ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Hexa-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium sinense voucher KUN:YJB100605 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021430AGAAAA4473447562383.33 %0 %16.67 %0 %4 %Non-Coding
2NC_021430ATTTTC3659266101916.67 %66.67 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
3NC_021430CAAAAA312415124321883.33 %0 %0 %16.67 %5 %51194335
4NC_021430TCTTTT31595415971180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
5NC_021430AATAGA327840278581966.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
6NC_021430TTTTTC32873328750180 %83.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
7NC_021430TATAGA331972319901950 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
8NC_021430TCATAT332255322731933.33 %50 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
9NC_021430AGAAAT345931459481866.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
10NC_021430ATCATA354830548481950 %33.33 %0 %16.67 %5 %51194335
11NC_021430TTATAA459933599572550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_021430TTCTTT46781167834240 %83.33 %0 %16.67 %8 %Non-Coding
13NC_021430TTATAT372567725851933.33 %66.67 %0 %0 %10 %51194333
14NC_021430TTTGTT39905099068190 %83.33 %16.67 %0 %10 %51194333
15NC_021430TTAGTT31010081010251816.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %51194341
16NC_021430ATTGAT31143521143691833.33 %50 %16.67 %0 %5 %51194341
17NC_021430ATTTCT31204061204241916.67 %66.67 %0 %16.67 %10 %51194341
18NC_021430TTGATT31268111268291916.67 %66.67 %16.67 %0 %5 %51194341
19NC_021430TTATCA31280361280541933.33 %50 %0 %16.67 %10 %51194341