ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cunninghamia lanceolata chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021437	GCT	4	602	613	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272147
2	NC_021437	ATC	4	2093	2103	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	51272147
3	NC_021437	AAG	4	2307	2318	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272147
4	NC_021437	ATG	4	3181	3192	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272147
5	NC_021437	AAT	4	4653	4664	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
6	NC_021437	TCT	4	7591	7602	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
7	NC_021437	ATT	4	7763	7774	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021437	CTT	6	9318	9334	17	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	5 %	Non-Coding
9	NC_021437	AAT	4	17820	17830	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
10	NC_021437	CTG	4	18721	18732	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
11	NC_021437	ATT	4	22225	22236	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
12	NC_021437	AAT	4	22613	22623	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
13	NC_021437	AGA	4	22703	22714	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
14	NC_021437	TAT	4	24771	24781	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021437	TAA	4	26069	26080	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
16	NC_021437	ACG	4	27841	27852	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
17	NC_021437	ACG	4	27856	27867	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
18	NC_021437	ACG	4	27871	27882	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
19	NC_021437	ACG	4	27886	27897	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
20	NC_021437	ACG	4	27901	27912	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272148
21	NC_021437	AGA	5	29453	29467	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	51272148
22	NC_021437	AAC	4	30498	30509	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272149
23	NC_021437	CAA	4	33084	33095	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272149
24	NC_021437	TCT	4	35229	35241	13	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	7 %	51272149
25	NC_021437	GCT	4	37042	37053	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272149
26	NC_021437	ATT	4	37641	37651	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
27	NC_021437	CTG	4	39170	39181	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272149
28	NC_021437	AAC	4	40338	40349	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272149
29	NC_021437	CTT	4	42578	42589	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272149
30	NC_021437	TTA	5	43999	44013	15	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021437	CTA	4	50547	50557	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
32	NC_021437	AGG	4	52637	52647	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	Non-Coding
33	NC_021437	GTA	4	56811	56822	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272150
34	NC_021437	GAA	4	58125	58135	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272150
35	NC_021437	TCT	4	58387	58397	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51272150
36	NC_021437	GAA	4	62426	62437	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272150
37	NC_021437	GAA	4	62441	62452	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272150
38	NC_021437	GAA	4	62456	62467	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272150
39	NC_021437	AGA	4	64912	64922	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272150
40	NC_021437	TGA	4	68179	68190	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51272150
41	NC_021437	AAG	4	68206	68216	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	51272150
42	NC_021437	GTA	4	68702	68712	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51272150
43	NC_021437	AAT	4	68970	68981	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272150
44	NC_021437	TAA	4	69524	69535	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272150
45	NC_021437	ATT	4	75479	75491	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51272150
46	NC_021437	ATA	5	77446	77460	15	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	51272150
47	NC_021437	TTA	4	79115	79126	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272150
48	NC_021437	GTT	4	86010	86020	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51272150
49	NC_021437	TTA	4	87397	87408	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	51272150
50	NC_021437	TTA	4	88068	88078	11	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	51272150
51	NC_021437	GAA	4	94261	94272	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
52	NC_021437	TAT	4	94521	94533	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
53	NC_021437	AAT	4	95008	95019	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
54	NC_021437	AGT	4	95158	95169	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
55	NC_021437	GAA	6	97335	97353	19	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	10 %	51272153
56	NC_021437	AAC	4	98074	98085	12	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	8 %	51272153
57	NC_021437	GAA	4	98136	98147	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51272153
58	NC_021437	AAG	4	100124	100136	13	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	7 %	51272153
59	NC_021437	AAT	4	101763	101774	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51272153
60	NC_021437	TAA	4	105875	105885	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51272153
61	NC_021437	CAG	4	107026	107037	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272153
62	NC_021437	GAA	4	108833	108843	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
63	NC_021437	GGA	4	115210	115220	11	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	9 %	51272154
64	NC_021437	AGA	4	117046	117057	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	Non-Coding
65	NC_021437	ATT	4	117241	117253	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
66	NC_021437	GGA	4	117789	117800	12	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	8 %	Non-Coding
67	NC_021437	ATC	5	118652	118666	15	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	6 %	Non-Coding
68	NC_021437	TTC	4	119231	119242	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
69	NC_021437	CTT	4	120595	120606	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51272154
70	NC_021437	GCT	4	124311	124322	12	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51272154
71	NC_021437	TTA	4	124868	124879	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
72	NC_021437	ATA	4	128273	128285	13	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
73	NC_021437	ATT	8	128491	128515	25	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
74	NC_021437	ATT	4	130887	130899	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cunninghamia lanceolata chloroplast