ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

All Perfect Repeats of Trochodendron aralioides chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_021426	A	17	214	230	17	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
2	NC_021426	TGAA	3	1771	1782	12	50 %	25 %	25 %	0 %	Non-Coding
3	NC_021426	AATAA	3	4899	4913	15	80 %	20 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_021426	AT	6	4921	4932	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
5	NC_021426	AT	6	4941	4952	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
6	NC_021426	TAA	4	4968	4979	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_021426	AT	6	4980	4991	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
8	NC_021426	AT	6	4994	5005	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_021426	TAA	6	5011	5028	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_021426	AAT	4	5029	5040	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_021426	AT	6	5039	5050	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_021426	TAA	4	5067	5078	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_021426	AT	6	5079	5090	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_021426	AT	6	5093	5104	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_021426	AT	6	5137	5148	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_021426	AT	6	5177	5188	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_021426	AT	6	5191	5202	12	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_021426	TAA	6	5209	5226	18	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
19	NC_021426	ATA	4	5266	5277	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_021426	A	17	9295	9311	17	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_021426	A	12	10411	10422	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_021426	TTC	4	31593	31604	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
23	NC_021426	ATA	4	34576	34587	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_021426	ATA	4	34663	34674	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_021426	T	13	40366	40378	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_021426	TTTCT	3	45639	45653	15	0 %	80 %	0 %	20 %	Non-Coding
27	NC_021426	A	15	46180	46194	15	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
28	NC_021426	TAAA	3	48040	48051	12	75 %	25 %	0 %	0 %	51134853
29	NC_021426	A	12	48049	48060	12	100 %	0 %	0 %	0 %	51134853
30	NC_021426	A	12	48313	48324	12	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
31	NC_021426	T	15	48880	48894	15	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
32	NC_021426	T	12	50262	50273	12	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
33	NC_021426	AGTT	3	53039	53050	12	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_021426	ATA	4	59544	59555	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51134853
35	NC_021426	ATCTA	3	68769	68783	15	40 %	40 %	0 %	20 %	Non-Coding
36	NC_021426	AAAG	3	70527	70538	12	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
37	NC_021426	TTA	4	72845	72856	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_021426	TTC	4	72933	72944	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
39	NC_021426	AT	9	73266	73283	18	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_021426	A	16	73768	73783	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_021426	T	13	73805	73817	13	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_021426	A	16	75717	75732	16	100 %	0 %	0 %	0 %	51134851
43	NC_021426	T	14	76887	76900	14	0 %	100 %	0 %	0 %	51134851
44	NC_021426	A	17	83290	83306	17	100 %	0 %	0 %	0 %	51134851
45	NC_021426	TTTA	3	85997	86008	12	25 %	75 %	0 %	0 %	51134851
46	NC_021426	T	13	86476	86488	13	0 %	100 %	0 %	0 %	51134851
47	NC_021426	T	16	89600	89615	16	0 %	100 %	0 %	0 %	51134851
48	NC_021426	TAA	4	130685	130696	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	51134855
49	NC_021426	CATT	3	132821	132832	12	25 %	50 %	0 %	25 %	51134855
50	NC_021426	A	16	161796	161811	16	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
51	NC_021426	A	13	164923	164935	13	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_021426	ATAA	3	165402	165413	12	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

All Perfect Repeats of Trochodendron aralioides chloroplast