %0 %25 %0 %9 %51272153
178NC_021437AAGA31005931006041275 %0 %25 %0 %8 %51272153
179NC_021437AAAG31014321014421175 %0 %25 %0 %9 %51272153
180NC_021437AAT41017631017741266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272153
181NC_021437A1410448510449814100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
182NC_021437TAA41058751058851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272153
183NC_021437ATTA31059661059771250 %50 %0 %0 %8 %51272153
184NC_021437CAG41070261070371233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51272153
185NC_021437GAAA31073161073261175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
186NC_021437AATT31081091081191150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
187NC_021437GAA41088331088431166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
188NC_021437T14109787109800140 %100 %0 %0 %0 %51272154
189NC_021437GAAT31100601100701150 %25 %25 %0 %9 %51272154
190NC_021437A1411231011232314100 %0 %0 %0 %7 %51272154
191NC_021437ATAA31123891124001275 %25 %0 %0 %0 %Non-Coding
192NC_021437TTTC3113932113943120 %75 %0 %25 %0 %51272154
193NC_021437GGA41152101152201133.33 %0 %66.67 %0 %9 %51272154
194NC_021437TA61157251157351150 %50 %0 %0 %9 %51272154
195NC_021437TTCAT31161441161571420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
196NC_021437AG61165931166031150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
197NC_021437TATC31166681166791225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
198NC_021437GGAG31166921167021125 %0 %75 %0 %9 %Non-Coding
199NC_021437GAAA31167551167651175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
200NC_021437AGA41170461170571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
201NC_021437ATT41172411172531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
202NC_021437GGA41177891178001233.33 %0 %66.67 %0 %8 %Non-Coding
203NC_021437CAAT31185711185811150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
204NC_021437ATC51186521186661533.33 %33.33 %0 %33.33 %6 %Non-Coding
205NC_021437TTC4119231119242120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
206NC_021437TA61196391196501250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
207NC_021437AT111197011197222250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
208NC_021437ATGTAT31197291197471933.33 %50 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
209NC_021437A1411979111980414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
210NC_021437ATCT31200531200631125 %50 %0 %25 %9 %51272154
211NC_021437CTT4120595120606120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272154
212NC_021437TTTTA31212081212211420 %80 %0 %0 %7 %51272154
213NC_021437TCTT3121226121236110 %75 %0 %25 %9 %51272154
214NC_021437ATTTT31222201222341520 %80 %0 %0 %6 %Non-Coding
215NC_021437T15122245122259150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
216NC_021437TA141223461223722750 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
217NC_021437GCT4124311124322120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272154
218NC_021437TTA41248681248791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
219NC_021437TTTC3124910124921120 %75 %0 %25 %8 %51272154
220NC_021437A1912680812682619100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
221NC_021437ATA41282731282851366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
222NC_021437ATT81284911285152533.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
223NC_021437T16128511128526160 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
224NC_021437TTTA31290671290781225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
225NC_021437TA71308111308241450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
226NC_021437ATT41308871308991333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
227NC_021437AT101312621312832250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
228NC_021437TTTC3131375131386120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
229NC_021437AATA31315721315831275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
230NC_021437AT71316851316971350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
231NC_021437TTGA31325371325481225 %50 %25 %0 %8 %51272155
232NC_021437CTTTT3134210134224150 %80 %0 %20 %6 %Non-Coding
233NC_021437TA91346671346841850 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
234NC_021437TATT51350251350442025 %75 %0 %0 %10 %Non-Coding
235NC_021437TTTG3135117135128120 %75 %25 %0 %8 %Non-Coding