Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium mannii voucher KUN:YJB100602 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021433TTC418591870120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194356
2NC_021433TCT440094020120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_021433ATT4402440341133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_021433TGC41562915640120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51194358
5NC_021433TCT42174121751110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51194355
6NC_021433TTC42213322144120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194355
7NC_021433GTT42323923250120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51194355
8NC_021433TAG431982319921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
9NC_021433TAA432242322531266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_021433ATG439474394841133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194355
11NC_021433ATT544494445081533.33 %66.67 %0 %0 %0 %51194355
12NC_021433TTG44479244802110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51194355
13NC_021433GTT44565745668120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
14NC_021433AGT446518465291233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194358
15NC_021433TTC44725547266120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
16NC_021433TAA448375483861266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
17NC_021433TCT45000350014120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194358
18NC_021433AAT451553515641266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
19NC_021433CTA451679516901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_021433ATT453013530251333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194358
21NC_021433TTG45574555755110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
22NC_021433TAT459123591341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194356
23NC_021433CTT46167061681120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
24NC_021433CTA464888648991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
25NC_021433TTA465970659811233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
26NC_021433AGA567847678621666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
27NC_021433TTC46908569097130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
28NC_021433TTC47075070761120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194354
29NC_021433TAT471415714271333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194354
30NC_021433ATT472293723051333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194354
31NC_021433ATT484184841951233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194354
32NC_021433CTT48600286013120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194354
33NC_021433GAT487841878511133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194354
34NC_021433GAT490857908681233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194354
35NC_021433TGA492566925771233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194354
36NC_021433TAC499967999781233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194354
37NC_021433AAG41003751003861266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194362
38NC_021433TAT41009341009441133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51194362
39NC_021433AAG41127641127751266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194362
40NC_021433ATA41136881136991266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194362
41NC_021433ATA41140151140271366.67 %33.33 %0 %0 %7 %51194362
42NC_021433TTA41148721148841333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194362
43NC_021433AAT41214901215011266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194362
44NC_021433ATA41243571243681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194362
45NC_021433CTT4126654126665120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194362
46NC_021433TTC5128242128256150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51194362
47NC_021433CAT41286071286171133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51194362
48NC_021433AAT41395761395861166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51194362
49NC_021433GAG41399591399701233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51194362
50NC_021433GTA41405431405541233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194362
51NC_021433ATC41496531496641233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194355
52NC_021433ATC41526701526801133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding