Team
Contact

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Trochodendron aralioides chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021426A1721423017100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
2NC_021426CAG4111411251233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51134851
3NC_021426AAGT3122012301150 %25 %25 %0 %9 %51134851
4NC_021426AT6172417371450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
5NC_021426TA7173817511450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_021426AATGA3177317861460 %20 %20 %0 %7 %Non-Coding
7NC_021426GAA4221422251266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51134851
8NC_021426AAGA3375337641275 %0 %25 %0 %8 %Non-Coding
9NC_021426AATAAA3487048881983.33 %16.67 %0 %0 %10 %Non-Coding
10NC_021426AATAA4489949171980 %20 %0 %0 %5 %Non-Coding
11NC_021426AT7492149341450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_021426AT7494149541450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
13NC_021426TAA4496549791566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
14NC_021426AT18497650103550 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
15NC_021426TAA12500550423866.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
16NC_021426AT7503950531550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
17NC_021426TAA4506450781566.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
18NC_021426AT16507551073350 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
19NC_021426ATA6511851341766.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
20NC_021426AT7513751511550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
21NC_021426AAT4514951611366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
22NC_021426TAA4516651771266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
23NC_021426TA16517652063150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
24NC_021426TAA18520052505166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
25NC_021426ATA5526652811666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
26NC_021426TAA4528252941366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
27NC_021426AT7530553171350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
28NC_021426AAGA3563056401175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
29NC_021426T1556915705150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
30NC_021426GTTT358375848120 %75 %25 %0 %8 %51134851
31NC_021426TCTCT358795892140 %60 %0 %40 %7 %51134851
32NC_021426T1460216034140 %100 %0 %0 %7 %51134851
33NC_021426TTTTA3700570181420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
34NC_021426ATTT3810381131125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
35NC_021426TTAA3884188531350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
36NC_021426TTCT392029212110 %75 %0 %25 %9 %51134851
37NC_021426A179295931117100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
38NC_021426GATAA3932393371560 %20 %20 %0 %6 %Non-Coding
39NC_021426A12104111042212100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
40NC_021426ATCT311302113131225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
41NC_021426TTTC31152711537110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
42NC_021426T181470014717180 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
43NC_021426ATT414747147581233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
44NC_021426AAAT315339153501275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
45NC_021426TATTCA315779157971933.33 %50 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
46NC_021426CTA416326163361133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
47NC_021426A13164181643013100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
48NC_021426A12181331814412100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
49NC_021426TGT41843318443110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51134852
50NC_021426AT619216192271250 %50 %0 %0 %8 %51134852
51NC_021426TTCA324425244361225 %50 %0 %25 %8 %51134852
52NC_021426GAAT324516245261150 %25 %25 %0 %9 %51134852
53NC_021426GTT42536325374120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51134852
54NC_021426TCAT328668286781125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
55NC_021426CTAT329188291991225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
56NC_021426AAAT329446294561175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
57NC_021426CAG429938299491233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %Non-Coding
58NC_021426TTC73159331614220 %66.67 %0 %33.33 %4 %Non-Coding
59NC_021426AT834202342161550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
60NC_021426TAA534342343571666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
61NC_021426ATA434358343701366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
62NC_021426TAA634436344541966.67 %33.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
63NC_021426TAA434463344781666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
64NC_021426ATATTA334479344971950 %50 %0 %0 %10 %Non-Coding
65NC_021426AAT434509345201266.67 %33.33 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_021426AAT434527345391366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
67NC_021426ATAA534540345592075 %25 %0 %0 %10 %Non-Coding
68NC_021426ATA534557345701466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
69NC_021426ATA734574345942166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
70NC_021426ATA734598346192266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
71NC_021426ATA934659346842666.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
72NC_021426ATA434709347211366.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_021426ATA534725347401666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
74NC_021426TTTCT33489734910140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
75NC_021426AT636059360701250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
76NC_021426GAAA338001380121275 %0 %25 %0 %8 %51134852
77NC_021426GCTT33840438414110 %50 %25 %25 %9 %51134852
78NC_021426AATA339161391721275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
79NC_021426AG639192392021150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
80NC_021426TA639399394101250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
81NC_021426TAAA339442394521175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
82NC_021426AAT740000400212266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
83NC_021426AT740094401061350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
84NC_021426T134036640378130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
85NC_021426A12403804039112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
86NC_021426A13410514106313100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
87NC_021426ATG442438424481133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51134853
88NC_021426AATG343931439421250 %25 %25 %0 %8 %51134853
89NC_021426GCA444336443471233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51134853
90NC_021426TG64437344383110 %50 %50 %0 %9 %51134853
91NC_021426TTTCT34563945653150 %80 %0 %20 %0 %Non-Coding
92NC_021426A19461804619819100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
93NC_021426ATA447436474471266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51134853
94NC_021426TAAA448040480551675 %25 %0 %0 %6 %51134853
95NC_021426A15480494806315100 %0 %0 %0 %6 %51134853
96NC_021426A14483134832614100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
97NC_021426GTA448407484171133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
98NC_021426T154888048894150 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
99NC_021426T124892448935120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
100NC_021426GAAT350168501801350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
101NC_021426T155026250276150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
102NC_021426TTAG350547505571125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
103NC_021426ATCA350754507641150 %25 %0 %25 %9 %Non-Coding
104NC_021426TA650938509491250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
105NC_021426TTCAT350951509641420 %60 %0 %20 %7 %Non-Coding
106NC_021426A12510825109312100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
107NC_021426ATTAGA351253512691750 %33.33 %16.67 %0 %5 %Non-Coding
108NC_021426TTAGA351286513011640 %40 %20 %0 %6 %Non-Coding
109NC_021426A14514815149414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
110NC_021426TTGA351819518311325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
111NC_021426AGTT353039530501225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
112NC_021426T125314553156120 %100 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_021426T145333053343140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
114NC_021426ATTT355475554861225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
115NC_021426ATTTTT355529555471916.67 %83.33 %0 %0 %5 %Non-Coding
116NC_021426T145559555608140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
117NC_021426GACC356411564221225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
118NC_021426ACAA456431564451575 %0 %0 %25 %6 %Non-Coding
119NC_021426TATTT457515575342020 %80 %0 %0 %10 %Non-Coding
120NC_021426ATA559544595571466.67 %33.33 %0 %0 %7 %51134853
121NC_021426GTTA362344623541125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
122NC_021426TACG364251642621225 %25 %25 %25 %8 %Non-Coding
123NC_021426TA664263642741250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
124NC_021426ATT566359663721433.33 %66.67 %0 %0 %7 %Non-Coding
125NC_021426T156859568609150 %100 %0 %0 %6 %Non-Coding
126NC_021426TAAA368748687581175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
127NC_021426ATCTA368769687831540 %40 %0 %20 %0 %Non-Coding
128NC_021426CTA469434694451233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
129NC_021426AGT470486704981333.33 %33.33 %33.33 %0 %7 %Non-Coding
130NC_021426AAAG370527705381275 %0 %25 %0 %0 %Non-Coding
131NC_021426TTA471031710421233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
132NC_021426ATAAAA371344713611883.33 %16.67 %0 %0 %5 %Non-Coding
133NC_021426ATCATA372156721741950 %33.33 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
134NC_021426TTA772841728622233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
135NC_021426ATTG472867728811525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
136NC_021426T137292572937130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
137NC_021426CTT47293572946120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
138NC_021426AT773250732621350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
139NC_021426AT1173264732852250 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
140NC_021426A19737687378619100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
141NC_021426AGA473791738011166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
142NC_021426T137380573817130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
143NC_021426ATTTT374447744601420 %80 %0 %0 %7 %Non-Coding
144NC_021426AAAT374481744911175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
145NC_021426TAAA374561745711175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
146NC_021426TAAA374585745961275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
147NC_021426A23757147573623100 %0 %0 %0 %8 %51134851
148NC_021426TTTA375919759301225 %75 %0 %0 %8 %51134851
149NC_021426TCTTTT37599476011180 %83.33 %0 %16.67 %5 %51134851
150NC_021426TAT576220762351633.33 %66.67 %0 %0 %6 %51134851
151NC_021426TCT47626276274130 %66.67 %0 %33.33 %7 %51134851
152NC_021426A13766727668413100 %0 %0 %0 %7 %51134851
153NC_021426T147688776900140 %100 %0 %0 %0 %51134851
154NC_021426A14818148182714100 %0 %0 %0 %7 %51134851
155NC_021426GT68314883158110 %50 %50 %0 %9 %51134851
156NC_021426TTTTTA383265832831916.67 %83.33 %0 %0 %10 %51134851
157NC_021426A24832868330924100 %0 %0 %0 %8 %51134851
158NC_021426TTTCTT38354483562190 %83.33 %0 %16.67 %5 %51134851
159NC_021426TATTTG584894849222916.67 %66.67 %16.67 %0 %10 %51134851
160NC_021426GGA485449854611333.33 %0 %66.67 %0 %7 %51134851
161NC_021426TCCTT38572785742160 %60 %0 %40 %6 %51134851
162NC_021426TTTA385997860081225 %75 %0 %0 %0 %51134851
163NC_021426T138647686488130 %100 %0 %0 %0 %51134851
164NC_021426A14865208653314100 %0 %0 %0 %7 %51134851
165NC_021426GAAT387383873941250 %25 %25 %0 %8 %51134851
166NC_021426T128759087601120 %100 %0 %0 %8 %51134851
167NC_021426CAAT388206882161150 %25 %0 %25 %9 %51134851
168NC_021426T238959889620230 %100 %0 %0 %8 %51134851
169NC_021426CTT48972889739120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51134851
170NC_021426GAT491574915841133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51134851
171NC_021426TTCT39332893338110 %75 %0 %25 %9 %51134851
172NC_021426CTTT39452494534110 %75 %0 %25 %9 %51134851
173NC_021426GAT494679946901233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51134851
174NC_021426TGAT396364963761325 %50 %25 %0 %7 %51134851
175NC_021426TGA496415964261233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51134851
176NC_021426AATA397265972771375 %25 %0 %0 %7 %51134851
177NC_021426GAAGGA398051980681850 %0 %50 %0 %5 %51134851
178NC_021426TCCGG39996099974150 %20 %40 %40 %6 %51134851
179NC_021426TTTGTT3102987103005190 %83.33 %16.67 %0 %10 %51134851
180NC_021426ATCC31082481082591225 %25 %0 %50 %8 %51134855
181NC_021426TCTA31086491086601225 %50 %0 %25 %8 %51134855
182NC_021426AAGG31087931088031150 %0 %50 %0 %9 %51134855
183NC_021426GAGG31115171115281225 %0 %75 %0 %8 %51134855
184NC_021426AGGT31117301117411225 %25 %50 %0 %8 %51134855
185NC_021426TAAG31128501128601150 %25 %25 %0 %9 %51134855
186NC_021426AAAAT31134861135001580 %20 %0 %0 %6 %51134855
187NC_021426GGAA31149071149171150 %0 %50 %0 %9 %51134855
188NC_021426TAAAA51162531162752380 %20 %0 %0 %8 %51134855
189NC_021426TTTTA31163611163751520 %80 %0 %0 %6 %51134855
190NC_021426TAT41163791163911333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51134855
191NC_021426ATTT31168111168211125 %75 %0 %0 %9 %51134855
192NC_021426AAG41179151179261266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51134855
193NC_021426TAA41186231186331166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51134855
194NC_021426TATT31194911195021225 %75 %0 %0 %8 %51134855
195NC_021426T16120415120430160 %100 %0 %0 %6 %51134855
196NC_021426TCACTA31205701205881933.33 %33.33 %0 %33.33 %5 %51134855
197NC_021426TTATT31253631253761420 %80 %0 %0 %7 %51134855
198NC_021426GAAT31271141271241150 %25 %25 %0 %9 %51134855
199NC_021426AAAG31276331276441275 %0 %25 %0 %8 %51134855
200NC_021426CCAA31303841303951250 %0 %0 %50 %8 %51134855
201NC_021426TAA41306851306961266.67 %33.33 %0 %0 %0 %51134855
202NC_021426ATAG31315761315861150 %25 %25 %0 %9 %51134855
203NC_021426TTTG3131799131810120 %75 %25 %0 %8 %51134855
204NC_021426T15131942131956150 %100 %0 %0 %6 %51134855
205NC_021426TAAT31326531326641250 %50 %0 %0 %8 %51134855
206NC_021426CATT31328211328321225 %50 %0 %25 %0 %51134855
207NC_021426ATT41330421330531233.33 %66.67 %0 %0 %8 %51134855
208NC_021426GTAT31332351332461225 %50 %25 %0 %8 %51134855
209NC_021426TACTAG31345771345941833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %51134855
210NC_021426TTCC3136494136504110 %50 %0 %50 %9 %51134855
211NC_021426ATTTT31379111379251520 %80 %0 %0 %6 %51134855
212NC_021426CTTA31385511385611125 %50 %0 %25 %9 %51134855
213NC_021426CCTT3142608142618110 %50 %0 %50 %9 %51134855
214NC_021426GGAT31431521431631225 %25 %50 %0 %8 %51134855
215NC_021426ACCGG31514361514501520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
216NC_021426CTCCTT3153342153359180 %50 %0 %50 %5 %51134859
217NC_021426ATCA31550351550471350 %25 %0 %25 %7 %51134859
218NC_021426TGAT31551301551421325 %50 %25 %0 %7 %51134859
219NC_021426ATC41567211567321233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51134859
220NC_021426AAAG31568771568871175 %0 %25 %0 %9 %51134859
221NC_021426ATTT31579461579571225 %75 %0 %0 %8 %51134859
222NC_021426ATC41598271598371133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
223NC_021426GAA51616711616851566.67 %0 %33.33 %0 %6 %51134859
224NC_021426A1816179616181318100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
225NC_021426ATTG31631951632051125 %50 %25 %0 %9 %51134859
226NC_021426TCTT3163322163333120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
227NC_021426AACT31634971635071150 %25 %0 %25 %9 %51134859
228NC_021426GA71636811636941450 %0 %50 %0 %7 %51134859
229NC_021426A1416381216382514100 %0 %0 %0 %7 %51134859
230NC_021426ATTC31640171640281225 %50 %0 %25 %8 %51134859
231NC_021426A1316492316493513100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
232NC_021426ATAA41654021654171675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding