Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium sinense voucher KUN:YJB100605 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021430ATA7344634672266.67 %33.33 %0 %0 %4 %Non-Coding
2NC_021430TCT440324043120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
3NC_021430ATT4404740571133.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
4NC_021430TCT41518415194110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
5NC_021430TGC41567615687120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %51194336
6NC_021430TCT42181221822110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51194334
7NC_021430TTC42220422215120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194334
8NC_021430GTT42331823329120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51194334
9NC_021430TAA429778297901366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
10NC_021430TAA429805298171366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
11NC_021430AGT532156321691433.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
12NC_021430TAA432389324001266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
13NC_021430ATG439628396381133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194334
14NC_021430ATT444660446711233.33 %66.67 %0 %0 %0 %51194334
15NC_021430TTG44495544965110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51194334
16NC_021430TAA446281462921266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194336
17NC_021430AGT446433464441233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194336
18NC_021430TTC44719747208120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
19NC_021430TCT45002050031120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194337
20NC_021430AAT451671516821266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_021430CTA451797518081233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
22NC_021430ATT453126531381333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194337
23NC_021430ATT655449554651733.33 %66.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
24NC_021430TTG45577055780110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_021430TAT458505585161233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194335
26NC_021430TAT459164591751233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194335
27NC_021430CTT46171661727120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
28NC_021430TAT464031640431333.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
29NC_021430TTA465642656531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
30NC_021430AGA567496675111666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
31NC_021430TTC46877768789130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
32NC_021430TTC47045870469120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194333
33NC_021430TAT471115711271333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194333
34NC_021430ATT483883838941233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51194333
35NC_021430CTT48570085711120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194333
36NC_021430GAT487539875491133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51194333
37NC_021430GAT490552905631233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194333
38NC_021430TGA492261922721233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194333
39NC_021430TAC499951999621233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194333
40NC_021430AAG41003591003701266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194341
41NC_021430TAT41009151009251133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51194341
42NC_021430AAG41128991129101266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51194341
43NC_021430TTA41147461147581333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194341
44NC_021430ATT41148611148731333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194341
45NC_021430TTA41214161214261133.33 %66.67 %0 %0 %9 %51194341
46NC_021430ATA41238851238961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194341
47NC_021430ATA41242431242541266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51194341
48NC_021430ATT51252371252501433.33 %66.67 %0 %0 %7 %51194341
49NC_021430CTT4126525126536120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51194341
50NC_021430TTC5128113128127150 %66.67 %0 %33.33 %6 %51194341
51NC_021430CAT41284781284881133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %51194341
52NC_021430AAT41395431395531166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51194341
53NC_021430GAG41399261399371233.33 %0 %66.67 %0 %8 %51194341
54NC_021430GTA41405071405181233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51194341
55NC_021430ATC41499061499171233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51194333
56NC_021430ATC41529201529301133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding