Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium tracyanum voucher KUN:YJB100606 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021432TTC418451856120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194345
2NC_021432ATA4342734381266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
3NC_021432TCT439994010120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
4NC_021432ATT4401440241133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
5NC_021432TCT41493414944110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
6NC_021432TGC41542615437120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51194347
7NC_021432TTC42195421965120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194345
8NC_021432GTT42305423065120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51194345
9NC_021432ATA429380293911266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
10NC_021432AGT531733317461433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
11NC_021432TAA431974319851266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_021432ATG439143391531133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194345
13NC_021432ATT444188441991233.33 %66.67 %0 %0 %0 %51194345
14NC_021432TTG44448344493110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51194345
15NC_021432GTT44535845369120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
16NC_021432AGT446220462311233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194348
17NC_021432TTC44695246963120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
18NC_021432TCT44974549756120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194348
19NC_021432AAT451398514091266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
20NC_021432CTA451524515351233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
21NC_021432ATA452622526321166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
22NC_021432ATT452852528641333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194348
23NC_021432ATT655205552211733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
24NC_021432TTG45557455584110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_021432TAT458342583531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194346
26NC_021432TAT459001590121233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194346
27NC_021432CTT46153461545120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
28NC_021432CTA464693647041233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
29NC_021432TTA465768657791233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_021432AGA567609676241666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
31NC_021432TTC46884868860130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
32NC_021432TTC47052070531120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194344
33NC_021432TAT471176711881333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194344
34NC_021432ATT472054720661333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194344
35NC_021432TAT477623776341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194344
36NC_021432ATT483931839421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194344
37NC_021432CTT48572285733120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194344
38NC_021432GAT487561875711133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194344
39NC_021432GAT490556905671233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194344
40NC_021432TGA492265922761233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194344
41NC_021432TCT49856398575130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51194344
42NC_021432TAC499955999661233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194344
43NC_021432AAG41003631003741266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194352
44NC_021432TAT41009161009261133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51194352
45NC_021432AAG41129941130051266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194352
46NC_021432ATA41139251139361266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194352
47NC_021432TTA41152391152511333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194352
48NC_021432ATA41218101218211266.67 %33.33 %0 %0 %0 %51194352
49NC_021432ATA41246211246321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194352
50NC_021432ATA41249661249771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194352
51NC_021432ATT51259601259731433.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194352
52NC_021432CTT4127248127259120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194352
53NC_021432TCT8128834128857240 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194352
54NC_021432CAT41292071292171133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51194352
55NC_021432GAG41407111407221233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51194352
56NC_021432GTA41412891413001233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194352
57NC_021432AAG41426791426911366.67 %0 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
58NC_021432ATC41506881506991233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194344
59NC_021432ATC41536841536941133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding