ChloroMitoSSRDB 2.00 Webserver cum Database of Cholorplast and Mitochondrial Microsatellites

Back To Genome Repeat Summary

All Imperfect Repeats of Tetracentron sinense chloroplast

Click on Table Heading To Sort Results Accordingly
S.No.Genome IDMotifIterationsStartEndTract LengthA%T%G%C% Imperfection %Protein ID
1NC_021425CT67888110 %50 %0 %50 %9 %Non-Coding
2NC_021425A1221722812100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
3NC_021425CAG4112411351233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51134841
4NC_021425AAGT3123012401150 %25 %25 %0 %9 %51134841
5NC_021425AT6173417471450 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
6NC_021425A132085209713100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
7NC_021425GAA4222422351266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51134841
8NC_021425AT8486248771650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
9NC_021425AATA3513151411175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
10NC_021425AAGA3520452141175 %0 %25 %0 %9 %Non-Coding
11NC_021425T1452665279140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
12NC_021425GTTT354195430120 %75 %25 %0 %8 %51134842
13NC_021425TCTCT354615474140 %60 %0 %40 %7 %51134842
14NC_021425AGAT3669667071250 %25 %25 %0 %0 %Non-Coding
15NC_021425TTAT3677267831225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
16NC_021425TATT3739974091125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
17NC_021425TTCT384928502110 %75 %0 %25 %9 %51134842
18NC_021425TTCTAT3936993871916.67 %66.67 %0 %16.67 %5 %Non-Coding
19NC_021425A149611962414100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
20NC_021425ATCT310416104271225 %50 %0 %25 %0 %Non-Coding
21NC_021425AT712996130091450 %50 %0 %0 %7 %51134842
22NC_021425T131314413156130 %100 %0 %0 %7 %51134842
23NC_021425CTTT31383513845110 %75 %0 %25 %9 %Non-Coding
24NC_021425ATTT313864138751225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
25NC_021425T131390213914130 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
26NC_021425AAAT314476144871275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
27NC_021425TTTC31470514716120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
28NC_021425TATTCA314916149341933.33 %50 %0 %16.67 %10 %Non-Coding
29NC_021425CTA415455154651133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
30NC_021425A12172661727712100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
31NC_021425TGT41759417604110 %66.67 %33.33 %0 %9 %51134842
32NC_021425AT618377183881250 %50 %0 %0 %8 %51134842
33NC_021425ATAAAG323466234821766.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %51134842
34NC_021425TTCA323570235811225 %50 %0 %25 %8 %51134842
35NC_021425GAAT323661236711150 %25 %25 %0 %9 %51134842
36NC_021425GTT42450824519120 %66.67 %33.33 %0 %8 %51134842
37NC_021425TCAT327814278241125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
38NC_021425CTAT328317283281225 %50 %0 %25 %8 %Non-Coding
39NC_021425ATA928950289762766.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
40NC_021425ACT429322293331233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
41NC_021425TA630742307521150 %50 %0 %0 %9 %Non-Coding
42NC_021425TAT431032310431233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
43NC_021425CAACA331058310721560 %0 %0 %40 %6 %Non-Coding
44NC_021425TGGAA332366323791440 %20 %40 %0 %7 %Non-Coding
45NC_021425GAAA432414324281575 %0 %25 %0 %6 %Non-Coding
46NC_021425TCTTT33281032823140 %80 %0 %20 %7 %Non-Coding
47NC_021425ATT433423334341233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
48NC_021425ATA533473334881666.67 %33.33 %0 %0 %6 %Non-Coding
49NC_021425ATA433531335441466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
50NC_021425AAT433545335581466.67 %33.33 %0 %0 %7 %Non-Coding
51NC_021425TTCA433654336691625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
52NC_021425TTCA433698337131625 %50 %0 %25 %6 %Non-Coding
53NC_021425TTTC33378433795120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
54NC_021425TA934111341271750 %50 %0 %0 %5 %Non-Coding
55NC_021425GTA434382343921133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
56NC_021425TTCA334506345161125 %50 %0 %25 %9 %Non-Coding
57NC_021425AT634918349291250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
58NC_021425GAAA336856368671275 %0 %25 %0 %8 %51134843
59NC_021425GCTT33725937269110 %50 %25 %25 %9 %51134843
60NC_021425AG638064380741150 %0 %50 %0 %9 %Non-Coding
61NC_021425A15388423885615100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
62NC_021425AAT738892389132266.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
63NC_021425AT738967389791350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
64NC_021425GTAAT339104391171440 %40 %20 %0 %7 %Non-Coding
65NC_021425A12392203923112100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
66NC_021425A22398893991022100 %0 %0 %0 %9 %Non-Coding
67NC_021425ATG441285412951133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51134843
68NC_021425AATG342778427891250 %25 %25 %0 %8 %51134843
69NC_021425GCA443183431941233.33 %0 %33.33 %33.33 %8 %51134843
70NC_021425ATA446269462801266.67 %33.33 %0 %0 %8 %51134843
71NC_021425TAAA746875469022875 %25 %0 %0 %7 %51134843
72NC_021425A13471474715913100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
73NC_021425GTA447269472791133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
74NC_021425T174777947795170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
75NC_021425GAAT349081490931350 %25 %25 %0 %7 %Non-Coding
76NC_021425TA749132491471650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
77NC_021425TTAG349514495241125 %50 %25 %0 %9 %Non-Coding
78NC_021425A14499774999014100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
79NC_021425AATT349993500041250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
80NC_021425ATA450082500921166.67 %33.33 %0 %0 %9 %Non-Coding
81NC_021425A17503325034817100 %0 %0 %0 %5 %Non-Coding
82NC_021425TTGA350676506881325 %50 %25 %0 %7 %Non-Coding
83NC_021425AGTT351929519401225 %50 %25 %0 %0 %Non-Coding
84NC_021425ATTT354331543421225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
85NC_021425T135446854480130 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
86NC_021425GACC355244552551225 %0 %25 %50 %8 %Non-Coding
87NC_021425ACAA455264552781575 %0 %0 %25 %6 %Non-Coding
88NC_021425T175530755323170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
89NC_021425ATTTT356347563611520 %80 %0 %0 %0 %Non-Coding
90NC_021425ATA558375583881466.67 %33.33 %0 %0 %7 %51134844
91NC_021425TTTA358856588661125 %75 %0 %0 %9 %Non-Coding
92NC_021425AT860686607011650 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
93NC_021425AT660708607191250 %50 %0 %0 %8 %Non-Coding
94NC_021425TTG46078360793110 %66.67 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
95NC_021425A16651576517216100 %0 %0 %0 %6 %Non-Coding
96NC_021425TATTG367465674791520 %60 %20 %0 %0 %Non-Coding
97NC_021425T146770667719140 %100 %0 %0 %7 %Non-Coding
98NC_021425T176781067826170 %100 %0 %0 %5 %Non-Coding
99NC_021425ATTTA468090681081940 %60 %0 %0 %5 %Non-Coding
100NC_021425CTA468526685371233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
101NC_021425ACAGTA369564695821950 %16.67 %16.67 %16.67 %5 %Non-Coding
102NC_021425TTA470059700701233.33 %66.67 %0 %0 %8 %Non-Coding
103NC_021425CCT47076270773120 %33.33 %0 %66.67 %8 %Non-Coding
104NC_021425CTTT47171171725150 %75 %0 %25 %6 %Non-Coding
105NC_021425T127172371734120 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
106NC_021425AATT371802718141350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
107NC_021425TTA771933719542233.33 %66.67 %0 %0 %9 %Non-Coding
108NC_021425ATTG471959719731525 %50 %25 %0 %6 %Non-Coding
109NC_021425TCT47202572036120 %66.67 %0 %33.33 %8 %Non-Coding
110NC_021425AT772339723511350 %50 %0 %0 %7 %Non-Coding
111NC_021425AT872356723701550 %50 %0 %0 %6 %Non-Coding
112NC_021425TAAA372384723951275 %25 %0 %0 %8 %Non-Coding
113NC_021425A25728867291025100 %0 %0 %0 %8 %Non-Coding
114NC_021425AGA472912729221166.67 %0 %33.33 %0 %9 %Non-Coding
115NC_021425T147292672939140 %100 %0 %0 %0 %Non-Coding
116NC_021425ATTT373573735841225 %75 %0 %0 %8 %Non-Coding
117NC_021425AAAT373607736171175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
118NC_021425TAAA373679736891175 %25 %0 %0 %9 %Non-Coding
119NC_021425A25748357485925100 %0 %0 %0 %8 %51134841
120NC_021425TTTA375042750531225 %75 %0 %0 %8 %51134841
121NC_021425TCTTTT37511775134180 %83.33 %0 %16.67 %5 %51134841
122NC_021425TTTC37538875398110 %75 %0 %25 %9 %51134841
123NC_021425A14757977581014100 %0 %0 %0 %7 %51134841
124NC_021425A15808738088715100 %0 %0 %0 %6 %51134841
125NC_021425GT68219582205110 %50 %50 %0 %9 %51134841
126NC_021425A15823028231615100 %0 %0 %0 %6 %51134841
127NC_021425TTTCTT38255382571190 %83.33 %0 %16.67 %10 %51134841
128NC_021425GGA484441844531333.33 %0 %66.67 %0 %7 %51134841
129NC_021425TCCTT38471984734160 %60 %0 %40 %6 %51134841
130NC_021425T168498384998160 %100 %0 %0 %6 %51134841
131NC_021425T128547185482120 %100 %0 %0 %0 %51134841
132NC_021425GAAT386266862771250 %25 %25 %0 %8 %51134841
133NC_021425T148647386486140 %100 %0 %0 %7 %51134841
134NC_021425CAAT387092871021150 %25 %0 %25 %9 %51134841
135NC_021425TTC48812088131120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51134841
136NC_021425T168849288507160 %100 %0 %0 %6 %51134841
137NC_021425CTT48859388604120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51134841
138NC_021425GAT490436904461133.33 %33.33 %33.33 %0 %9 %51134841
139NC_021425TTCT39219092200110 %75 %0 %25 %9 %51134841
140NC_021425CTTT39338693396110 %75 %0 %25 %9 %51134841
141NC_021425GAT493541935521233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51134841
142NC_021425TGAT395226952381325 %50 %25 %0 %7 %51134841
143NC_021425TGA495277952881233.33 %33.33 %33.33 %0 %8 %51134841
144NC_021425AATA396109961211375 %25 %0 %0 %7 %51134841
145NC_021425GAAGGA396895969121850 %0 %50 %0 %5 %51134841
146NC_021425TCCGG39883098844150 %20 %40 %40 %6 %51134841
147NC_021425TTTGTT3101851101869190 %83.33 %16.67 %0 %10 %51134841
148NC_021425TTC4103252103263120 %66.67 %0 %33.33 %8 %51134846
149NC_021425ATCC31071071071181225 %25 %0 %50 %8 %51134846
150NC_021425TCTA31075081075191225 %50 %0 %25 %8 %51134846
151NC_021425AAGG31076521076621150 %0 %50 %0 %9 %51134846
152NC_021425GAGG31103811103921225 %0 %75 %0 %8 %51134846
153NC_021425AGGT31105921106031225 %25 %50 %0 %8 %51134846
154NC_021425TAAG31117121117221150 %25 %25 %0 %9 %51134846
155NC_021425GGAA31137641137741150 %0 %50 %0 %9 %51134846
156NC_021425TA71147411147531350 %50 %0 %0 %7 %51134846
157NC_021425TA71147581147711450 %50 %0 %0 %7 %51134846
158NC_021425AT71148221148351450 %50 %0 %0 %7 %51134846
159NC_021425AAAAT31149261149391480 %20 %0 %0 %7 %51134846
160NC_021425TAAA31149711149811175 %25 %0 %0 %9 %51134846
161NC_021425ATAGAA31149941150121966.67 %16.67 %16.67 %0 %5 %51134846
162NC_021425ATTT31154051154151125 %75 %0 %0 %9 %51134846
163NC_021425ATT41158611158731333.33 %66.67 %0 %0 %7 %51134846
164NC_021425AAG41165091165201266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51134846
165NC_021425TAA41172171172271166.67 %33.33 %0 %0 %9 %51134846
166NC_021425T13117373117385130 %100 %0 %0 %7 %51134846
167NC_021425TTAA31179901180011250 %50 %0 %0 %8 %51134846
168NC_021425TATT31180591180701225 %75 %0 %0 %8 %51134846
169NC_021425TTCT3118123118134120 %75 %0 %25 %8 %51134846
170NC_021425T12118300118311120 %100 %0 %0 %8 %51134846
171NC_021425ACAA31186641186751275 %0 %0 %25 %8 %51134846
172NC_021425T15118884118898150 %100 %0 %0 %6 %51134846
173NC_021425A1511889911891315100 %0 %0 %0 %6 %51134846
174NC_021425T14119027119040140 %100 %0 %0 %7 %51134846
175NC_021425TA71191741191861350 %50 %0 %0 %7 %51134846
176NC_021425TTGA31198211198321225 %50 %25 %0 %8 %51134846
177NC_021425CTT4120695120705110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51134846
178NC_021425GAAT31256811256911150 %25 %25 %0 %9 %51134846
179NC_021425TTAA31262421262521150 %50 %0 %0 %9 %51134846
180NC_021425AATC31268491268601250 %25 %0 %25 %8 %51134846
181NC_021425AGCC31290201290301125 %0 %25 %50 %9 %51134846
182NC_021425CTTTT3129233129246140 %80 %0 %20 %7 %51134846
183NC_021425TAA41292731292841266.67 %33.33 %0 %0 %0 %51134846
184NC_021425TTGGAT31294111294281816.67 %50 %33.33 %0 %5 %51134846
185NC_021425ATAG31302361302461150 %25 %25 %0 %9 %51134846
186NC_021425TTTG3130471130482120 %75 %25 %0 %8 %51134846
187NC_021425TAAT31313311313421250 %50 %0 %0 %8 %51134846
188NC_021425GTAT31319071319181225 %50 %25 %0 %8 %51134846
189NC_021425CTT4131973131983110 %66.67 %0 %33.33 %9 %51134846
190NC_021425TACTAG31332491332661833.33 %33.33 %16.67 %16.67 %5 %51134846
191NC_021425TTCC3135160135170110 %50 %0 %50 %9 %51134846
192NC_021425ATTT31365741365851225 %75 %0 %0 %8 %51134846
193NC_021425CTTA31372121372221125 %50 %0 %25 %9 %51134846
194NC_021425CCTT3141272141282110 %50 %0 %50 %9 %51134846
195NC_021425GGAT31418161418271225 %25 %50 %0 %8 %51134846
196NC_021425ACTAAT31450931451091750 %33.33 %0 %16.67 %5 %51134846
197NC_021425AAAT31456531456641275 %25 %0 %0 %8 %51134846
198NC_021425GAA41456711456821266.67 %0 %33.33 %0 %8 %51134846
199NC_021425ACCGG31500891501031520 %0 %40 %40 %6 %Non-Coding
200NC_021425CTCCTT3152021152038180 %50 %0 %50 %5 %51134849
201NC_021425ATCA31536961537081350 %25 %0 %25 %7 %51134849
202NC_021425TGAT31537911538031325 %50 %25 %0 %7 %51134849
203NC_021425ATC41553821553931233.33 %33.33 %0 %33.33 %8 %51134849
204NC_021425AAAG31555381555481175 %0 %25 %0 %9 %51134849
205NC_021425ATTT31566071566181225 %75 %0 %0 %8 %51134849
206NC_021425ATC41584881584981133.33 %33.33 %0 %33.33 %9 %Non-Coding
207NC_021425GAA51603291603431566.67 %0 %33.33 %0 %6 %51134850
208NC_021425A1316043216044413100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding
209NC_021425ATTG31618321618421125 %50 %25 %0 %9 %51134850
210NC_021425TCTT3161959161970120 %75 %0 %25 %8 %Non-Coding
211NC_021425AACT31621341621441150 %25 %0 %25 %9 %51134850
212NC_021425GA71623191623321450 %0 %50 %0 %7 %51134850
213NC_021425A1616245016246516100 %0 %0 %0 %6 %51134850
214NC_021425ATTC31626571626681225 %50 %0 %25 %8 %51134850
215NC_021425A1216345216346312100 %0 %0 %0 %0 %Non-Coding
216NC_021425ATAA41639301639451675 %25 %0 %0 %6 %Non-Coding
217NC_021425A1416394016395314100 %0 %0 %0 %7 %Non-Coding