ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Cymbidium sinense voucher KUN:YJB100605 chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021430	AT	6	99	110	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021430	ATA	4	3456	3467	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021430	A	14	3762	3775	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021430	T	13	4063	4075	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021430	AT	11	4671	4692	22	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021430	A	14	6806	6819	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021430	GTCT	3	11124	11135	12	0 %	50 %	25 %	25 %	51194334
8	NC_021430	T	13	13320	13332	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021430	T	13	18168	18180	13	0 %	100 %	0 %	0 %	51194333
10	NC_021430	A	12	22399	22410	12	100 %	0 %	0 %	0 %	51194334
11	NC_021430	AT	7	27893	27906	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021430	T	14	43129	43142	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021430	ATT	4	44660	44671	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	51194334
14	NC_021430	TA	7	46836	46849	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021430	A	14	47397	47410	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021430	AT	6	47474	47485	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021430	TCTT	3	48708	48719	12	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
18	NC_021430	T	14	48718	48731	14	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021430	TA	7	57429	57442	14	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021430	T	12	65778	65789	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021430	A	14	67101	67114	14	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021430	AGA	4	67500	67511	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
23	NC_021430	ATTA	3	67556	67567	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021430	T	15	68883	68897	15	0 %	100 %	0 %	0 %	51194337
25	NC_021430	T	12	71171	71182	12	0 %	100 %	0 %	0 %	51194333
26	NC_021430	TA	6	72678	72689	12	50 %	50 %	0 %	0 %	51194333
27	NC_021430	T	17	77542	77558	17	0 %	100 %	0 %	0 %	51194333
28	NC_021430	ATAA	3	119593	119604	12	75 %	25 %	0 %	0 %	51194341
29	NC_021430	AAGA	3	121367	121378	12	75 %	0 %	25 %	0 %	51194341
30	NC_021430	GAAA	3	121977	121988	12	75 %	0 %	25 %	0 %	51194341
31	NC_021430	A	13	123820	123832	13	100 %	0 %	0 %	0 %	51194341
32	NC_021430	T	12	125404	125415	12	0 %	100 %	0 %	0 %	51194341
33	NC_021430	T	14	128464	128477	14	0 %	100 %	0 %	0 %	51194341
34	NC_021430	A	12	128746	128757	12	100 %	0 %	0 %	0 %	51194341

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Cymbidium sinense voucher KUN:YJB100605 chloroplast