Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium tortisepalum voucher KUN:HJL091027 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021431ATA7348235032266.67 %33.33 %0 %0 %4 %Non-Coding
2NC_021431TCT440954106120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_021431ATT4411041201133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_021431TCT41525815268110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_021431TGC41575015761120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51272142
6NC_021431TCT42188721897110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51272140
7NC_021431TTC42227922290120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272140
8NC_021431GTT42339323404120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51272140
9NC_021431TAA429848298601366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_021431TAA429875298871366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_021431AGT532254322671433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
12NC_021431TAA432487324981266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_021431ATG439726397361133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51272140
14NC_021431ATT444758447691233.33 %66.67 %0 %0 %0 %51272140
15NC_021431TTG44505345063110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51272140
16NC_021431TAA446379463901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272143
17NC_021431AGT446531465421233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272143
18NC_021431TTC44729347304120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_021431TCT45011550126120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272143
20NC_021431AAT451774517851266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_021431CTA451900519111233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_021431ATT453229532411333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272143
23NC_021431ATT655552555681733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
24NC_021431TTG45586055870110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_021431TAT458622586331233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51272141
26NC_021431TAT459281592921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51272141
27NC_021431CTT46178661797120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
28NC_021431TAT464089641011333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_021431TTA465700657111233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_021431AGA567564675791666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
31NC_021431TTC46882068832130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
32NC_021431TTC47050270513120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272139
33NC_021431TAT471159711711333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272139
34NC_021431ATT483939839501233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51272139
35NC_021431CTT48575685767120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272139
36NC_021431GAT487595876051133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51272139
37NC_021431GAT490608906191233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272139
38NC_021431TGA492308923191233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272139
39NC_021431TAC4999981000091233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51272139
40NC_021431AAG41004061004171266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272147
41NC_021431TAT41009621009721133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51272147
42NC_021431AAG41129501129611266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51272147
43NC_021431ATA41139751139871366.67 %33.33 %0 %0 %7 %51272147
44NC_021431TTA41148261148381333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272147
45NC_021431ATT41149411149531333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272147
46NC_021431TTA41215041215141133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51272147
47NC_021431ATA41239721239831266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272147
48NC_021431ATA41243301243411266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51272147
49NC_021431ATT51253241253371433.33 %66.67 %0 %0 %7 %51272147
50NC_021431CTT4126612126623120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51272147
51NC_021431TTC5128200128214150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51272147
52NC_021431CAT41285651285751133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51272147
53NC_021431AAT41396311396411166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51272147
54NC_021431GAG41400141400251233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51272147
55NC_021431GTA41405951406061233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51272147
56NC_021431ATC41499851499961233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51272139
57NC_021431ATC41529991530091133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding