ChloroMitoSSRDB 2.0 - Database of Microsatellites from Chloroplast & Mitochondrial Genomes

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetracentron sinense chloroplast

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Start	End	Tract Length	A%	T%	G%	C%	Imperfection %	Protein ID
1	NC_021425	CAG	4	1124	1135	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51134841
2	NC_021425	GAA	4	2224	2235	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134841
3	NC_021425	CTA	4	15455	15465	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
4	NC_021425	TGT	4	17594	17604	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	51134842
5	NC_021425	GTT	4	24508	24519	12	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	8 %	51134842
6	NC_021425	ATA	9	28950	28976	27	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
7	NC_021425	ACT	4	29322	29333	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
8	NC_021425	TAT	4	31032	31043	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
9	NC_021425	ATT	4	33423	33434	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
10	NC_021425	ATA	5	33473	33488	16	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	6 %	Non-Coding
11	NC_021425	ATA	4	33531	33544	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
12	NC_021425	AAT	4	33545	33558	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	Non-Coding
13	NC_021425	GTA	4	34382	34392	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
14	NC_021425	AAT	7	38892	38913	22	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
15	NC_021425	ATG	4	41285	41295	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51134843
16	NC_021425	GCA	4	43183	43194	12	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	8 %	51134843
17	NC_021425	ATA	4	46269	46280	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	8 %	51134843
18	NC_021425	GTA	4	47269	47279	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
19	NC_021425	ATA	4	50082	50092	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
20	NC_021425	ATA	5	58375	58388	14	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	7 %	51134844
21	NC_021425	TTG	4	60783	60793	11	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
22	NC_021425	CTA	4	68526	68537	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
23	NC_021425	TTA	4	70059	70070	12	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	8 %	Non-Coding
24	NC_021425	CCT	4	70762	70773	12	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	8 %	Non-Coding
25	NC_021425	TTA	7	71933	71954	22	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	9 %	Non-Coding
26	NC_021425	TCT	4	72025	72036	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	Non-Coding
27	NC_021425	AGA	4	72912	72922	11	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	9 %	Non-Coding
28	NC_021425	GGA	4	84441	84453	13	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	7 %	51134841
29	NC_021425	TTC	4	88120	88131	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134841
30	NC_021425	CTT	4	88593	88604	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134841
31	NC_021425	GAT	4	90436	90446	11	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	9 %	51134841
32	NC_021425	GAT	4	93541	93552	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51134841
33	NC_021425	TGA	4	95277	95288	12	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	8 %	51134841
34	NC_021425	TTC	4	103252	103263	12	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	8 %	51134846
35	NC_021425	ATT	4	115861	115873	13	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	7 %	51134846
36	NC_021425	AAG	4	116509	116520	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134846
37	NC_021425	TAA	4	117217	117227	11	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	9 %	51134846
38	NC_021425	CTT	4	120695	120705	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51134846
39	NC_021425	TAA	4	129273	129284	12	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	0 %	51134846
40	NC_021425	CTT	4	131973	131983	11	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	9 %	51134846
41	NC_021425	GAA	4	145671	145682	12	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	8 %	51134846
42	NC_021425	ATC	4	155382	155393	12	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	8 %	51134849
43	NC_021425	ATC	4	158488	158498	11	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	9 %	Non-Coding
44	NC_021425	GAA	5	160329	160343	15	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	6 %	51134850

ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Tri-nucleotide Imperfect Repeats of Tetracentron sinense chloroplast