Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Cymbidium aloifolium voucher KUN:YJB100604 chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021429TTC418731884120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085049
2NC_021429ATA4345434651266.67 %33.33 %0 %0 %0 %Non-Coding
3NC_021429TAA4376837791266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
4NC_021429TCT440454056120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
5NC_021429ATA4637563851166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
6NC_021429TCT41521115221110 %66.67 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
7NC_021429TGC41570315714120 %33.33 %33.33 %33.33 %8 %52085051
8NC_021429TCT42184021850110 %66.67 %0 %33.33 %9 %52085049
9NC_021429TTC42223222243120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085049
10NC_021429GTT42334823359120 %66.67 %33.33 %0 %8 %52085049
11NC_021429ATA429767297781266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
12NC_021429TAG432076320861133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
13NC_021429TAA432318323291266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
14NC_021429ATG439586395961133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %52085049
15NC_021429ATT544608446221533.33 %66.67 %0 %0 %6 %52085049
16NC_021429TTG44490644916110 %66.67 %33.33 %0 %9 %52085049
17NC_021429GTT44577345784120 %66.67 %33.33 %0 %8 %Non-Coding
18NC_021429AGT446627466381233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %52085051
19NC_021429TTC44736647377120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
20NC_021429TAA448457484681266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
21NC_021429TCT45007350084120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085052
22NC_021429CTA451879518901233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
23NC_021429ATT453214532261333.33 %66.67 %0 %0 %7 %52085052
24NC_021429TTG45600356013110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
25NC_021429TAT459381593921233.33 %66.67 %0 %0 %8 %52085050
26NC_021429CTT46194061951120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
27NC_021429CTA465183651941233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
28NC_021429AGA568145681601666.67 %0 %33.33 %0 %6 %Non-Coding
29NC_021429TTC46940469416130 %66.67 %0 %33.33 %7 %Non-Coding
30NC_021429TTC47106871079120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085048
31NC_021429TAT471733717451333.33 %66.67 %0 %0 %7 %52085048
32NC_021429ATT472616726281333.33 %66.67 %0 %0 %7 %52085048
33NC_021429GAA486386863961166.67 %0 %33.33 %0 %9 %52085048
34NC_021429CTT48642186432120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085048
35NC_021429GAT488260882701133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %52085048
36NC_021429GAT491276912871233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %52085048
37NC_021429TGA492985929961233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %52085048
38NC_021429TAC41006571006681233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %52085048
39NC_021429AAG41010651010761266.67 %0 %33.33 %0 %8 %52085056
40NC_021429TAT41016181016281133.33 %66.67 %0 %0 %9 %52085056
41NC_021429AAG41136461136571266.67 %0 %33.33 %0 %8 %52085056
42NC_021429ATA41145851145961266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52085056
43NC_021429ATA41150891151011366.67 %33.33 %0 %0 %7 %52085056
44NC_021429TTA41159371159491333.33 %66.67 %0 %0 %7 %52085056
45NC_021429TAC41207931208041233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %52085056
46NC_021429TTA41226801226901133.33 %66.67 %0 %0 %9 %52085056
47NC_021429TAA41251661251771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52085056
48NC_021429ATA41252211252321266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52085056
49NC_021429ATA41255791255901266.67 %33.33 %0 %0 %8 %52085056
50NC_021429CTT4127861127872120 %66.67 %0 %33.33 %8 %52085056
51NC_021429TTC5129449129463150 %66.67 %0 %33.33 %6 %52085056
52NC_021429CAT41298141298241133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %52085056
53NC_021429GAG41413001413111233.33 %0 %66.67 %0 %8 %52085056
54NC_021429GTA41418781418891233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %52085056
55NC_021429ATC41512591512701233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %52085048
56NC_021429ATC41542761542861133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding